Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0014700
Sequence Length
2431 nt
GC Content
0.4258
GUGAUAGUUAAAUCUGGGCCAGGGACUUUCCUCAGUUUGGCUGUUUAUGACAAUUAUAUAUUCUGGUCGGACUGGGGAAGAAGAGCUAUACUGCGGUCCAACAAGUACACAGGAGGAGAUACAAAAAUUCUUCGUUCCGAUAUUCCACAUCAGCCAAUGGGAAUCAUAGCUGUUGCCAAUGACACCAAUAGCUGUGAACUUUCUCCAUGUGCAUUAUUGAAUGGAGGCUGCCAUGACUUGUGCCUUUUAACUCCCAAUGGGAGAGUGAAUUGUUCCUGCAGAGGGGACCGAAUAUUGCUAGAGGACAACAGAUGUGUGACUAAAAAUUCCUCCUGCAACGCUUAUUCGGAGUUUGAAUGUGGAAAUGGUGAGUGCAUUGACUACCAGCUCACCUGUGAUGGCAUUCCUCACUGUAAAGAUAAAUCAGAUGAAAAACUGCUCUACUGUGAAAACAGAAGCUGUCGAAGAGGCUUCAAGCCAUGCUAUAAUCGCCGCUGCAUUCCUCAUGGCAAGUUAUGUGAUGGAGAAAAUGACUGCGGAGACAACUCUGAUGAAUUAGAUUGUAAAGUUUCAACCUGUGCCACGGUUGAGUUCCGCUGUGCAGAUGGGACUUGUAUUCCAAGAUCAGCACGAUGCAACCAGAACAUAGAUUGUGCAGAUGCUUCAGAUGAAAAGAACUGCAAUAACACAGACUGCACACAUUUCUAUAAGCUUGGAGUGAAAACCACAGGGUUCAUAAGAUGUAAUUCUACCUCACUGUGUGUUCUGCCAACCUGGAUAUGCGACGGGUCUAAUGACUGUGGAGACUAUUCAGAUGAAUUAAAGUGCCCAGUUCAAAACAAACACAAAUGUGAAGAAAAUUAUUUUAGUUGUCCUAGUGGAAGAUGCAUUUUGAAUACCUGGAUAUGCGAUGGUCAGAAAGAUUGUGAGGAUGGACGUGAUGAAUUCCACUGUGAUUCUUCUUGCUCUUGGAACCAAUUUGCUUGUUCCGCACAAAAAUGUAUUUCUAAGCAUUGGAUUUGUGAUGGAGAAGAUGACUGUGGGGAUGGGUUAGAUGAAAGUGACAGCAUUUGUGGUGCCAUAACCUGUGCUGCUGACAUGUUCAGCUGCCAGGGCUCUCGUGCCUGCGUGCCCCGACAUUGGCUUUGUGAUGGUGAAAGGGACUGUCCAGAUGGAAGCGAUGAGCUUUCCACAGCAGGCUGCGCUCCCAAUAAUACAUGUGAUGAAAAUGCUUUCAUGUGCCAUAAUAAAGUAUGCAUUCCCAAGCAAUUUGUUUGUGACCAUGAUGACGACUGUGGAGAUGGCUCUGAUGAGUCACCGCAGUGUGGAUAUCGACAGUGUGGUACAGAAGAAUUUAGUUGUGCUGAUGGGCGGUGUCUUCUAAAUACUCAAUGGCAGUGUGAUGGAGACUUUGACUGUCCUGACCAUUCUGAUGAAGCACCUUUAAACCCAAAGUGUAAAAGUGCAGAACAGUCAUGCAACAGUUCAUUUUUUAUGUGCAAAAAUGGCAGGUGCAUUCCCAGUGGAGGUCUUUGCGACAAUAAGGAUGACUGUGGCGAUGGUUCAGAUGAGAGAAACUGCCAUAUAAAUGAAUGUUUGAGUAAGAAAGUCAGUGGAUGUUCUCAAGACUGUCAAGACCUUCCGGUCAGUUAUAAGUGCAAAUGCUGGCCUGGAUUCCAACUGAAGGAUGACGGCAAAACAUGUGUAGACAUUGAUGAAUGCUCUUCAGGCUUUCCCUGUAGCCAGCAAUGCAUCAAUACAUACGGGACUUACAAGUGCCUCUGUACAGAUGGGUAUGAAAUACAACCUGAUAACCCAAAUGGCUGCAAAUCGCUCUCAGAUGAAGAACCUUUUUUAAUUCUUGCUGAUCAUCAUGAGAUAAGGAAAAUUAGCACUGAUGGCUCCAACUACACACUUUUAAAACAGGGAUUAAACAAUGUUAUUGCUAUAGACUUUGAUUACAGAGAAGAAUUCAUCUAUUGGAUCGAUUCUAGCCGACCCAAUGGCAGUCGCAUAAAUAGAAUGUGUUUAAAUGGAAGUGACAUUAAGGUAGUUCAUAACACAGCGGUCCCCAAUGCACUUGCUGUCGAUUGGAUUGGAAAAAACCUCUAUUGGUCUGACACAGAAAAAAGAAUCAUUGAAGUAUCCAAACUCAAUGGCUUGUACCCUACUAUACUCGUUAGCAAAAGGCUGAAGUUUCCCAGAGACUUGUCUUUAGAUCCUCAAGCUGGAUAUUUGUAUUGGAUUGACUGCUGCGAGUAUCCUCAUAUUGGCCGUGUUGGAAUGGAUGGAACCAAUCAGAGUGUUGUCAUAGAAACCAAGAUUUCUAGACCUAUGGCACUAACAAUAGAUUAUGUUAAUCGUAGACUCUACUGGGCCGAUGAAAAUCACAUUGAAUUUAGCAACAUGGAUGGAUCUCAUAGACACAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-673.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -722.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 634.98
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((...((((((....(((((((((((((((((((((..((((.......))))..).)))))))))))))))...(((.((((.((.(((...((((((.....((((((((.........)))))..)))............((((((.((((..((((((((((((..........))))))))))))..(((((((((..((((..(((....((((.(((((((.((((.(((((((..(((((...)))))..(((.(((((..(((((.((((((((((((((((..(((((..(((....)))..........)))))..))))....))))))).......((((.(....(((((((.............))))))).....).))))))))).)))))..))))).)))........((.(((...((((....)))).))).))..)))))))..)))).))))..............)))..))))....)))...)))).))))))))).......(((((....)))))....(((((.(((((....(((((((........))))))).(((((((((((((.((.(((((((.(((((((((.(((((((...............))))))).))).))).............(((........))).((((((((((((.(((((.((((..((....))..)))).)).)))))))))...((((((((((.((.(.((((((((..(((((((..(..((((((....)))).))..)..)))))))...((((((((((.....(((...(((........)))...)))...)))))))))).(((....)))....((((.((.(.....).)).))))..))).)))))).)).)))))).))))..(((.((((((((((..((((.(((((((((.(((.((((...((((...(((.((((...((.(.((((((.(((.......)))..))))))).))...)))).)))...((((........))))))))....)))).)))...((((.((.(((((.....))))).)))))).(((((((((((((..(((........)))((((.((((((.......))))))))))(((((((.....)).)))))..))))))((((((..........(((((((...........))))))).(((((..((((.(((........)))))))..))))).((((.......(((((((...((((((....)))))))))))))))))...(((.(((.(((((.((.......(((((...))))).(((((((((((((...((((((....).)))))...))))))....)))))))))))))).))).))).((((.(((......)))))))...))))))((((.(((..((.(((((.(((((((..((((((((...(((...(((.......)))...)))))))).)))..)))))))))))).))))).))))..)))))))((((...(((....)))...))))))))))))))))))))))).)))))))...((((((...(((((.(((((((.............)))))))(((...)))...))))).))))))........))))))..((((((((.((((((.((((.....)))).))..)))).).))))))).......)))..))))))).))))))))))).)))).......))))).)))))..))))..))))))...((((((.....(((((..(((((.(((((((((((..((((((((.(...(((......)))...))))))).))...................))))))))))).(((((((((.((((...(((((....))))).((((((.((((...)))).)))))).(((........)))...(((((.......))))).....)))).))))))))))))))..))))).....))))))..(((((.((.(((....))).)).))))).....(((......)))(((...)))..........((((((.((......))))))))))))))))).)).))))))).(((((.....))))))))))))))))))))(((((..((((((((((...(((((((((((.(((.....))).))))))))))).....))))((((((((((.(((......))).))(((((...(((.((((((......)))))))))((((((...(((((........))))).))))))))))).(((((.(((((.......)))))..)))))))))))))..))))))...))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,(.{(({,(({.((.(((({,,{(((((((((((((((((..((((,...,},)),)..,.)))))))))))))))}.,{{((,,,.,{|}||}|}.....,..}.}}|({((({,........,)))))((((((.((((((((({..((((((((((.((((((((((((..........))))))))))))....{((((((...{{....}}.))))))|..{(((({.,{{(,{{{{{{,..(((((...)))||,,(((.(((((,,({{{{.{|||,(((((((((((..(((((..{{{....}}}..........)))))..))))....))))))).....{(((((.{....(((((((.............)))))))..}..}.))))))}||{|}|||..|},,,.}||,.......,|,{||.,.|{||....))}|,|||,,,..,}}}))),,)}||{|||},......{.((((.((((({,((((.(({.....))).)))),)},,})).).)))).}((((.(((({....})))))))).....{((((((.,......))))))}.,||,(((((((((.((.(((((((.(((,,{(((.(((((((...............))))))).))).}||{....,.......{((........}}}.((((((((((((.{({((.((((..((....))..)))).)).}}})))))}...((((((((((.((.(.((((((((..(((((((..(..({((((....)))),}},.}..)))))))...{(((((((({.....(((,..{{{..,.....})),..}}}...}}))))}}}}.(((....))}.,,.{{{{,||.{.....},)).)})),.))).)))))}.)).)))))).))))..(((.((((((((({,.{(((.(((((((((.,.((((((..,,,(({.((((((((((((((((........)))))...)))))).))))}}}}(((((((({(((((({({{(,,{({{,(({.{{{(({,{,{(({,|,...,||((.((.(((({.....))))).))))||{,...(({((((((..(((........)))((((.((((((.......)))))))))){((((((.....))))))))..)))))).)}),.}}}.......{|{|||{||.....,}}}))))|}},|{{{......|}}|)))}}}},,{{{{{{|.||||||,{{{({,{{.{{(((((((...((((((....)))))))))))))|}.....}),.}}.,)))))}}|},.,}}}|{{{|..,}))}}.(((((((((((((...((((({....}.)))))...))))))....))))))),,,}}}|||},..,,.((((.((({.((.....)).)))).))))...}))))))}((.(((({{(((((((..((((((((...{((...,,{,{{,,..}}),}.))}))))),}))..)))))))))))).))}}))))))..,,,..,,{{{{...(({....}))...)))}))))))))))))))))))).))))))).{.((((((...(((((.(((((((..,........,,))))))){((...))}...))))).)))))),......,))))))..(((((((..(((({{.((((.....)))).))..)))).}.)))))))......})))..))))))).))))))))))).{(((({{...........}.}}.,)))}.,}))}}}}},.}}))|}}},,(((((..({{{{.,{{{{{{{{((,{{{({{{{,|,.,.,.,.}}..,})}}},,}}}}}},}},,..,,..,,,,,,,....|}}|}}}}}},.{(((({(({,((((...(((((....))))).,((({,,{(((,,{||}|{||||}}.{{{|...,.,})))}}}|||||.,,,,,.,)})))}}..}))),})))}))}}}})))..))))}..,.((((((((.((((((((.,(((({.(((.{{{..,((.....,{{,,,...})|(((...)))}...,||..{((((({,((......))))))))},}},,..,,..,,,,,.))).})))){(((((..(((((((...))))))))))))}..((((.......))))...})))))))...)))))))).},,,.}})},.,)))))).)))}}))))))..)))))).....,{((({{{(((.((((((......))))))))){{{{||}}}|{{{{...,,,,,}}})).)))))),)))).)))).))|||,...})),}.{{|.,||||}}..}}}...{{..|{|...)))..)),..
Back