Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0012000
Sequence Length
2388 nt
GC Content
0.4292
UUCAAAACAAACACAAAUGUGAAGAAAAUUAUUUUAGUUGUCCUAGUGGAAGAUGCAUUUUGAAUACCUGGAUAUGCGAUGGUCAGAAAGAUUGUGAGGAUGGACGUGAUGAAUUCCACUGUGAUUCUUCUUGCUCUUGGAACCAAUUUGCUUGUUCCGCACAAAAAUGUAUUUCUAAGCAUUGGAUUUGUGAUGGAGAAGAUGACUGUGGGGAUGGGUUAGAUGAAAGUGACAGCAUUUGUGGUGCCAUAACCUGUGCUGCUGACAUGUUCAGCUGCCAGGGCUCUCGUGCCUGCGUGCCCCGACAUUGGCUUUGUGAUGGUGAAAGGGACUGUCCAGAUGGAAGCGAUGAGCUUUCCACAGCAGGCUGCGCUCCCAAUAAUACAUGUGAUGAAAAUGCUUUCAUGUGCCAUAAUAAAGUAUGCAUUCCCAAGCAAUUUGUUUGUGACCAUGAUGACGACUGUGGAGAUGGCUCUGAUGAGUCACCGCAGUGUGGAUAUCGACAGUGUGGUACAGAAGAAUUUAGUUGUGCUGAUGGGCGGUGUCUUCUAAAUACUCAAUGGCAGUGUGAUGGAGACUUUGACUGUCCUGACCAUUCUGAUGAAGCACCUUUAAACCCAAAGUGUAAAAGUGCAGAACAGUCAUGCAACAGUUCAUUUUUUAUGUGCAAAAAUGGCAGGUGCAUUCCCAGUGGAGGUCUUUGCGACAAUAAGGAUGACUGUGGCGAUGGUUCAGAUGAGAGAAACUGCCAUAUAAAUGAAUGUUUGAGUAAGAAAGUCAGUGGAUGUUCUCAAGACUGUCAAGACCUUCCGGUCAGUUAUAAGUGCAAAUGCUGGCCUGGAUUCCAACUGAAGGAUGACGGCAAAACAUGUGUAGACAUUGAUGAAUGCUCUUCAGGCUUUCCCUGUAGCCAGCAAUGCAUCAAUACAUACGGGACUUACAAGUGCCUCUGUACAGAUGGGUAUGAAAUACAACCUGAUAACCCAAAUGGCUGCAAAUCGCUCUCAGAUGAAGAACCUUUUUUAAUUCUUGCUGAUCAUCAUGAGAUAAGGAAAAUUAGCACUGAUGGCUCCAACUACACACUUUUAAAACAGGGAUUAAACAAUGUUAUUGCUAUAGACUUUGAUUACAGAGAAGAAUUCAUCUAUUGGAUCGAUUCUAGCCGACCCAAUGGCAGUCGCAUAAAUAGAAUGUGUUUAAAUGGAAGUGACAUUAAGGUAGUUCAUAACACAGCGGUCCCCAAUGCACUUGCUGUCGAUUGGAUUGGAAAAAACCUCUAUUGGUCUGACACAGAAAAAAGAAUCAUUGAAGUAUCCAAACUCAAUGGCUUGUACCCUACUAUACUCGUUAGCAAAAGGCUGAAGUUUCCCAGAGACUUGUCUUUAGAUCCUCAAGCUGGAUAUUUGUAUUGGAUUGACUGCUGCGAGUAUCCUCAUAUUGGCCGUGUUGGAAUGGAUGGAACCAAUCAGAGUGUUGUCAUAGAAACCAAGAUUUCUAGACCUAUGGCACUAACAAUAGAUUAUGUUAAUCGUAGACUCUACUGGGCCGAUGAAAAUCACAUUGAAUUUAGCAACAUGGAUGGAUCUCAUAGACACAAAGUCCCUAAUCAAGAUAUUCCAGGGGUGAUUGCACUAACAUUGUUUGAAGACUACAUCUACUGGACUGAUGGGAAAACCAAGUCACUCAGCCGUGCCCAUAAAACAUCGGGAGCAGACAGACUCUCACUGAUUUACUCAUGGCAUGCCAUCACAGAUAUCCAGGUGUAUCAUUCUUAUAGACAACCUGAUGUCUCCAAACAUCUCUGCAUGAUAAAUAAUGGUGGUUGCAGUCAUUUGUGCCUUUUAGCCCCUGGAAAAACCCACACUUGUGCAUGUCCCACUAACUUCUAUCUGGCAGCUGAUAAUAGGACUUGCUUAUCCAACUGCACAGCCAGCCAGUUUCGUUGCAAAACUGACAAAUGUAUUCCAUUCUGGUGGAAAUGUGACACCGUGGAUGACUGUGGUGAUGGAUCUGAUGAACCUGAUGACUGUCCUGAAUUUAGAUGUCAGCCAGGCCGAUUUCAGUGUGGGACUGGACUCUGUGCUCUACCAGCUUUCAUCUGUGAUGGAGAGAAUGAUUGUGGAGACAAUUCUGAUGAACUCAACUGUGACACACAUGUCUGCCUGUCAGGUCAAUUCAAAUGUACCAAGAACCAGAAAUGUAUCCCAGUAAACUUAAGAUGUAAUGGGCAAGAUGACUGUGGUGAUGAGGAAGAUGAAAGAGACUGUCCUGAAAACAGCUGUUCUCCAGACUAUUUCCAGUGUAAGACUACGAAGCAUUGCAUUUCCAAGCUGUGGGUUUGUGACGAGGAUCCAGACUGUGCAGAUGCAUCAGACGAGGCCAACUGCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-641.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -692.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 881.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...........(((....))).............((((((.(((.((....(((((((..........((((.((((((((.((...((((....(((((...(((((........))).))...)))))....))))(((((..........)))))..........(((..(((..((((((((..((...(((((((.(.(.((((.(((((((.(((..(((.((((((((((((((.(((.......((((.((.(((((.....))))).)))))).....(((((((((..(((........)))((((.((((((.......))))))))))(((((((.....)).)))))..)))))).)))............(((.........)))...(((((.(.(((((..((((.(((........)))))))..))))).))))))......(((((.(((.(((.((..((((((((((((.(((.(....).))).)))))).((..((((((((((...))))).(((((((((((((...((((((....).)))))...))))))....))))))).....)))))..))..((((.((((.((.....)).)))).)))).((((.(((..((.(((((.(((((((..((((((((...(((...(((.......)))...)))))))).)))..)))))))))))).))))).))))......(((((....((((.....(((...(((.....)))...)))))))...)))))....((((((...(((((.(((((((.............)))))))(((...)))...))))).)))))).........((((...((((((((.((((((.((((.....)))).))..)))).).)))))))...)))).))))))..)).)))))).)))))..((((.((.....))))))....)))))))).))))....))))).)))..))).....((((((((..((((.((.((((((((.((.............((((.(((((((.(((((((.....((((...(((((((((((((((((((.(((......(((((....))))).((((((.((((...)))).))))))..((((.((((((((((((((((.......))))).........(((((.((((..((..(((........)))...))..))))))))))))))).))))).)))).....(((......)))(((...)))....(((..(((((((.((......)))))))))))).((((((.....(((..(((((.....)))))))).....((.(((((((((..((((((((((...(((((((((((.(((.....))).))))))))))).....))))((((((((((.(((......))).))(((((...(((.((((((......)))))))))((((((...(((((........))))).))))))))))).(((((.(((((.......)))))..)))))))))))))..))))))...)))))...)))).))...............))))))...))).)))))))))))).(((.....))).(((((((..(((.....)))))))...))).((((((........((((((((.((.....))))).)))))........)))))).......(((((((.((((...((.........))..)))))))))))......))))))).....)))).....))))))).))))))).))))......((((.(((......)))(((..((.((.(((((((..(((...(((.(((.(((((((.((((((....(((((((..((((((.(((.((((......((((...........)))).......)))))))...)))).))...)))))))..((.((.(.((.((....)).))).)).)).))))))........)))))))...))))))...)))))))))))).))...)))((((.(((((........))..)))))))....((((.(((.(((.(((((.............(((((..((....))..)))))(((((.......)).)))......))))).))).)))))))................)))).......)))))))))).)).)))))))))))).)))))))....)))))).)))))))...))..)))))))).))).)))))..)))))))).))))..((((.((((((.((......))))))))..)))))))))))..)).))).))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
...........(((....))).............((((((.(((.((....(((((((,,.......,((((({.{((({(((({.,,(({((((.,((({{({,((({.{{{{(((((,{{.({{,((((({{((.,{(({(((,..{{((({,{{{((({{,,,{|||.....,},))))),,.))))}),}}))))))||,||{|||||{{{{(({{(.{(((({(({.{{{(({,{{{(({,{....,{(((.((.(((((.....))))).))))}|{....{{{((((((..(((........)))((((.((((((.......)))))))))){((((((.....))))))))..)))))).)})}.}}}.......|||||||||.....}})))))),}}}|||,......}}}})}})))}..||||}||.|}}||}}||||,.,,.{.{({{(((,,,((((((....))))}||||||}|{|.{...,).}}}.})))))}}||,,|||,,{{({{{{,,|,,.((((((({(((((...{({(((..,.|,|||}}...}}}}}}....}}})))}|{||,,|{||,.,,..((((.((({.{{.....)),)}}}.)))),|,}}})))}|((.(((({{(((((((..((((((({...{((...,|{,{,,,.,}}),},))}))))).}))..)))))))))))).))}}}}}}}},..,,,,,,,,||,}}|||....,}}...||||||}}}}}}}||||}}}})}.}})))},.|.((((({...(((((,(((((((..,........,,))))))),||,..||,...}}})).))))))|.....,{(((({,..{((({{(,,{((({{,((((,,.,,|}||,||||}}}}.,.)}}}}}||||,}.((,(({,,,,|||,}},.||},,{,,((((({(.,.........,.}}.}))))..))||}||,....,}(((((((((({{{,..........,}}}......))))).))))}...||,.....,||{{,|{{(({{.{{{{{{{.,,..{{,,...{{|{{{{{({{((((((((.(((,,{,{,(((((....}}|||.,,,{{{,{((({{,||||{|||||}.,(({{.{{{{||||,((,((,({{{{..,{|||||{,..,{{,{{,{{,{||,..,|,,,|}},,....{{((((((.((((((({.|{({(|,{{{,|||.,|||.....,{{,,,...}}|(((...))),...,{{..{(((((,,((......))))))))},},.,,.,,..,,,,,.}}}.}})}}{(((((..{((((((...))))))})))))}..((((.......)))}...})))))))...)))))))),|||,,,,)}}.,{||||((|||||||{.{||,,....))),)}||{{{{{{(((.((((((......)))))))))||||}))),||||{...{{,{{||,}}.})}}}},,})))}}}))})||||...,.}|)))),.,}}}},},}||||||||||}||..|||||{||.|||{({{..........,|,,|||||||||,|||,|}}|||||||}},,{{.....}}}.,,{((((..(((.....)))})))...,,|.((((((..,.....((((((((.((.....))))).))))).......,)))))).......(((((({{((((,,.,,.,.......,),.)))))))))))......|}}}}}}..,,.}))),,,})})))))),)))))},.}}}}...,,.,))}}|||,.....}|||}}}})))...|||||{{..||,,,}|||}{||,|||{{{,.,,{|||,,}}.||||||.{{((((({,{.,,{{{{{({({((({{||{{.{{,..,|,...{{{,..}}}|(|{{,||||,},,|||||,,,||.,({(,{({((.(({{..||,||{{||{||.||||||....,,},)))))}}{{{||}|||...|||}}}}}}),)}},}.|||}{||||{,|,,,|||||||,,},}},}}}},.,},,{||}}}}))).|||,,..}},.}},..,}}|,|}}}}}}))}})}}})|}||||||.|||,.,|,{{{{,...,,(({..{{.{..((((....{{.......})..))))..}.))..})))))),.},,),.,.,,},,,}},}}})}))},,..})))}})))),,))))))))),))),,||.,..||}}}.,}..))))))}}}}},|,|}}.))))))})}))}}},}}}}).})))}))))))))))..)).))).))))))..
Back