Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP1B_0008500

Sequence Length

2225 nt

GC Content

0.4202

AUAUUUGUAUUGGAUUGACUGCUGCGAGUAUCCUCAUAUUGGCCGUGUUGGAAUGGAUGGAACCAAUCAGAGUGUUGUCAUAGAAACCAAGAUUUCUAGACCUAUGGCACUAACAAUAGAUUAUGUUAAUCGUAGACUCUACUGGGCCGAUGAAAAUCACAUUGAAUUUAGCAACAUGGAUGGAUCUCAUAGACACAAAGUCCCUAAUCAAGAUAUUCCAGGGGUGAUUGCACUAACAUUGUUUGAAGACUACAUCUACUGGACUGAUGGGAAAACCAAGUCACUCAGCCGUGCCCAUAAAACAUCGGGAGCAGACAGACUCUCACUGAUUUACUCAUGGCAUGCCAUCACAGAUAUCCAGGUGUAUCAUUCUUAUAGACAACCUGAUGUCUCCAAACAUCUCUGCAUGAUAAAUAAUGGUGGUUGCAGUCAUUUGUGCCUUUUAGCCCCUGGAAAAACCCACACUUGUGCAUGUCCCACUAACUUCUAUCUGGCAGCUGAUAAUAGGACUUGCUUAUCCAACUGCACAGCCAGCCAGUUUCGUUGCAAAACUGACAAAUGUAUUCCAUUCUGGUGGAAAUGUGACACCGUGGAUGACUGUGGUGAUGGAUCUGAUGAACCUGAUGACUGUCCUGAAUUUAGAUGUCAGCCAGGCCGAUUUCAGUGUGGGACUGGACUCUGUGCUCUACCAGCUUUCAUCUGUGAUGGAGAGAAUGAUUGUGGAGACAAUUCUGAUGAACUCAACUGUGACACACAUGUCUGCCUGUCAGGUCAAUUCAAAUGUACCAAGAACCAGAAAUGUAUCCCAGUAAACUUAAGAUGUAAUGGGCAAGAUGACUGUGGUGAUGAGGAAGAUGAAAGAGACUGUCCUGAAAACAGCUGUUCUCCAGACUAUUUCCAGUGUAAGACUACGAAGCAUUGCAUUUCCAAGCUGUGGGUUUGUGACGAGGAUCCAGACUGUGCAGAUGCAUCAGACGAGGCCAACUGCGAUAAAAAGACUUGUGGACCUCAUGAAUUCCAGUGUAAAAACAACAACUGUAUUCCCGAUCACUGGCGGUGUGAUAGCCAAAAUGACUGCAGUGAUAAUUCAGAUGAAGAAAACUGUAAGCCACAGACAUGUACAUUGAAAGAUUUCCUCUGUGCCAAUGGGGACUGUGUUUCUUCAAGGUUUUGGUGUGAUGGAGAUUUUGACUGUGCAGAUGGCUCUGAUGAGAGAAAUUGUGAGACAAGUUGUUCCAAAGAUCAGUUCCGGUGUUCCAAUGGUCAGUGUAUACCAGCAAAAUGGAAAUGUGAUGGCCAUGAAGACUGCAAAUAUGGGGAAGAUGAGAAAAGCUGUGAGCCAGCUUCUCCUACUUGCUCAUCACGUGAAUAUAUAUGUGCCAGUGAUGGAUGUAUUUCAGCAUCUUUGAAAUGUAAUGGAGAAUAUGAUUGUGCUGAUGGUUCAGAUGAGAUGGACUGUGUGACUGAAUGUAAGGAAGAUCAGUUUCGGUGCAAAAAUAAAGCCCACUGUAUUCCAAUUAGAUGGCUGUGUGAUGGAAUUCAUGACUGUGUGGAUGGCAGUGAUGAAGAGAACUGUGAAAGAGGAGGAAAUAUAUGUAGAGCUGAUGAGUUCCUUUGCAAUAAUUCUCUCUGCAAACUACAUUUCUGGGUGUGUGAUGGAGAGGACGACUGUGGAGACAACUCUGAUGAAGCCCCUGAUAUGUGUGUCAAAUUUCUUUGUCCAUCCACGAGACCUCACAGAUGCAGAAAUAACAGAAUAUGCCUACAGUCGGAGCAAAUGUGCAAUGGGAUUGAUGAAUGCGGUGACAAUUCAGAUGAAGAUCACUGUGGUGGUAAGCUGACAUAUAAAGCAAGGCCUUGUAAAAAGGAUGAGUUUGCUUGUAGUAAUAAAAAAUGCAUCCCUAUGGAUCUCCAGUGUGAUCGACUUGAUGACUGCGGAGAUGGUUCAGAUGAGCAAGGAUGCAGAAUAGCUCCUACUGAAUAUACCUGUGAAGAUAAUGUGAAUCCAUGUGGAGAUGAUGCAUAUUGUAAUCAAAUAAAAACAUCUGUUUUCUGUCGCUGUAAGCCUGGAUUUCAGAGAAACAUGAAAAACAGACAAUGUGAAGACCUUAAUGAAUGUUUGGUGUUUGGCACAUGUUCCCAUCAAUGUAUAAAUGUGGAAGGAUCAUAUAAAUGUGUGUGUGACCAGAAUUUUCAAGAAAGAAAUAACACCUGCAUAGCAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-583.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -630.17

Frequency: 0.0000

Diversity: 753.68

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((..((((((((...(((((.(((.((((.........((((((((((.(((......))).))(((((...(((.((((((......)))))))))((((((...(((((........))))).))))))))))).(((((.(((((.......)))))..)))))))))))))..))))))).))).))...)))))..)))..))))))((((((((((((((((((..((((((((..(((.....))).(((((((..(((.....)))))))...))).((((((........((((((((.((.....))))).)))))........)))))).......(((((((.((((...((.........))..)))))))))))......(((.......)))))))))))..)).)))))))..............))))))))).....(((((.(((((((((((((((..(((...(((.(((.(((((((.((((((....(((((((..((((((.(((.((((......((((...........)))).......)))))))...)))).))...)))))))..((.((.(.((.((....)).))).)).)).))))))........)))))))...))))))...))))))))))((.((....((((((......(((((((...))))))).....((((((((.(.((((((((.....((((.((((((((((((.(((((.((.((((((((.(((.....(((((.....(((..((.(..((((....((.......))..))))..).))..)))))))).....)))..)))..........)))))..((((((((((((((...((((((.(((((((..((....))..)))))))......(((((.((((((.((.((........)))))))))).)).)))..(((((((...((........).)...))).))))..((((..((((((.......)).)))).))))...((((((((((((......)))........((((((.....(((....)))....))))))(((((......((((((....(((((((((((..((((((((((((.......)))))).....)))))).)).)))))))))...))))))..)))))(((((..(((.((((........)))).))).....)))))...((((.(((..(((((((.......(((......)))........)))))))))).)))).....(((((.((((.((((..(((((.....))))))))).).))).))))).(((((......))))))))))))))((((((......))))))..))))))...))))))))).).)))).((((....))))...)).)))))))))))((.....))..((((...((((...((.((.........))))))))..))))........(((((((.((((((.(((((.(((((.......))))).)))))..........(((((((..((.((((((((((.(((...(((((.(((((((.(..((((((((....((.(((((....)))))))...))))))))..).)))))))..)))))......)))..)).)))))))).))...))))))).))))))))).)).)))))))).)).))......)))))).)))))))))))))))))...)).))((((((........((((((((((...((((((...(((((....))))).............(((((((.((((.....)))).....)))))))((((..........(((((((......((((((.((((.(((.....))).)).)))))))).((((....))))..))))))).........))))............(((..((((((((.(((.((......))))).))))))))..)))........)))))).....))))))))))...(((..(((((........)))))..)))(((.((((.((((((.(((....))).)).))))..)))))))))))))..)))))))).)))))..((.(((((((......))))))))).....((((......))))......((((...))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((({{,{(({{{..,{{(((|(((|(|(({{,,,,{{{(({{((({({.({(......))}.}},,((({{,(((.((((((......))))))))){{{{||},}|{{((...,,.,,||}}}.}))))},}}))},}})},|||||...,||,|||||..,||..||,|||||{{|||}||}.|||,||{,.|||||.......,,.,.{((((((((((((((((((,.(((((((({.{{{.....}}}.,,{((((..(((.....)))})))...,,|.((((((........((((((((.((.....))))).))))).......,)))))).......((((((,{((((,,.,,.........,),.)))))))))))......,,........),})))))))).,)),})))))),.............)))))))))}....{((({.{{|||{{,(((((((..(((...(((.(((.(((((((.((((((..,.{((((({.,,{((((,{{{,{(((,,,.,.{{{,..,,,,.....,}},.,,{|,.}}||||}...}}}}.)),,}))))))}},||,{{.{,((.((....)).))}.)).)).)))))}........)))))))...))))))...)))))))))),|}||,.}}||{||||..|,,,||||||}}}),))}}}}}...((((((((.(,{{{(((((..,..,.,,.,{(((,{,||||.|(((({(({(,(((((,.,{{...,.{,{{....,((({{,((,(..((((....,{.......}}..)))),.,.}}..|}|}}}}..|.{||{|,.|....,,,.,}|}))),,..|||||{{((((({{...{{((((.{{({{{{..||.,,.,|{,|||||||,,{{{{{(,{{|||||,.....,|}}}}}}.,||||||}|,}})},},,..(((((({.,.{(........}.,...))).))))..((((..((((({.......}}.}))).))))...{(((((((((((......)))........((((((.....(((....)))....)))))){((((......((((((.,..((((((((({(..{(((({{{{{(({{.{{..}}},)).||||)))))}.}}.))))))))).,.)))))),.))))}(({((.,(({.,.(({{...|||}|||,})},....}})}}.,.((((.(((..(((((((...{{{.(((......)))..})},..)))))))))).)))).....{((((.(((,.((((..(((((.....))))))))).,.))).))))),(((({......})))))))))))))||{({(,...,.})}}}|..}}}}}},..}}}}}}}}},..{{{{{(((({{(((((.......)))))))}..{(((({.{.......,..)))))),))))))),.......}})}},||.,||||,,{||.{|,|||||,}||||||,|((((.(((((.......))))).))))},,,.|,||,.,.((((({{({.,(((,((({(,(((...{||||}|||||||}},.||||||||,,,..,}||||}}},})}}}}|}|,|}||}}|}},.,,}}}||||..}})))}.....})),.}}|}))))}})})),...,))})).)))))))))},)}))),)))).,)}))},,,..)))}}}.}})))))))))}}|||}..,}}|}}{|{{{{,,...,..{((((((({{,,,({{{{|,,.{||||,,,,))})}..{{{.,{,,,,.,|||{,,.((((.....)))),},,}}})))))))))}........{((((((({,,,{{((((((.{{((.(((,...,))).)).}})))))}.((((,,..}}|}.,|||,||......))))}},)}},,}....,|,|,,..{|{{{||,.,|}}||,.}}..},)))}))),}}}}..})}........)))))),,|,,}))}})))}}...(((..(((((........)))))..))),{.,((((,{,(({,.,,,....}}}.))}}))}.,)))))}}}}}||}..}}}}}},},)))))..((.(((((((......))))))))).....{(((......)))}......((((...))))..)