Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0015300
Sequence Length
2626 nt
GC Content
0.4334
AUGUGGGUUCUGUGGAAGGACUUGCCUAUCACAGAGCCUGGGAUACACUGUACUGGACAAGCUCUACCACCUCAUCCAUCACCAGACACACUGUGGACCAGACUCGGCCUGGAGCAUUUGACAGGGAAGCUGUCAUCACCAUGUCAGAAGAUGACCAUCCACAUGUGCUAGCCUUGGAUGAAUGUCAAAAUUUAAUGUUUUGGACCAACUGGAAUGAACAACAUCCAAGUAUCAUGAGAUCUACUCUGACUGGGAAAAAUGCUCAAGUGGUGGUCAGUACAGACAUACUCACUCCAAAUGGACUUACUAUCGACUACCGUGCAGAGAAGCUGUAUUUCUCAGAUGGCAGUCUAGGAAAAAUUGAAAGGUGUGAAUACGAUGGAUCCCAGAGACAUGUGAUAGUUAAAUCUGGGCCAGGGACUUUCCUCAGUUUGGCUGUUUAUGACAAUUAUAUAUUCUGGUCGGACUGGGGAAGAAGAGCUAUACUGCGGUCCAACAAGUACACAGGAGGAGAUACAAAAAUUCUUCGUUCCGAUAUUCCACAUCAGCCAAUGGGAAUCAUAGCUGUUGCCAAUGACACCAAUAGCUGUGAACUUUCUCCAUGUGCAUUAUUGAAUGGAGGCUGCCAUGACUUGUGCCUUUUAACUCCCAAUGGGAGAGUGAAUUGUUCCUGCAGAGGGGACCGAAUAUUGCUAGAGGACAACAGAUGUGUGACUAAAAAUUCCUCCUGCAACGCUUAUUCGGAGUUUGAAUGUGGAAAUGGUGAGUGCAUUGACUACCAGCUCACCUGUGAUGGCAUUCCUCACUGUAAAGAUAAAUCAGAUGAAAAACUGCUCUACUGUGAAAACAGAAGCUGUCGAAGAGGCUUCAAGCCAUGCUAUAAUCGCCGCUGCAUUCCUCAUGGCAAGUUAUGUGAUGGAGAAAAUGACUGCGGAGACAACUCUGAUGAAUUAGAUUGUAAAGUUUCAACCUGUGCCACGGUUGAGUUCCGCUGUGCAGAUGGGACUUGUAUUCCAAGAUCAGCACGAUGCAACCAGAACAUAGAUUGUGCAGAUGCUUCAGAUGAAAAGAACUGCAAUAACACAGACUGCACACAUUUCUAUAAGCUUGGAGUGAAAACCACAGGGUUCAUAAGAUGUAAUUCUACCUCACUGUGUGUUCUGCCAACCUGGAUAUGCGACGGGUCUAAUGACUGUGGAGACUAUUCAGAUGAAUUAAAGUGCCCAGUUCAAAACAAACACAAAUGUGAAGAAAAUUAUUUUAGUUGUCCUAGUGGAAGAUGCAUUUUGAAUACCUGGAUAUGCGAUGGUCAGAAAGAUUGUGAGGAUGGACGUGAUGAAUUCCACUGUGAUUCUUCUUGCUCUUGGAACCAAUUUGCUUGUUCCGCACAAAAAUGUAUUUCUAAGCAUUGGAUUUGUGAUGGAGAAGAUGACUGUGGGGAUGGGUUAGAUGAAAGUGACAGCAUUUGUGGUGCCAUAACCUGUGCUGCUGACAUGUUCAGCUGCCAGGGCUCUCGUGCCUGCGUGCCCCGACAUUGGCUUUGUGAUGGUGAAAGGGACUGUCCAGAUGGAAGCGAUGAGCUUUCCACAGCAGGCUGCGCUCCCAAUAAUACAUGUGAUGAAAAUGCUUUCAUGUGCCAUAAUAAAGUAUGCAUUCCCAAGCAAUUUGUUUGUGACCAUGAUGACGACUGUGGAGAUGGCUCUGAUGAGUCACCGCAGUGUGGAUAUCGACAGUGUGGUACAGAAGAAUUUAGUUGUGCUGAUGGGCGGUGUCUUCUAAAUACUCAAUGGCAGUGUGAUGGAGACUUUGACUGUCCUGACCAUUCUGAUGAAGCACCUUUAAACCCAAAGUGUAAAAGUGCAGAACAGUCAUGCAACAGUUCAUUUUUUAUGUGCAAAAAUGGCAGGUGCAUUCCCAGUGGAGGUCUUUGCGACAAUAAGGAUGACUGUGGCGAUGGUUCAGAUGAGAGAAACUGCCAUAUAAAUGAAUGUUUGAGUAAGAAAGUCAGUGGAUGUUCUCAAGACUGUCAAGACCUUCCGGUCAGUUAUAAGUGCAAAUGCUGGCCUGGAUUCCAACUGAAGGAUGACGGCAAAACAUGUGUAGACAUUGAUGAAUGCUCUUCAGGCUUUCCCUGUAGCCAGCAAUGCAUCAAUACAUACGGGACUUACAAGUGCCUCUGUACAGAUGGGUAUGAAAUACAACCUGAUAACCCAAAUGGCUGCAAAUCGCUCUCAGAUGAAGAACCUUUUUUAAUUCUUGCUGAUCAUCAUGAGAUAAGGAAAAUUAGCACUGAUGGCUCCAACUACACACUUUUAAAACAGGGAUUAAACAAUGUUAUUGCUAUAGACUUUGAUUACAGAGAAGAAUUCAUCUAUUGGAUCGAUUCUAGCCGACCCAAUGGCAGUCGCAUAAAUAGAAUGUGUUUAAAUGGAAGUGACAUUAAGGUAGUUCAUAACACAGCGGUCCCCAAUGCACUUGCUGUCGAUUGGAUUGGAAAAAACCUCUAUUGGUCUGACACAGAAAAAAGAAUCAUUGAAGUAUCCAAACUCAAUGGCUUGUACCCUACUAUACUCGUUAGCAAAAGGCUGAAGUUUCCCAGAGACUUGUCUUUAGAUCCUCAAGCUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-745.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -795.12
Frequency: 0.0000
Diversity: 672.81
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((((((((.(((.....))).))))))))))((((.....(((((((((.......(((((((.(((((((...(.((.((((.((((((((((.......))))......((((((.....)))))).......((((.....))))..)))))))))))).)...)))))))...(((((((.....)))))))....((((((.((.....))))).))).(((.(((.....)))))).((((.......)))).)))))))))))))))).....)))).(((...((((((..(((((.......((((((.....))))))......))))).)))))))))....((((((((((((....(..(((..(((((((((........)))...)))))))))..)..(((((((((((((((((..((((.......))))..).))))))))))))))))..(((((((..(((..(((..........(((.(((((.((.((((.(((((((((..((..........((((((.((((..((((((((((((..........))))))))))))..(((((((((..((((..(((....((((.(((((((.((((.(((((((..(((((...)))))..(((.(((((..(((((.((((((((((((((((..(((((..(((....)))..........)))))..))))....))))))).......((((.(....(((((((.............))))))).....).))))))))).)))))..))))).)))........((.(((...((((....)))).))).))..)))))))..)))).))))..............)))..))))....)))...)))).))))))))).......(((((....)))))....(((((.(((((....(((((((........))))))).(((((((((((((.((.(((((((.(((((((((.(((((((...............))))))).))).))).............(((........))).((((((((((((.(((((.((((..((....))..)))).)).)))))))))...((((((((((.((.(.((((((((..(((((((..(..((((((....)))).))..)..)))))))...((((((((((.....(((...(((........)))...)))...)))))))))).(((....)))....((((.((.(.....).)).))))..))).)))))).)).)))))).))))..(((.((((((((((..((((.(((((((((.(((.((((...((((...(((.((((...((.(.((((((.(((.......)))..))))))).))...)))).)))...((((........))))))))....)))).)))...((((.((.(((((.....))))).)))))).(((((((((((((..(((........)))((((.((((((.......))))))))))(((((((.....)).)))))..))))))((((((..........(((((((...........))))))).(((((..((((.(((........)))))))..))))).((((.......(((((((...((((((....)))))))))))))))))...(((.(((.(((((.((.......(((((...))))).(((((((((((((...((((((....).)))))...))))))....)))))))))))))).))).))).((((.(((......)))))))...))))))((((.(((..((.(((((.(((((((..((((((((...(((...(((.......)))...)))))))).)))..)))))))))))).))))).))))..)))))))((((...(((....)))...))))))))))))))))))))))).)))))))...((((((...(((((.(((((((.............)))))))(((...)))...))))).))))))........))))))..((((((((.((((((.((((.....)))).))..)))).).))))))).......)))..))))))).))))))))))).)))).......))))).)))))..))))..))))))..........)).)))))))))..)))).)).))))).)))...(((....)))..)))......)))...)))))))....))))).)))))))((((..(......)..)))).((((((..(((((((....))))).((((((.((((...)))).))))))..((((.((((((((((((((((.......))))).........(((((.((((..((..(((........)))...))..))))))))))))))).))))).)))).....(((......)))(((...)))....(((..(((((((.((......))))))))))))(((........)))))..))))))(((((..(((((((...)))))))))))))).))((.......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.{(((((((((((.(((.....))).))))))))))}(((.{{{.(((((((((.......(((((((.(((((((...,.((.((((.((((((((((.......)))).,....((((((.....))))))....,..((((.....))))..)))))))))))).}...)))))))..{(((((((.....))))))},}..((((({,((.....)))))},)).{{{.(((.....)))))}.{{{{.......)))}.)))))))))))))))).....,||,.(((...,|||{{..{(({,(({{.{{(({({(,,,..}}}}}),||||.|||}}.})))}}|||.....,{(((((({{{....{..(((..(((((((((........)))...)))))))))..|..{((((((((((((((((..((((,...,},)),)..,.)))))))))))))))}..((((,{{..((({{{({,....,..{,((((,{((({{,.,,...,{({((({{|,{{,,.,,{.{,,{{{{{{.{(((,,((((((((((((..........))))))))))))...||((((((.,|{{..,,}},}))}}}|.,({((((.((((.(((((((..(((((...)))))..{((.(((((..(((((.((((,(((((((((((..(((((..{{{....}}}..........)))))..))))....))))))).....,{((((.{....(((((((.............)))))))..}..}.))))))))).)))))..))))).)))........{{.(((...((((....)))).))).}}..)))))))..)))).))))}......,.{{{{.|||{{|,||{{.{|{.....))).))))}))},,}}.}.)))),||{{,.{{{{{....|)}}}}))}...,}|||{{||}}},...,|))))},..|||(((((((((.((.(((((((.(((.,{(((.(((((((...............))))))).))).}||{....,.......{((........}}}.((((((((((((.(({((.((((..((....))..)))).)).})}))))))...((((((((((.((.(.((((((((..(((((((..(..({((((....)))),}},.}..)))))))...{(((((((({.....(((,..{{{..,.....})),..}}}...}}))))}})}.(((....))}.,,.{{{{,||.{.....},)).)})),.))).)))))).)).)))))).))))..(((.((((((((((,.{(((.(((((((((.,.((((((..,,,(({.((((((((((((((((........)))))...)))))).))))}}}}(((((((({(((((({({{(,,{({{,(({.{{{(({,{,{(({,|,...,||((.((.(((({.....))))).))))||{,...(({((((((..(((........)))((((.((((((.......)))))))))){((((((.....))))))))..)))))).)}),.}}}.......{|{|||{||.....,}}}))))|}},|{{{......|}}|)))}}}},,{{{{{{|.||||||,{{{({,{{.({(((((((...((((((....))))))))))))}|}.....}),.}}.,)))))}||},.,}}}|{{{|..,}))},.(((((((((((((...((((({....}.)))))...))))))....))))))),,,}}}|||},..,,.((((.((({.((.....)).)))).))))...})))))))((.(((({{(((((((..((((((((...{((...,,{,{{,,..}}),,.))}))))),}))..)))))))))))).))}}))))))..,,,..,,{{{{...(({....}))...)))}))))))))))))))))))).))))))).{.((((((...(((((.(((((((..,........,,))))))){((...))}...))))).)))))),......,))))))..(((((((..(((({{.((((.....)))).))..)))).}.)))))))......,)))..))))))).))))))))))).|||{{,{....,,},,.,},}}..))))..}))))),,..,.}}|}}|.,||||||,|,,}}}},,,.})))||}||,|||||.}},}}...|}}..,}}|}},.,,})}}})),...,,}}||||||||,{{{{.,{......,.,||||{((((((,.{,(((((....))))).((((({.((((...}))).))))))..(({{.{{{||||||||{|||{...,,..,)}))}},...}}}|||||.||||..||},|||.,,.....}}},,,}},,|||}}|}}}}}}))),))))).)))).....,{(......))|(((...)))}....,|..{((((({,((......))))))))},,}|||,,,..,,,...,,..)))},{(((((..{((((((...)))))))))))))}.))((.......))
Back