Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0014200
Sequence Length
1665 nt
GC Content
0.4252
AUUCUUCUUGCUCUUGGAACCAAUUUGCUUGUUCCGCACAAAAAUGUAUUUCUAAGCAUUGGAUUUGUGAUGGAGAAGAUGACUGUGGGGAUGGGUUAGAUGAAAGUGACAGCAUUUGUGGUGCCAUAACCUGUGCUGCUGACAUGUUCAGCUGCCAGGGCUCUCGUGCCUGCGUGCCCCGACAUUGGCUUUGUGAUGGUGAAAGGGACUGUCCAGAUGGAAGCGAUGAGCUUUCCACAGCAGGCUGCGCUCCCAAUAAUACAUGUGAUGAAAAUGCUUUCAUGUGCCAUAAUAAAGUAUGCAUUCCCAAGCAAUUUGUUUGUGACCAUGAUGACGACUGUGGAGAUGGCUCUGAUGAGUCACCGCAGUGUGGAUAUCGACAGUGUGGUACAGAAGAAUUUAGUUGUGCUGAUGGGCGGUGUCUUCUAAAUACUCAAUGGCAGUGUGAUGGAGACUUUGACUGUCCUGACCAUUCUGAUGAAGCACCUUUAAACCCAAAGUGUAAAAGUGCAGAACAGUCAUGCAACAGUUCAUUUUUUAUGUGCAAAAAUGGCAGGUGCAUUCCCAGUGGAGGUCUUUGCGACAAUAAGGAUGACUGUGGCGAUGGUUCAGAUGAGAGAAACUGCCAUAUAAAUGAAUGUUUGAGUAAGAAAGUCAGUGGAUGUUCUCAAGACUGUCAAGACCUUCCGGUCAGUUAUAAGUGCAAAUGCUGGCCUGGAUUCCAACUGAAGGAUGACGGCAAAACAUGUGUAGACAUUGAUGAAUGCUCUUCAGGCUUUCCCUGUAGCCAGCAAUGCAUCAAUACAUACGGGACUUACAAGUGCCUCUGUACAGAUGGGUAUGAAAUACAACCUGAUAACCCAAAUGGCUGCAAAUCGCUCUCAGAUGAAGAACCUUUUUUAAUUCUUGCUGAUCAUCAUGAGAUAAGGAAAAUUAGCACUGAUGGCUCCAACUACACACUUUUAAAACAGGGAUUAAACAAUGUUAUUGCUAUAGACUUUGAUUACAGAGAAGAAUUCAUCUAUUGGAUCGAUUCUAGCCGACCCAAUGGCAGUCGCAUAAAUAGAAUGUGUUUAAAUGGAAGUGACAUUAAGGUAGUUCAUAACACAGCGGUCCCCAAUGCACUUGCUGUCGAUUGGAUUGGAAAAAACCUCUAUUGGUCUGACACAGAAAAAAGAAUCAUUGAAGUAUCCAAACUCAAUGGCUUGUACCCUACUAUACUCGUUAGCAAAAGGCUGAAGUUUCCCAGAGACUUGUCUUUAGAUCCUCAAGCUGGAUAUUUGUAUUGGAUUGACUGCUGCGAGUAUCCUCAUAUUGGCCGUGUUGGAAUGGAUGGAACCAAUCAGAGUGUUGUCAUAGAAACCAAGAUUUCUAGACCUAUGGCACUAACAAUAGAUUAUGUUAAUCGUAGACUCUACUGGGCCGAUGAAAAUCACAUUGAAUUUAGCAACAUGGAUGGAUCUCAUAGACACAAAGUCCCUAAUCAAGAUAUUCCAGGGGUGAUUGCACUAACAUUGUUUGAAGACUACAUCUACUGGACUGAUGGGAAAACCAAGUCACUCAGCCGUGCCCAUAAAACAUCGGGAGCAGACAGACUCUCACUGAUUUACUCAUGGCAUGCCAUCACAGAUAUCCAGGUGUAUCAUUCUUAUAGACAACCUGAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-445.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -479.26
Frequency: 0.0000
Diversity: 520.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((..((..(((.((((..((((((....(((......))).....)))))))))).)))..))..)))))))((.((((((((((((((.((.((((.(((.(((((.....(((......))).....))))).))).)))).))))).((((...(((....))).))))..(((((((.((((((((((.....((((.(((((.(.(((((((.....)).)))))...).))..))).)))).......(((((.((((......((((.(((((((((.....((((.(((((.((((((...)))))).))...........(((((((...((((((....)))))))))))))))).))))......)))))))))))))...(((((...))))).(((((((((((((...((((((....).)))))...))))))....)))))))((((..(((((((...((((.(((......)))))))....)).)))))..)))).((.(((((.(((((((..((((((((...(((...(((.......)))...)))))))).)))..)))))))))))).))..(((.((((.((((((...(((((((....))).(((.((((((........((((((((((..((....((((((...(((((.(((((((.............)))))))(((...)))...))))).)))))).......(((((((...(((..((..(((..(((((((((((.((((((((......((((..((((...((.(((....))).))..))))..))))(((.((.....)))))............))))))))......((((((((((((((..........))))......))))).)))))...))))....))).)))).)))))))))))))))...............(((((((((((((.(((......(((((....))))).((((((.((((...)))).))))))..((((.((((((((((((((((.......))))).........(((((.((((..((..(((........)))...))..))))))))))))))).))))).)))).....(((......)))(((...)))....(((..(((((((.((......)))))))))))).((((((.....(((..(((((.....)))))))).....((.(((((((((..((((((((((...(((((((((((.(((.....))).))))))))))).....))))((((((((((.(((......))).))(((((...(((.((((((......)))))))))((((((...(((((........))))).))))))))))).(((((.(((((.......)))))..)))))))))))))..))))))...)))))...)))).))...............))))))...))).))))))))))))).))..))))))))))((((..(((.....))))))))))))).))).(((..........))).)))).....)))))))))).))).)))).)))))))))))))))...))).))))..))))))))))).))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.{{{{{{(,,{(,{(((.((((..{(((((....{((......))).....}))))))))),||||,||,,|}}}}}|((.((((((((((((({,({.((({.(((.(((((,,...(((......}||,,.{,}||||,}}}.,))),),))),||({...(({{{{{||}.|||,..,,,,,||}((((,((((((....,,,|}|||||}},(((((((.....))}}})))..})}))}.}}},}}}}.......{{{{{,{{{{...,,|||||}|{||{((((.....,|||||}}||.||||||,,||}||||||,{{{{|,{,.{,(((((((...((((((....))))))))))))}||,,.,,,}.,}}.})))))}|||,,,.,,{{{{|,.,)))),.(((((((((((((...((((({....}.)))))...))))))....))))))){{{{,,{(({{,,...((((.(((,.,,..,,,)),),,,.))})}}}),.)))},((.(((({{(((((((..((((((((...{((...,,{,{{,,..}}),}.))}))))),}))..)))))))))))).)),||{||{({{.{{{{{{...{{{|||{....,}}.{{{.{(((({.....,,,((((((((((..((..{.((((((...(((((.(((((((..,........,,))))))){((...))}...))))).)))))),......(((((((...(((..{,..(((,.(((((((((((.((((((({||...,|{{(..((((...((.(((....))).)),.))))..))|(((({(...........,.}}.,)))}..))))))))......((((((((((((({..........,}}}......))))).)))))...))))....})).)))).)))}}}}}))))))),,|,......,},,.(((((((((((((.(((....,,(((((....}}|||,.,.{({{{((({{,{{||{|||||}.,(({,.|||||}}|,((.((.(((((..{{((((,{{..,{{,{,,{{,{||,..,|,,,|}},,....((((((((.((((((({.|{({(|,(({,|||.,,{{.....,{{......))|(((...))),...,{{..{((((({,((......))))))))},},.,,.,,..,,,,,.}}).|))}}|{((((..{((((((...))))))})))))}..((((.......)))}...|)))))))...)))))))).|||.,,,)}}.,{{{{{((,,{{{{({.({(......))).}},,((({{{(((.((((((......))))))))),,,{||}}}|{{((.,,,,,{,||}}}.}))))},,)))},,}))))}}}}..,,.)}))))..})))))),))}))))}}))))),,,})},.},,}}}|{({..............,)))},,,,.))).))))))))))))).))..)))))))))){{||..(((.....)))}))))))))},)}}.{{{.,.....,,,))}.))}}.....)))))}))))...,,}))).))}}})))))))))),.,)))})})),,}}}}}}}}}}}.}}...,,.,,
Back