Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0007500
Sequence Length
2691 nt
GC Content
0.4173
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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-718.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -775.99
Frequency: 0.0000
Diversity: 659.10
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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