Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0009500
Sequence Length
1343 nt
GC Content
0.4334
AUAUUUGUAUUGGAUUGACUGCUGCGAGUAUCCUCAUAUUGGCCGUGUUGGAAUGGAUGGAACCAAUCAGAGUGUUGUCAUAGAAACCAAGAUUUCUAGACCUAUGGCACUAACAAUAGAUUAUGUUAAUCGUAGACUCUACUGGGCCGAUGAAAAUCACAUUGAAUUUAGCAACAUGGAUGGAUCUCAUAGACACAAAGUCCCUAAUCAAGAUAUUCCAGGGGUGAUUGCACUAACAUUGUUUGAAGACUACAUCUACUGGACUGAUGGGAAAACCAAGUCACUCAGCCGUGCCCAUAAAACAUCGGGAGCAGACAGACUCUCACUGAUUUACUCAUGGCAUGCCAUCACAGAUAUCCAGGUGUAUCAUUCUUAUAGACAACCUGAUGUCUCCAAACAUCUCUGCAUGAUAAAUAAUGGUGGUUGCAGUCAUUUGUGCCUUUUAGCCCCUGGAAAAACCCACACUUGUGCAUGUCCCACUAACUUCUAUCUGGCAGCUGAUAAUAGGACUUGCUUAUCCAACUGCACAGCCAGCCAGUUUCGUUGCAAAACUGACAAAUGUAUUCCAUUCUGGUGGAAAUGUGACACCGUGGAUGACUGUGGUGAUGGAUCUGAUGAACCUGAUGACUGUCCUGAAUUUAGAUGUCAGCCAGGCCGAUUUCAGUGUGGGACUGGACUCUGUGCUCUACCAGCUUUCAUCUGUGAUGGAGAGAAUGAUUGUGGAGACAAUUCUGAUGAACUCAACUGUGACACACAUGUCUGCCUGUCAGGUCAAUUCAAAUGUACCAAGAACCAGAAAUGUAUCCCAGUAAACUUAAGAUGUAAUGGGCAAGAUGACUGUGGUGAUGAGGAAGAUGAAAGAGACUGUCCUGAAAACAGCUGUUCUCCAGACUAUUUCCAGUGUAAGACUACGAAGCAUUGCAUUUCCAAGCUGUGGGUUUGUGACGAGGAUCCAGACUGUGCAGAUGCAUCAGACGAGGCCAACUGCGAUAAAAAGACUUGUGGACCUCAUGAAUUCCAGUGUAAAAACAACAACUGUAUUCCCGAUCACUGGCGGUGUGAUAGCCAAAAUGACUGCAGUGAUAAUUCAGAUGAAGAAAACUGUAAGCCACAGACAUGUACAUUGAAAGAUUUCCUCUGUGCCAAUGGGGACUGUGUUUCUUCAAGGUUUUGGUGUGAUGGAGAUUUUGACUGUGCAGAUGGCUCUGAUGAGAGAAAUUGUGAGACAAGUUGUUCCAAAGAUCAGUUCCGGUGUUCCAAUGGUCAGUGUAUACCAGCAAAAUGGAAAUGUGAUGGCCAUGAAGACUGCAAAUAUGGGGAAGAUGAGAAAAGCUGUGAGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-348.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -376.40
Frequency: 0.0000
Diversity: 422.14
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....)).((((.((.((.(((.(..((.((((((((((.((.((.((.((.(((......))).))........(((.((((((......))))))))).((((((..(((((........))))).((((((.((.(((((((.(((((.......)))))..........((((((((((.((..((((((((.(((((............(((((((((((((((((((..((((((((..(((.....))).(((((((..(((.....)))))))...))).((((((........((((((((.((.....))))).)))))........)))))).......(((((((.((((...((.........))..)))))))))))......(((.......)))))))))))..)).)))))))..............)))))))))).....(((....)))...(((((((..(((...(((.(((.(((((((.((((((....(((((((..((((((.(((.((((......((((...........)))).......)))))))...)))).))...)))))))..((.((.(.((.((....)).))).)).)).))))))........)))))))...))))))...)))))))))).))))).)))).))))..))..)))))))))).(((((((..((.((..((.((((.((((......((((....(.((.((((.((((((((((.(.(((..........(((...((..((....))..))...))).......))).).)))))))....))))))))).))))).........))))..))))))..)).))....))))))).......)))))))..)).))))))..(((((((((((((.(((((((((((.......)))))))..((((((....))).)))..(((((((...((........).)...))).))))..((((..((((((.......)).)))).)))).....(((((((.((..((..(((........((((((.....(((....)))....))))))(((((......((((((....(((((((((((..((((((((((((.......)))))).....)))))).)).)))))))))...))))))..)))))(((((..(((.((((........)))).))).....)))))....)))..))..)).))))))).....))))....))))))))))))))))))))).)).)).))))))))))..))..)...))).)).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(,....},|(((.((.((.(((.{..((.((((((((({.((.((.((((((({..((((((..((({{((({{{(((.((((((......))))))))),{{{||},}|{{{{...,,.,,}}})).})||||.||)}},{{{{.((((.....{((({,|...{({.,((.(({({{((((,((..((((((((.{((({............(((((((((((((((((((,.(((((((({.{{{.....}}}.,,{((((..(((.....)))})))...,,|.((((((........((((((((.((.....))))).))))).......,)))))).......((((((,{((((,,.,,.........,),.)))))))))))......,,........),})))))))).,)),})))))),.............))))))))))..,,,(((,,,,||},..(((((((..{((...(((.(((.(((((({.((((((...,((((({{.,,,((((,{({,{((({{,.,,({{,..,,,,.,...,|},.,{{{,.}|||||,...,,},.))}}}))))}}}},|||{{.{,((.((....)}.}}}.}}.}}.)))))}........)))))))...))))))...))}))))))).))))).}))),|||}..}}..}||}|}}}}).)),,}}}..,|,,{||}},}))},}||||,,|{,,.|,,{{((,.{{|||,,{{(({{{.{((({({{..{(({....(((({,{,{{({,,,{({{,{((((....,{.......}}..))))..,.||{.|||||||..|.,|{{|,,,,...|||,,,|||}}|,..|}}},,)}},})}})},..,}}},||{{{,,..||....,}|,}})}}|,..||||,||||||||||,,...,|}}))))..}}}|||}},}}||{|||..(((((((...{(........).}...))).))))..((((..((((((.......}},}))).))))...{{(({({{({{{......}},......}}||||||,,,..{((....}}}....})))},.||||}}}.},||||||,,{{((,(({((({(..{{{{{|,}}|||..,},}})),,},.)))))))))).,,,)))))))))}}},),)))}})}}||||,,,,}}}}....))))}.,,..)))),)))}..}))..)))))).})))))}(((((((...{{{.(((......)))..})},..))))))).,}.)).)).})))))))))..))..}...))).)).)))))}
Back