Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0004100
Sequence Length
689 nt
GC Content
0.3919
GAUGAUGUACUGGACUGUUGUUGGGGAUCAUUCCCAUAUAGAAGAAGCAGCCAUGGAUGGUACACUGAGAAGGAUUUUAGUACAAAAGAACUUACAGAGACCCACAGGUUUGGCUGUGGAUUAUUUUAGUGAACGCAUAUAUUGGGCUGACUUUGAGCUCUCCAUCAUUGGCAGUGUUCUGUAUGAUGGCUCUAAUUCAGUAGUCUCUGUCAGCAGCAAACAAGGUUUAUUACAUCCACAUAGGAUCGAUAUCUUUGAAGAUUAUAUAUAUGGAGCAGGACCUAAAAAUGGUGUAUUUCGAGUUCAAAAAUUUGGCCAUGGUUCAGUAGAGUACUUAGCUUUAAAUAUUGAUAAAACAAAAGGUGUUUUGAUAUCUCAUCGUUAUAAACAACUAGAUUUACCCAAUCCAUGCUUGGAUUUAGCAUGCGAAUUUCUUUGCUUGCUAAAUCCUUCUGGGGCCACUUGUGUGUGUCCAGAAGGAAAAUAUUUGAUUAAUGGCACCUGCAAUGAUGACAGCCUGUUAGAUGAUUCAUGUAAGUUAACUUGUGAAAAUGGAGGAAGAUGCAUUUUAAAUGAGAAAGGUGAUUUGAGGUGUCACUGUUGGCCCAGUUAUUCAGGAGAAAGAUGUGAAGUCAACCACUGUAGCAACUACUGCCAGAAUGGAGGAACUUGCGUACCAUCAGUUCUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-177.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -191.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 118.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........((((((((((((..((((....))))..)))......)))).....(((((((((((((((....))))))).......((((((((((...((((((......))))))..(((((((.(((((.(((......((((((.(((((((((..((((((..((((....))))))))))((((((.....((((((((((....)))....(((((..((((..((((.....)))).)))).))))).))))))).....)))))).(.(((.......))).).....)))))))))...)))))))))))))).)))))))................((((...(((((....))))).))))((((((((......)))............(((((....)))))((((((.(((((....))))).)))))).((((((((((..(((....)))..))))))))))...........((((((...(((((....)).))).))))))))))).)).))))))))..(((.(((((((.(.((..((((((((((((((.(......).)))))))))))....)))..))).))).)))).)))......((((..((..(((((((((......))).)))..)))..))..))))))))))))...)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.........(((({(((((((,,((((....))))..}},......})))},...(((((((((((((((....))))))).......(((((((({{{..((((((......))))))..(((((((.(((((.(((......((((((.(((((((((..((((((..((((....))))))))))((((((.....((((((({((....}})....(((((..((((..((((.....)))).)))).))))).))))))).....)))))).{.(((.......))).}.....)))))))))...)))))))))))))).))))))).......,{{{{{{{{{,{{,{,({..,..||)))}},|}}|,,,,,{{{...,,,,,,..,........,(((((....)))))|(((((.(((((....})))).)))))}.((((((((((,,(((....))).,)))))))))).,,}}}}}}|,{{,{(({,.{{{({....}).))).}})))),,,,.,)).))))))))..(((.(((({{(,(.({.,({((((((((((((.(......).)))))))))))...,}))..))),,}}.)))).)))......((,({{((..(((((({,({,....}))}}))..)))..)},})))))))))))),,.))}))
Back