Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP1B_0005600

Sequence Length

300 nt

GC Content

0.3567

GUUUAUUACAUCCACAUAGGAUCGAUAUCUUUGAAGAUUAUAUAUAUGGAGCAGGACCUAAAAAUGGUGUAUUUCGAGUUCAAAAAUUUGGCCAUGGUUCAGUAGAGUACUUAGCUUUAAAUAUUGAUAAAACAAAAGGUGUUUUGAUAUCUCAUCGUUAUAAACAACUAGAUUUACCCAAUCCAUGCUUGGAUUUAGCAUGCGAAUUUCUUUGCUUGCUAAAUCCUUCUGGGGCCACUUGUGUGUGUCCAGAAGGAAAAUAUUUGAUUAAUGGCACCUGCAAUGAUGACAGCCUGUUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-68.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -75.01

Frequency: 0.0000

Diversity: 59.41

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((..((((.(((.((((............))))...))).))))((((((((.......)))......((((((....))))))(((((...((((((((((.....))))))......((((...(((((....))))).)))).....(((......)))............(((((....)))))((((((.(((((....))))).)))))).((((((((((..(((....)))..))))))))))......))))...))))).)))))..))))))..))((...))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((({..((((.(((.{(((...,....,...)))}.,,),,.))))((((((((.......)))......((((((....))))))(((((...((({((((((.....)))))}..,,,,{,,{,{,({..,..||})}}|,|}},,....|{|...,,,,,,..,,.......,(((((....)))))|(((((.(((((....))))).)))))}.((((((((((,,(((....))).,))))))))))......})))...))))).)))))..}))))}.,))((...))