Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0011800
Sequence Length
1294 nt
GC Content
0.4274
GGAUUAAACAAUGUUAUUGCUAUAGACUUUGAUUACAGAGAAGAAUUCAUCUAUUGGAUCGAUUCUAGCCGACCCAAUGGCAGUCGCAUAAAUAGAAUGUGUUUAAAUGGAAGUGACAUUAAGGUAGUUCAUAACACAGCGGUCCCCAAUGCACUUGCUGUCGAUUGGAUUGGAAAAAACCUCUAUUGGUCUGACACAGAAAAAAGAAUCAUUGAAGUAUCCAAACUCAAUGGCUUGUACCCUACUAUACUCGUUAGCAAAAGGCUGAAGUUUCCCAGAGACUUGUCUUUAGAUCCUCAAGCUGGAUAUUUGUAUUGGAUUGACUGCUGCGAGUAUCCUCAUAUUGGCCGUGUUGGAAUGGAUGGAACCAAUCAGAGUGUUGUCAUAGAAACCAAGAUUUCUAGACCUAUGGCACUAACAAUAGAUUAUGUUAAUCGUAGACUCUACUGGGCCGAUGAAAAUCACAUUGAAUUUAGCAACAUGGAUGGAUCUCAUAGACACAAAGUCCCUAAUCAAGAUAUUCCAGGGGUGAUUGCACUAACAUUGUUUGAAGACUACAUCUACUGGACUGAUGGGAAAACCAAGUCACUCAGCCGUGCCCAUAAAACAUCGGGAGCAGACAGACUCUCACUGAUUUACUCAUGGCAUGCCAUCACAGAUAUCCAGGUGUAUCAUUCUUAUAGACAACCUGAUGUCUCCAAACAUCUCUGCAUGAUAAAUAAUGGUGGUUGCAGUCAUUUGUGCCUUUUAGCCCCUGGAAAAACCCACACUUGUGCAUGUCCCACUAACUUCUAUCUGGCAGCUGAUAAUAGGACUUGCUUAUCCAACUGCACAGCCAGCCAGUUUCGUUGCAAAACUGACAAAUGUAUUCCAUUCUGGUGGAAAUGUGACACCGUGGAUGACUGUGGUGAUGGAUCUGAUGAACCUGAUGACUGUCCUGAAUUUAGAUGUCAGCCAGGCCGAUUUCAGUGUGGGACUGGACUCUGUGCUCUACCAGCUUUCAUCUGUGAUGGAGAGAAUGAUUGUGGAGACAAUUCUGAUGAACUCAACUGUGACACACAUGUCUGCCUGUCAGGUCAAUUCAAAUGUACCAAGAACCAGAAAUGUAUCCCAGUAAACUUAAGAUGUAAUGGGCAAGAUGACUGUGGUGAUGAGGAAGAUGAAAGAGACUGUCCUGAAAACAGCUGUUCUCCAGACUAUUUCCAGUGUAAGACUACGAAGCAUUGCAUUUCCAAGCUGUGGGUUUGUGACGAGGAUCCAGACUGUGCAGAUGCAUCAGACGAGGCCAACUGCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-330.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -356.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 393.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.....(((((((..((((((((.(((((....))))).((((((.((((...)))).))))))..((((.((((((((((((((((.......))))).........(((((.((((..((..(((........)))...))..))))))))))))))).))))).))))....((((((((((((((((...)))..................((((((..((..((((((.(((.......((((((((.((((((((((..(((((((...)))))))))))))..((((.......)))).................)))))))))))).....))).))))))...))..))))))..)))))).)))).)))(((.((((((......))))))))))))))))).(((((........))))).((((((.((.(((((((.(((((.......)))))..........((((((((((.((..((((((((.(((((............(((((((((((((((((((..((((((((..(((.....))).(((((((..(((.....)))))))...))).((((((........((((((((.((.....))))).)))))........)))))).......(((((((.((((...((.........))..)))))))))))......(((.......)))))))))))..)).)))))))..............)))))))))).....(((....)))...(((((((..(((...(((.(((.(((((((.((((((....(((((((..((((((.(((.((((......((((...........)))).......)))))))...)))).))...)))))))..((.((.(.((.((....)).))).)).)).))))))........)))))))...))))))...)))))))))).))))).)))).))))..))..)))))))))).(((((((..((.((..((.((((.((((......((((....(.((.((((.((((((((((.(.(((..........(((...((..((....))..))...))).......))).).)))))))....))))))))).))))).........))))..))))))..)).))....))))))).......)))))))..)).)))))))))))))....)))..((.((((.(((((..............((((((....))).)))))))).)).)).)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({....,{(((((({{,((((,,.(((((....))))).,((((,,((((,,{||}|{||||}}.{(({,.,,.,|}}}|||||{{{.,,,,..,}}})}}}..}}}}.,}}}})}}}...,},}}},....|.((((((((.((((((({.,(((({.(((.{({.,,((.....,{{,,,..,}}|(((...))),...,,{..{(((((,,((......))))))))},},,,..,,..,,,,,.})).})))}{(((((..(((((((...))))))))))))}..((((.......))))...})))))))...)))))))).}||,}}})|,...{{{{((,{{{|,{{.{{|,,....))),),,,|{{{{{(((.((((((......))))))))),,}}))))}|{{{{.......,|||},.((((((.{(.{((((({.(((((.......}}}))...,,..{{.((((((((((.((..((((((((.(((((............(((((((((((((((((((,.(((((((({.{{{.....}}}.,,{((((..(((.....)))})))...,,|.((((((........((((((((.((.....))))).))))).......,)))))).......(((((({{((((,,.,,.........,),.)))))))))))......,,........),})))))))).,)),})))))),.............)))))))))).....(((....)))...(((((((..(((...(((.(((.(((((((.((((((..,.{((((({.,,{((((,{{{,{(((,,,.,.{{{,..,,,,.....,}},.,,{{,.}}||||,...}}}}.)),,}))))))}},||,{{.{,((.((....)).})}.)).)}.)))))}........)))))))...))))))...)))))))))).))))).)))).))))..))..)))))))))).}|,||||..,{{{({(,,.,|}}}}|({{..{|{{,,..,{{{{{{,|||{,|||{{{{{|{|{|{{(,.{{{...,.({({,...,,((,..{{.{..{(((.,..,,.......,)..)))),.}.))..})))))),.},,}},}.,},...}}}.,}}}}})}...}))),,})))}}))},.....}))))))..}).))))))})))}||{{{,|.|,,{,|,((({(((,,.....})))))).}}},})|}}))})}}}.}))),)))))},,},}
Back