Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0011000
Sequence Length
639 nt
GC Content
0.2645
GUACUUUCUCAUACAUGUUAGAAAAACCUUUAAAUUAGGUGGUAUUGAUAUUAUUAUUUUGGUUGUUAUUGUUAUUAUCCUCAUUUAAUAGAUGAGAAAACAGAGAAUCAGAAAGAAGUCUGCCUGGAUCCAGUGAAUAUCAUUUCUCCAUAUAAGUAACAGAAAUCCUUUGCCUAAUUGCGGUUUUGUCACCAACUAACUAGCAGUGUGACUUGGGCAUGUCACAUAAGGUCUCUGUGGCUAUUUCUAAAUCUUAAAUUUAGAAACUUGGAUUAGAUUAUUUGUGAGAUUUUUUCCCCCAGAUAGGAACUUUAUUAUCUGCAAAUAGCAAGAAUUUGAAUAUAGUUUAUGUAACAAUACCAAUGGAGUAUAUAUAUUUGAAAAUUUGCCAUCUAAAUUGUUUAAAUUAUCUUAAUGAUCAUUUAGCACUCAAGAUAGUUUCAAUAUUUAAGAGCAGAGAAAUUAUAUAAUAUAAAGAAUGCAUACAUAAUUAAAAUAUUCAAUAUACUGUUAACUAAAGCUAUUUCAAAUUAGUAAUUUAUAUUAAAAUAAUGAAUUCAAUAAAAUAUGUUCUCAUUCAGAUGUAGAAGUCUUAUAUAAAGUUGUUUUCUUAAUUAUAUCAAAAUAGUUUUUAUCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-107.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -122.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 206.30
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.((....)).))))..((((.......)))))))))(((((..(((((((((((........((((((........)))))).(((((((((((.........((((..(((((.((((...(((((...)))))..))))....(((.(((((...((((........((((((((((....)))..)))).)))(((((((........)))))))))))..))))).)))((((((...((((((((...((((((.(((..(((((........)))))..)))..(((((((........)))))))......(((((..((((((((((...(((....((.......))..)))..))))))))))..))))).((((....((((.((((.(((.....))).))))))))....))))))))))...))))))))....)))))).............(((((...(((((........(((((.(((.............((((........)))).............))).))))).........)))))...)))))....)))))..))))........))))))))))).....)))))))))))...)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,((((({{{((..,,{{.||||..((((.......)))).,|{((((,,{{(((((((((((.{,,,,,{(((({...((((((|...}))))))...{((({,,..{{,,.,{,..||||,,((((...{((((...}))}}..}}}}....{((.(((({...{{{|||{.,.,,(((((({.,{....},}..)))}.)))|{(((((........)))))}},}))},))))).|||,(((((((((.....))))))))}...(((..(((((........)))))..)))..(((((((........)))))))..,}}})),..{(((((((.(((((((..{(((((.{,,,....|,|{{({(((({,{.....(((((..(((,((.((((.((((((((({..{(,........,,.,.)))))))))).)))),)).))))))))..,..})}}}}.}}},..,,(((....}}}.......,}))))..,,},.))))}.}..))))))))))))))),}}}}}.,,,))}}}}))))))),.)))}}}..,,}}}),,,,}},,,,}}),}))}}))||..{{{{{,|||||||,,||....}),,))))))}}}}}))),,))
Back