Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0008100
Sequence Length
1598 nt
GC Content
0.4049
CUGAAAACAGCUGUUCUCCAGACUAUUUCCAGUGUAAGACUACGAAGCAUUGCAUUUCCAAGCUGUGGGUUUGUGACGAGGAUCCAGACUGUGCAGAUGCAUCAGACGAGGCCAACUGCGAUAAAAAGACUUGUGGACCUCAUGAAUUCCAGUGUAAAAACAACAACUGUAUUCCCGAUCACUGGCGGUGUGAUAGCCAAAAUGACUGCAGUGAUAAUUCAGAUGAAGAAAACUGUAAGCCACAGACAUGUACAUUGAAAGAUUUCCUCUGUGCCAAUGGGGACUGUGUUUCUUCAAGGUUUUGGUGUGAUGGAGAUUUUGACUGUGCAGAUGGCUCUGAUGAGAGAAAUUGUGAGACAAGUUGUUCCAAAGAUCAGUUCCGGUGUUCCAAUGGUCAGUGUAUACCAGCAAAAUGGAAAUGUGAUGGCCAUGAAGACUGCAAAUAUGGGGAAGAUGAGAAAAGCUGUGAGCCAGCUUCUCCUACUUGCUCAUCACGUGAAUAUAUAUGUGCCAGUGAUGGAUGUAUUUCAGCAUCUUUGAAAUGUAAUGGAGAAUAUGAUUGUGCUGAUGGUUCAGAUGAGAUGGACUGUGUGACUGAAUGUAAGGAAGAUCAGUUUCGGUGCAAAAAUAAAGCCCACUGUAUUCCAAUUAGAUGGCUGUGUGAUGGAAUUCAUGACUGUGUGGAUGGCAGUGAUGAAGAGAACUGUGAAAGAGGAGGAAAUAUAUGUAGAGCUGAUGAGUUCCUUUGCAAUAAUUCUCUCUGCAAACUACAUUUCUGGGUGUGUGAUGGAGAGGACGACUGUGGAGACAACUCUGAUGAAGCCCCUGAUAUGUGUGUCAAAUUUCUUUGUCCAUCCACGAGACCUCACAGAUGCAGAAAUAACAGAAUAUGCCUACAGUCGGAGCAAAUGUGCAAUGGGAUUGAUGAAUGCGGUGACAAUUCAGAUGAAGAUCACUGUGGUGGUAAGCUGACAUAUAAAGCAAGGCCUUGUAAAAAGGAUGAGUUUGCUUGUAGUAAUAAAAAAUGCAUCCCUAUGGAUCUCCAGUGUGAUCGACUUGAUGACUGCGGAGAUGGUUCAGAUGAGCAAGGAUGCAGAAUAGCUCCUACUGAAUAUACCUGUGAAGAUAAUGUGAAUCCAUGUGGAGAUGAUGCAUAUUGUAAUCAAAUAAAAACAUCUGUUUUCUGUCGCUGUAAGCCUGGAUUUCAGAGAAACAUGAAAAACAGACAAUGUGAAGACCUUAAUGAAUGUUUGGUGUUUGGCACAUGUUCCCAUCAAUGUAUAAAUGUGGAAGGAUCAUAUAAAUGUGUGUGUGACCAGAAUUUUCAAGAAAGAAAUAACACCUGCAUAGCAGAAGGCUCUGAAGAUCAAGUUCUCUACAUUGCUAAUGACACUGAUAUCCUGGGUUUUAUAUAUCCAUUCAACUACAGUGGCGAUCAUCAACAAAUUUCUCAUAUUGAACAUAAUUCAAGAAUAACAGGGAUGGAUGUAUAUUAUCAAAGAGAUAUGAUUAUUUGGAGUACUCAGUUUAAUCCAGGCGGAAUUUUCUACAAAAGGAUCCAUGGCAGAGAAAAAAGGCAAGCAAACAGUGGCUUGAUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-406.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -439.51
Frequency: 0.0000
Diversity: 544.86
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((.(((((.....))).)).))).))).(((((.((((...((.((((.((((...((((((((((((((((.((((..((((.(((((((((.((((..((((((((...(((.............((..(((((((.(((((((.((((.......(.((((((...((.((((((((((((......)))........((((((.....(((....)))....))))))(((((......((((((....(((((((((((..((((((((((((.......)))))).....)))))).)).)))))))))...))))))..)))))(((((..(((.((((........)))).))).....)))))...((((.(((..(((((((.......(((......)))........)))))))))).)))).....(((((.((((.((((..(((((.....))))))))).).))).))))).(((((......)))))))))))))))).((((((((.((((((.(((.((.((((((((((..(((((.(.((....((((((.(.(.((.....)).).)))))))...)).).)))))..)))((.((.........)))).......))).)))).))(((((((.((((((.(((((.(((((.......))))).)))))..........(((((((..((.((((((((((.(((...(((((.(((((((.(..((((((((....((.(((((....)))))))...))))))))..).)))))))..)))))......)))..)).)))))))).))...))))))).))))))))).)).))))).)))))).))))).))).........)))))).).........)))).))))))).))))..(((((((...(((....)))..)))))))...)))..))...........))).))))))))......)))).))))))..((((..........(((((((......((((((.((((.(((.....))).)).)))))))).((((....))))..))))))).........))))............(((..((((((((.(((.((......))))).))))))))..))).......)))))))..))))))))).....(((((((((((((((..((((............)))).....((((.....((((..((((((...(((((..................)))))...((.(((((((......))))))))).....((((......)))).)))))).)))).....))))))))))((((..(((.(((((.......(((((...(.(((((((.(((..(((((((((((((.......((((.((.............)))))).(((((.....))))).........)))))))))))))..)))..)).))))).))))))))))).)))..)))))))))))))(((....)))......)))))))))))...))))....)))))).....))))))).)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(({.(((((.....))).}}.})}.})).{((((.((((...((.((((.{(((...((((((((((({({,,{((({{{({{{{(((((,,,,}||,|}}.,(((((({..,{(........}.,..,))).))}|{{((((,{(((({{.....,.||,|}}|,||||{{.{(((((((((((......)))........((((((.....(((....)))....)))))}{((((......((((((.,..((((((((({(..{(((({{{{{(({{.{{..|||,)).||||)))))}.}}.))))))))).,.)))))),.))))|(({((.,(({.,.((({...|||}|||,}}||....}}}}}.,.((((.(((..(((((((...{{{.(((......)))..,}}...)))))))))).)))).....(((((.(((,.((((..(((((.....))))))))).,.))).))))).(((({......})))))))))))))||{{{(,,,.,,||||||.,||||||,,.||},}}}}||..{{{{{((((,{{{|||}......||,||||...((((((.{..........)))))).))))})),..||,.{{{{,|{{{,,,,,,...|}},,}}}|,|||,||}}}}|||||.,{,(({{.{.{{|||||{,|,,{((((({(,({,.{{{((((({,.(((.((((((({{.,..}}}))}}})})}))).)))})))),|,..,,,,{({{{{{,||,|||{{||{|,.|||{{|,}||{{{{|||,}}}}.,|.|,|,..,|||||,,,,})))}...,}},}}}))),)))),,,,.,,)))}).)),)))))))..|}}....},},,.,,,{{|{{{{...|{||||{||{{{,,...|..{((((((({{.,,({{{{|,,.|||||,,,|))})}..|||,,|,|,,.,{||{,|,{{{{,,...}}}),},.,}))))}}||}},........,(((((((,,,,,,((((((.{{((.(((,...,))).)).}})))))}.((((,,..}}}}.,|||,||,.....))))}),)}},,,....,,,|{,..{{{{{{{{.||||||..}}..}}))),)))}})}}..,}}........))))))..},,)))))))))}.,|(((,,(((((........))))}..}}}{{,{((((,({(((,.{{,....,}}.))}}))}..)))))}}}}||||...}}},,,.,}},}}..((.(((((((......))))))))).....{(((......)))}...,..((((...))))...})))))}...|}}})}))))}.))))))}}.}.}))}{.(((((((.(((..(((((((((((((.......{(({.{{...,.........|||,,,.{((({.....))))).........)))))))))))))..)))..)).))))).},,.}|||||,,,,},.,,..,,)))))},|||.,,,}}}.,,...}))))))))))...))},....))))))...,.))))))).},.
Back