Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0011600
Sequence Length
789 nt
GC Content
0.4499
UCCCUAAUCAAGAUAUUCCAGGGGUGAUUGCACUAACAUUGUUUGAAGACUACAUCUACUGGACUGAUGGGAAAACCAAGUCACUCAGCCGUGCCCAUAAAACAUCGGGAGCAGACAGACUCUCACUGAUUUACUCAUGGCAUGCCAUCACAGAUAUCCAGGUGUAUCAUUCUUAUAGACAACCUGAUGUCUCCAAACAUCUCUGCAUGAUAAAUAAUGGUGGUUGCAGUCAUUUGUGCCUUUUAGCCCCUGGAAAAACCCACACUUGUGCAUGUCCCACUAACUUCUAUCUGGCAGCUGAUAAUAGGACUUGCUUAUCCAACUGCACAGCCAGCCAGUUUCGUUGCAAAACUGACAAAUGUAUUCCAUUCUGGUGGAAAUGUGACACCGUGGAUGACUGUGGUGAUGGAUCUGAUGAACCUGAUGACUGUCCUGAAUUUAGAUGUCAGCCAGGCCGAUUUCAGUGUGGGACUGGACUCUGUGCUCUACCAGCUUUCAUCUGUGAUGGAGAGAAUGAUUGUGGAGACAAUUCUGAUGAACUCAACUGUGACACACAUGUCUGCCUGUCAGGUCAAUUCAAAUGUACCAAGAACCAGAAAUGUAUCCCAGUAAACUUAAGAUGUAAUGGGCAAGAUGACUGUGGUGAUGAGGAAGAUGAAAGAGACUGUCCUGAAAACAGCUGUUCUCCAGACUAUUUCCAGUGUAAGACUACGAAGCAUUGCAUUUCCAAGCUGUGGGUUUGUGACGAGGAUCCAGACUGUGCAGAUGCAUCAGACGAGGCCAACUGCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-200.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -218.30
Frequency: 0.0000
Diversity: 242.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.............(((((((((((((((((((..((((((((..(((.....))).(((((((..(((.....)))))))...))).((((((........((((((((.((.....))))).)))))........)))))).......(((((((.((((...((.........))..)))))))))))......(((.......)))))))))))..)).)))))))..............))))))))))(((((((((((((((((.(((.((((........(((((((((((....((((((((..(((((...((.((..((((..(((((...((((....((((((..((.((((((((((((((.........))))).)))))((.((.((.(.((.((....)).))).)).)).))...)))).))..))))))((((.((.((......)).)).))))....(((.((((((((.((((((((...))).)))))..))...))))))))).(((....)))....((((.((...((((.((((....((.(((((.......)).)))..))..)))).)))).)).))))..................))))...)))))))))..))))...)))))..))....))))))....))))))....)))))........))))...)))..........))))....)))).)))))))))..))((((...((.(.((((((....))).))).)..))....)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({({..,,,.....(((((((((((((((((((,.(((((((({.{{{.....}}}.,,{((((..(((.....)))})))...,,|.((((((........((((((((.((.....))))).))))).......,)))))).......((((((,{((((,,.,,.........,),.)))))))))))......,,........),})))))))).,)),})))))),.............))))))))))(((((((((((((((((,(((,(((,..,,...,(({((({((((,,..((((((...{(((((,,.{{.(({{({({.,(((((,..{(((...,|,,,,....||..{{(({.,|((((......,..)))))})))}}}},|{|((.,{((,({,,,,|}.|||{||,||.||||||....,,,,)))))}|{{{||}|||...|||}}}}}})}}},...{{(.(((((({{.(,((({((,..,,}}})))),.,)...))))))))}..{({{..|||,.,..,{||{{||,||,,}}|,|}||}||||||||.,||,..,,|,||,...,|||,,.,|.|..{(((....,{.......}}..))))},).},},)))))))..)}}),.,}})},..}}}...))))))....)))))),,..}))))........}|||,,.,,|,....,),,})))),...)))).))))))))).,)),,||}..,,.{.((((((....))).))).},,}}....)).))
Back