Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0010300
Sequence Length
1106 nt
GC Content
0.4322
AUAUUUGUAUUGGAUUGACUGCUGCGAGUAUCCUCAUAUUGGCCGUGUUGGAAUGGAUGGAACCAAUCAGAGUGUUGUCAUAGAAACCAAGAUUUCUAGACCUAUGGCACUAACAAUAGAUUAUGUUAAUCGUAGACUCUACUGGGCCGAUGAAAAUCACAUUGAAUUUAGCAACAUGGAUGGAUCUCAUAGACACAAAGUCCCUAAUCAAGAUAUUCCAGGGGUGAUUGCACUAACAUUGUUUGAAGACUACAUCUACUGGACUGAUGGGAAAACCAAGUCACUCAGCCGUGCCCAUAAAACAUCGGGAGCAGACAGACUCUCACUGAUUUACUCAUGGCAUGCCAUCACAGAUAUCCAGGUGUAUCAUUCUUAUAGACAACCUGAUGUCUCCAAACAUCUCUGCAUGAUAAAUAAUGGUGGUUGCAGUCAUUUGUGCCUUUUAGCCCCUGGAAAAACCCACACUUGUGCAUGUCCCACUAACUUCUAUCUGGCAGCUGAUAAUAGGACUUGCUUAUCCAACUGCACAGCCAGCCAGUUUCGUUGCAAAACUGACAAAUGUAUUCCAUUCUGGUGGAAAUGUGACACCGUGGAUGACUGUGGUGAUGGAUCUGAUGAACCUGAUGACUGUCCUGAAUUUAGAUGUCAGCCAGGCCGAUUUCAGUGUGGGACUGGACUCUGUGCUCUACCAGCUUUCAUCUGUGAUGGAGAGAAUGAUUGUGGAGACAAUUCUGAUGAACUCAACUGUGACACACAUGUCUGCCUGUCAGGUCAAUUCAAAUGUACCAAGAACCAGAAAUGUAUCCCAGUAAACUUAAGAUGUAAUGGGCAAGAUGACUGUGGUGAUGAGGAAGAUGAAAGAGACUGUCCUGAAAACAGCUGUUCUCCAGACUAUUUCCAGUGUAAGACUACGAAGCAUUGCAUUUCCAAGCUGUGGGUUUGUGACGAGGAUCCAGACUGUGCAGAUGCAUCAGACGAGGCCAACUGCGAUAAAAAGACUUGUGGACCUCAUGAAUUCCAGUGUAAAAACAACAACUGUAUUCCCGAUCACUGGCGGUGUGAUAGCCAAAAUGACUGCAGUGAUAAUUCAGAUGAAGAAAACUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-278.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -301.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 377.86
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((.((((....((.(((((.(((((((((..(((((((((.(......).))))..)))))..)))....(((.((((((......)))))))))((((((...(((((........))))).)))))).(((....))).(((((.......)))))...((..((.((((((((((.((..((((((((.(((((............(((((((((((((((((((..((((((((..(((.....))).(((((((..(((.....)))))))...))).((((((........((((((((.((.....))))).)))))........)))))).......(((((((.((((...((.........))..)))))))))))......(((.......)))))))))))..)).)))))))..............)))))))))).....(((....)))...(((((((..(((...(((.(((.(((((((.((((((....(((((((..((((((.(((.((((......((((...........)))).......)))))))...)))).))...)))))))..((.((.(.((.((....)).))).)).)).))))))........)))))))...))))))...)))))))))).))))).)))).))))..))..)))))))))).))..)).....(((((....)))))(((((((....((.(((.....((((.((((((((((((..(((.(((.....(((((.....(((..((.(..((((....((.......))..))))..).))..)))))))).....)))..)))..((((..(((..((.(((....))).))..)))..)))).(((((((..((....))..)))))))..((((((...)))))))))).)))...)))))))))))).))))))))).(((((((...((........).)...))).))))..((((..((((((.......)).)))).))))..))).))).))))))).....)))).)))).((((((.....(((....)))....))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,{(({{.{(((.,,.,{,(((({,(({{{{{{(,,{(((((((({({{{,.{|{,||,..))),},.|{{(,,{(((.((((({......})))))))){{{{||},,|{{{{.......,||}}}.||||||.||}||{||||.|((({....,,.}}})}..,||..||,||||{{((((,((,.{{({({{{.{{{{{........,...(((((((((((((((((((,.(((((((({.{{{.....}}}.,,{((((..(((.....)))})))...,,|.((((((........((((((((.((.....))))).))))).......,)))))).......((((((,{((((,,.,,.........,),.)))))))))))......,,........),})))))))).,)),})))))),.............)))))))))),,,{,(((,,,,|||,,.(((((((..{{{...{((,(((.(((((({.((((((...,((((({{.,{,((({{{({,{((({{,.,,({{,..,,,,.,...,||,.,{{{{.||||||,...,,},.))}}}))))}}}},|||((.,,((.({....}}.}}|,}},}}.)))}}}........)))))))...))))}}...})}))))))),))}}}.}||},||||,.|},.||||||}}}).}},}}}}..,|,{{||||||}}}.|{({{..{|,,.,..{{{{{{{,,||{,|||{|||||||||{|{{.,{{...,.{{{|,...,,((,..{{.{..{(((....,{.......}}..)))),.}.)},.})))))),.},,}},,,}),,..}}}..}}})))}...})))}})}}},})))}.....,}})))}..|}.}}}}},,}}}}|||||,..|}}}.}}}}))}}},}},,,,})}}}}}..||||||}},}))),}},..(((((((...{(........).}...))).))))..((({..((((({.......}}.}))).))))..)}}|))},}}}}})},,..,)))}.}}}}.((((((.....(((....)))....))))))
Back