Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0012200
Sequence Length
2016 nt
GC Content
0.4251
CUCCCAAUAAUACAUGUGAUGAAAAUGCUUUCAUGUGCCAUAAUAAAGUAUGCAUUCCCAAGCAAUUUGUUUGUGACCAUGAUGACGACUGUGGAGAUGGCUCUGAUGAGUCACCGCAGUGUGGAUAUCGACAGUGUGGUACAGAAGAAUUUAGUUGUGCUGAUGGGCGGUGUCUUCUAAAUACUCAAUGGCAGUGUGAUGGAGACUUUGACUGUCCUGACCAUUCUGAUGAAGCACCUUUAAACCCAAAGUGUAAAAGUGCAGAACAGUCAUGCAACAGUUCAUUUUUUAUGUGCAAAAAUGGCAGGUGCAUUCCCAGUGGAGGUCUUUGCGACAAUAAGGAUGACUGUGGCGAUGGUUCAGAUGAGAGAAACUGCCAUAUAAAUGAAUGUUUGAGUAAGAAAGUCAGUGGAUGUUCUCAAGACUGUCAAGACCUUCCGGUCAGUUAUAAGUGCAAAUGCUGGCCUGGAUUCCAACUGAAGGAUGACGGCAAAACAUGUGUAGACAUUGAUGAAUGCUCUUCAGGCUUUCCCUGUAGCCAGCAAUGCAUCAAUACAUACGGGACUUACAAGUGCCUCUGUACAGAUGGGUAUGAAAUACAACCUGAUAACCCAAAUGGCUGCAAAUCGCUCUCAGAUGAAGAACCUUUUUUAAUUCUUGCUGAUCAUCAUGAGAUAAGGAAAAUUAGCACUGAUGGCUCCAACUACACACUUUUAAAACAGGGAUUAAACAAUGUUAUUGCUAUAGACUUUGAUUACAGAGAAGAAUUCAUCUAUUGGAUCGAUUCUAGCCGACCCAAUGGCAGUCGCAUAAAUAGAAUGUGUUUAAAUGGAAGUGACAUUAAGGUAGUUCAUAACACAGCGGUCCCCAAUGCACUUGCUGUCGAUUGGAUUGGAAAAAACCUCUAUUGGUCUGACACAGAAAAAAGAAUCAUUGAAGUAUCCAAACUCAAUGGCUUGUACCCUACUAUACUCGUUAGCAAAAGGCUGAAGUUUCCCAGAGACUUGUCUUUAGAUCCUCAAGCUGGAUAUUUGUAUUGGAUUGACUGCUGCGAGUAUCCUCAUAUUGGCCGUGUUGGAAUGGAUGGAACCAAUCAGAGUGUUGUCAUAGAAACCAAGAUUUCUAGACCUAUGGCACUAACAAUAGAUUAUGUUAAUCGUAGACUCUACUGGGCCGAUGAAAAUCACAUUGAAUUUAGCAACAUGGAUGGAUCUCAUAGACACAAAGUCCCUAAUCAAGAUAUUCCAGGGGUGAUUGCACUAACAUUGUUUGAAGACUACAUCUACUGGACUGAUGGGAAAACCAAGUCACUCAGCCGUGCCCAUAAAACAUCGGGAGCAGACAGACUCUCACUGAUUUACUCAUGGCAUGCCAUCACAGAUAUCCAGGUGUAUCAUUCUUAUAGACAACCUGAUGUCUCCAAACAUCUCUGCAUGAUAAAUAAUGGUGGUUGCAGUCAUUUGUGCCUUUUAGCCCCUGGAAAAACCCACACUUGUGCAUGUCCCACUAACUUCUAUCUGGCAGCUGAUAAUAGGACUUGCUUAUCCAACUGCACAGCCAGCCAGUUUCGUUGCAAAACUGACAAAUGUAUUCCAUUCUGGUGGAAAUGUGACACCGUGGAUGACUGUGGUGAUGGAUCUGAUGAACCUGAUGACUGUCCUGAAUUUAGAUGUCAGCCAGGCCGAUUUCAGUGUGGGACUGGACUCUGUGCUCUACCAGCUUUCAUCUGUGAUGGAGAGAAUGAUUGUGGAGACAAUUCUGAUGAACUCAACUGUGACACACAUGUCUGCCUGUCAGGUCAAUUCAAAUGUACCAAGAACCAGAAAUGUAUCCCAGUAAACUUAAGAUGUAAUGGGCAAGAUGACUGUGGUGAUGAGGAAGAUGAAAGAGACUGUCCUGAAAACAGCUGUUCUCCAGACUAUUUCCAGUGUAAGACUACGAAGCAUUGCAUUUCCAAGCUGUGGGUUUGUGACGAGGAUCCAGACUGUGCAGAUGCAUCAGACGAGGCCAACUGCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-530.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -572.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 692.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(........((.(((((.(((((..(((((....((((.(((......)))))))....))))).....))))).).)))))).......)((.((.(((((((((((.(((..((((((.(((((.(((.(((.(((((.((.......(((((...))))).(((((((((((((...((((((....).)))))...))))))....)))))))))))))).))).))).((((.((((.((.....)).)))).))))...((((((((.(.......(((((((.......)))))))(((((.((.((((....)))))).)))))........).))))))))(((...(((.(((((((..(.(((((((((........((((..(((.........((((((((((..((....((((((...(((((.(((((((.............)))))))(((...)))...))))).)))))).......(((((((...(((..((..(((..(((((((((((.((((((((......((((..((((...((.(((....))).))..))))..))))(((.((.....)))))............))))))))......((((((((((((((..........))))......))))).)))))...))))....))).)))).)))))))))))))))...............(((((((((((((.(((......(((((....))))).((((((.((((...)))).))))))..((((.((((((((((((((((.......))))).........(((((.((((..((..(((........)))...))..))))))))))))))).))))).)))).....(((......)))(((...)))....(((..(((((((.((......)))))))))))).((((((.....(((..(((((.....)))))))).....((.(((((((((..((((((((((...(((((((((((.(((.....))).))))))))))).....))))((((((((((.(((......))).))(((((...(((.((((((......)))))))))((((((...(((((........))))).))))))))))).(((((.(((((.......)))))..)))))))))))))..))))))...)))))...)))).))...............))))))...))).))))))))))))).))..))))))))))((((..(((.....))))))).....(.((((((........((((((((.((.....))))).)))))........)))))).).....(((((((.((((...((.........))..)))))))))))........))).))))........))))))))).)..))))))).))).....)))(((.(..(((((((((((((((((.(((.((((........(((((((((((....((((((((..(((((...((.((..((((..(((((...((((....((((((..((.((((((((((((((.........))))).)))))((.((.((.(.((.((....)).))).)).)).))...)))).))..))))))((((.((.((......)).)).))))....(((.((((((((.((((((((...))).)))))..))...))))))))).(((....)))....((((.((...((((.((((....((.(((((.......)).)))..))..)))).)))).)).))))..................))))...)))))))))..))))...)))))..))....))))))....))))))....)))))........))))...)))..........))))....)))).)))))))))....).)))))))).))))))..))).)))))))....)))).)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(........{(.(((({.((((({,{{{{{,,,,(((,{(((......)))))))....}}))}.,,}.})))),),}))))).......)((.((.(((((((((((.(((..((((((.(((((.(((..(((.(((,..,..((({,.,((((((..{.{.(((((((.(((((....,,((({{{{(((({,|..,||,|||.,{{{{{|||{{{{{,,{({{,.,,,.((((.(((,.{{..,,,)),)}}}.))})}|,||,||||,((.{((({{(((((((..{{((({{{..,|||..,||{,{,{{,||||||,}|||}|||.|||..}}}}}}}}}))).))}},||||||,.,,{,,|..}}}|||||......,.,,{((({{{,..{{.,(((,,,{|||,|}}}|,.|,||{||{.,,((((({(((((((..,........,,))))))),||}.,||....,}})),}|||||{,..{{{((((({{,{{(({,,{|,||{|||{(((({{{{{{,{{{{{{{|||,.,,||||..{(((.,.((.(((....))).)),.)))).,}}|(((({(...........,.}}.})))}..))))}}},.....}{((((((((({{{{..........||||,,.,..|}}}).))))}...}}},...,})),}))}||||}||,.,,,,,,...,,.....,}}}}}||||,,,,(((((.(((((({(.(((((....}}}}}.,{{{{{,{(((,,,||||{}||||}.,((({.{{{{{||{{{{{(({{,,,,...,||||||,..,||,{{|{{,{||,..||,.,||},,..,.{|{{{{{{.{{{{{|{|.|{{|||,|{{,|||.,|||.....,{{,,,.,,}}|(((...))),....,,..{(((((,,((......))))))))},},,,,.,,..,.|||,|}}.}|||}{(((((..(((((((...))))))))))))}..((((.......))))...})))))))...))))))))}|||},,.},,.,|}|}}||}}}}}}},.}}}}},,,.))))),))}||||,(((.((((((......)))))))))}}}})))).)}}}|...{{{{{|,,})}))||||,,}))))})))}}||||....,|{|||||,.|||,.{{.((((((((((.{{..((((((((.(((((,,..........{((((((((((((((((((|.((((((({|.,{{.....}}}.|||((((..(((.....)))})))...},|.((((((..,.....((((((((.((.....))))).))))).......,)))))).,.....(((((({{(((({,.,,,,.......}},.)))))))))))......{{,.,.,..,},}}))))))).}))}}))))))}.............}))))))))}.....(((....)))...(((((((..(((...(((.(((.(((((((.((((((..,,{{((({{.,,{((((,{{,,{(((,,{.,.{{{,.,,,,,.....,}},.,{{{,.}}||||}...}}}}.)),,,))))))}},||,{{.{,((.((....)).))}.}}.}}.)))))}........)))))))...))))))...)))))))))).))))).)))).))))..))..)))))))))).)).,}}}..,|{{(({,,,.))}}}}|||.,}}}.}}},.}}}||,}}}}}})),)))),)))))}}),,}}},,,}}}||||....,{{{..{{.{..((((....,{.......}}..))))..}.))..))))))),.)}))......},}})).))))))),....)))))))))))))).)))......{((((((..((....))..))))))}{{((((({...)))))).)})))..))))).))))))..))).))))))}...,)))).)).))
Back