Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0007800
Sequence Length
2332 nt
GC Content
0.4155
ACUCUACUGGGCCGAUGAAAAUCACAUUGAAUUUAGCAACAUGGAUGGAUCUCAUAGACACAAAGUCCCUAAUCAAGAUAUUCCAGGGGUGAUUGCACUAACAUUGUUUGAAGACUACAUCUACUGGACUGAUGGGAAAACCAAGUCACUCAGCCGUGCCCAUAAAACAUCGGGAGCAGACAGACUCUCACUGAUUUACUCAUGGCAUGCCAUCACAGAUAUCCAGGUGUAUCAUUCUUAUAGACAACCUGAUGUCUCCAAACAUCUCUGCAUGAUAAAUAAUGGUGGUUGCAGUCAUUUGUGCCUUUUAGCCCCUGGAAAAACCCACACUUGUGCAUGUCCCACUAACUUCUAUCUGGCAGCUGAUAAUAGGACUUGCUUAUCCAACUGCACAGCCAGCCAGUUUCGUUGCAAAACUGACAAAUGUAUUCCAUUCUGGUGGAAAUGUGACACCGUGGAUGACUGUGGUGAUGGAUCUGAUGAACCUGAUGACUGUCCUGAAUUUAGAUGUCAGCCAGGCCGAUUUCAGUGUGGGACUGGACUCUGUGCUCUACCAGCUUUCAUCUGUGAUGGAGAGAAUGAUUGUGGAGACAAUUCUGAUGAACUCAACUGUGACACACAUGUCUGCCUGUCAGGUCAAUUCAAAUGUACCAAGAACCAGAAAUGUAUCCCAGUAAACUUAAGAUGUAAUGGGCAAGAUGACUGUGGUGAUGAGGAAGAUGAAAGAGACUGUCCUGAAAACAGCUGUUCUCCAGACUAUUUCCAGUGUAAGACUACGAAGCAUUGCAUUUCCAAGCUGUGGGUUUGUGACGAGGAUCCAGACUGUGCAGAUGCAUCAGACGAGGCCAACUGCGAUAAAAAGACUUGUGGACCUCAUGAAUUCCAGUGUAAAAACAACAACUGUAUUCCCGAUCACUGGCGGUGUGAUAGCCAAAAUGACUGCAGUGAUAAUUCAGAUGAAGAAAACUGUAAGCCACAGACAUGUACAUUGAAAGAUUUCCUCUGUGCCAAUGGGGACUGUGUUUCUUCAAGGUUUUGGUGUGAUGGAGAUUUUGACUGUGCAGAUGGCUCUGAUGAGAGAAAUUGUGAGACAAGUUGUUCCAAAGAUCAGUUCCGGUGUUCCAAUGGUCAGUGUAUACCAGCAAAAUGGAAAUGUGAUGGCCAUGAAGACUGCAAAUAUGGGGAAGAUGAGAAAAGCUGUGAGCCAGCUUCUCCUACUUGCUCAUCACGUGAAUAUAUAUGUGCCAGUGAUGGAUGUAUUUCAGCAUCUUUGAAAUGUAAUGGAGAAUAUGAUUGUGCUGAUGGUUCAGAUGAGAUGGACUGUGUGACUGAAUGUAAGGAAGAUCAGUUUCGGUGCAAAAAUAAAGCCCACUGUAUUCCAAUUAGAUGGCUGUGUGAUGGAAUUCAUGACUGUGUGGAUGGCAGUGAUGAAGAGAACUGUGAAAGAGGAGGAAAUAUAUGUAGAGCUGAUGAGUUCCUUUGCAAUAAUUCUCUCUGCAAACUACAUUUCUGGGUGUGUGAUGGAGAGGACGACUGUGGAGACAACUCUGAUGAAGCCCCUGAUAUGUGUGUCAAAUUUCUUUGUCCAUCCACGAGACCUCACAGAUGCAGAAAUAACAGAAUAUGCCUACAGUCGGAGCAAAUGUGCAAUGGGAUUGAUGAAUGCGGUGACAAUUCAGAUGAAGAUCACUGUGGUGGUAAGCUGACAUAUAAAGCAAGGCCUUGUAAAAAGGAUGAGUUUGCUUGUAGUAAUAAAAAAUGCAUCCCUAUGGAUCUCCAGUGUGAUCGACUUGAUGACUGCGGAGAUGGUUCAGAUGAGCAAGGAUGCAGAAUAGCUCCUACUGAAUAUACCUGUGAAGAUAAUGUGAAUCCAUGUGGAGAUGAUGCAUAUUGUAAUCAAAUAAAAACAUCUGUUUUCUGUCGCUGUAAGCCUGGAUUUCAGAGAAACAUGAAAAACAGACAAUGUGAAGACCUUAAUGAAUGUUUGGUGUUUGGCACAUGUUCCCAUCAAUGUAUAAAUGUGGAAGGAUCAUAUAAAUGUGUGUGUGACCAGAAUUUUCAAGAAAGAAAUAACACCUGCAUAGCAGAAGGCUCUGAAGAUCAAGUUCUCUACAUUGCUAAUGACACUGAUAUCCUGGGUUUUAUAUAUCCAUUCAACUACAGUGGCGAUCAUCAACAAAUUUCUCAUAUUGAACAUAAUUCAAGAAUAACAGGGAUGGAUGUAUAUUAUCAAAGAGAUAUGAUUAUUUGGAGUACUCAGUUUAAUCCAGGCGGAAUUUUCUACAAAAGGAUCCAUGGCAGAGAAAAAAGGCAAGCAAACAGUGGCUUGAUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-604.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -652.36
Frequency: 0.0000
Diversity: 499.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.((((((((((....))).((((...(((..((.((((((((((.((..((((((((.(((((............(((((((((((((((((((..((((((((..(((.....))).(((((((..(((.....)))))))...))).((((((........((((((((.((.....))))).)))))........)))))).......(((((((.((((...((.........))..)))))))))))......(((.......)))))))))))..)).)))))))..............)))))))))).....(((....)))...(((((((..(((...(((.(((.(((((((.((((((....(((((((..((((((.(((.((((......((((...........)))).......)))))))...)))).))...)))))))..((.((.(.((.((....)).))).)).)).))))))........)))))))...))))))...)))))))))).))))).)))).))))..))..)))))))))).))..))))))).(((((((((...(((....)))......((((...))))..((((((((((((((((.(((.....(((((.....(((..((.(..((((....((.......))..))))..).))..)))))))).....)))..)))..........))))).......(((((((((...((((((.(((((((..((....))..)))))))......(((((.((((((.((.((........)))))))))).)).)))..(((((((...((........).)...))).))))..((((..((((((.......)).)))).))))...((((((((((((......)))........((((((.....(((....)))....))))))(((((......((((((....(((((((((((..((((((((((((.......)))))).....)))))).)).)))))))))...))))))..)))))(((((..(((.((((........)))).))).....)))))...((((.(((..(((((((.......(((......)))........)))))))))).)))).....(((((.((((.((((..(((((.....))))))))).).))).))))).(((((......))))))))))))))((((((......))))))..))))))...))))))))).(((((.(((((((.(((((((((..((.((((...((((((............)))))).)))).)).......((((..(((.........)))..))))..((.(((.....))).)).((((.(.((((((((....((((((((.(((..(.(((((((.(((.(((((((((....)))))...))))))).))).)))).).......(((((((.((.(((((((((..((((((....((((....))))...........(((((....))))).......)))))).)))).......))))).)).)))))))..................(((((((...((((((((((((........((((((((((...((((((...(((((....))))).............(((((((.((((.....)))).....)))))))((((..........(((((((......((((((.((((.(((.....))).)).)))))))).((((....))))..))))))).........))))............(((..((((((((.(((.((......))))).))))))))..)))........)))))).....))))))))))...(((..(((((........)))))..)))(((.((((.((((((.(((....))).)).))))..)))))))))))))...)))))).........((.(((((((......))))))))).....((((......))))......((((...))))...)))))))...))))))))))).)))))))).).))))(.(((((((.(((..(((((((((((((.......((((.((.............)))))).(((((.....))))).........)))))))))))))..)))..)).))))).)))))))))).)).))))).)))))))))))))..)))))))))..)).)))).)..)))).((..((((..((.....)).))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((({.{{{{{{({(({...|||.||||,..,{{..{,.{{{{{{{{{{.{{..((((((((.(((((............(((((((((((((((((((,.(((((((({.{{{.....}}}.,,{((((..(((.....)))})))...,,|.((((((........((((((((.((.....))))).))))).......,)))))).......((((((,{((((,,.,,.........,),.)))))))))))......,,........),})))))))).,)),})))))),.............)))))))))).....(((....)))...(((((((..(((...(((.(((.(((((((.((((((..,.{((((((..,{((((,{{,,{(((,,,.,.{{{{.,,,,,.....,}},.,,{|,.}}||||}...}})}.)),,}))))))}}.||,{{.{,((.((....)).))}.)).)).))))))........)))))))...))))))...)))))))))).))))).)))).))))..}}.,|||}|||||}{||{{.....{..(((((((({..,{{{,,..},,.,},..{(((...}))}.,{((((((((((((.((.(((..{(.(.((.,..((((.,.((.(..((((....{{.......})..))))..}.))...}.))))..}..)).).))....}}}..)).))))).......(((((((((...{(((((.{(((({{..{|....}|,,||||||,,.,,{{{(.{{{((({,..,.,,||,||||.}}}||||||,}}),|},,..(((((({.,.|{........}.,...))).))))..((((..((((((.......)),}))).))))...((((((((((((......)))........((((((.....(((....)))....))))))(((((......((((((....((((((((({(..{((((({{{((({,.,,..,}},)).,,,,)))))}.)}.)))))))))...))))))..)))))(((((,.({{.,,(({{...}}}),}}.))),....}))))...((((.(((..(((((((...{{{.(((......)))..,}},..)))))))))).)))).....(((((.(((,.((((..(((((.....))))))))).,.))).))))).(((({......}))))))))))))){(((((......))))))..))))))...))))))))).(((((.(((((((.(((((((((..((.((((...((((((.{..........)))))).)))).)).......((((..(((.........)))..)))).,((,({{,...}))).)).((((.(.((((((((....((((((((.(({.,{,(((((({.(((.(((((((((....})})),,,))))))).)))})))),|,..,,..(((((((.((.(((((((((..((((((..,,{({(,{,.|||},.,,,......{{|{,.,.,)))),....,,.)))))).)))).......))))).)).)))))))..,|,....}},......(((((((...((((((((((((.....,..((((((((((,..((((((...{((((....})}}}..{{{.,{.,,,.{((({{,.((((.....)))).,..,}))))))})}}}........,(((((((,,,,{{((((((.{{((.(((,...,))).)).}})))))}.((((,,..}}}}.,|||,||......))))}),)}},,,....,,,|{,..{{{{{{{{.,|||||,.}}..}}))),)))}}}}}..,}}........))))))..}..))))))))))...(((..(((((........)))))..))),{.{((((,({(((,.{{,....,,}.)),})))..)))))}}))))))...)))))}..,,,,,..((.(((((((......))))))))).....{(((......)))}...,..((((...))))...))))))}...})})))))))).)))))))).).)))){.(((((((.(((..(((((((((((((.......((({.{{...,.........|||,,,.{((({.....))))).........)))))))))))))..)))..)).))))).}))))))))).)).))))).)))))))))))))..))))))))}..),.))))},)})))),|,..,||({{((.....,,.))))}.,,
Back