Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0017600
Sequence Length
1075 nt
GC Content
0.4260
GUGAUAGUUAAAUCUGGGCCAGGGACUUUCCUCAGUUUGGCUGUUUAUGACAAUUAUAUAUUCUGGUCGGACUGGGGAAGAAGAGCUAUACUGCGGUCCAACAAGUACACAGGAGGAGAUACAAAAAUUCUUCGUUCCGAUAUUCCACAUCAGCCAAUGGGAAUCAUAGCUGUUGCCAAUGACACCAAUAGCUGUGAACUUUCUCCAUGUGCAUUAUUGAAUGGAGGCUGCCAUGACUUGUGCCUUUUAACUCCCAAUGGGAGAGUGAAUUGUUCCUGCAGAGGGGACCGAAUAUUGCUAGAGGACAACAGAUGUGUGACUAAAAAUUCCUCCUGCAACGCUUAUUCGGAGUUUGAAUGUGGAAAUGGUGAGUGCAUUGACUACCAGCUCACCUGUGAUGGCAUUCCUCACUGUAAAGAUAAAUCAGAUGAAAAACUGCUCUACUGUGAAAACAGAAGCUGUCGAAGAGGCUUCAAGCCAUGCUAUAAUCGCCGCUGCAUUCCUCAUGGCAAGUUAUGUGAUGGAGAAAAUGACUGCGGAGACAACUCUGAUGAAUUAGAUUGUAAAGUUUCAACCUGUGCCACGGUUGAGUUCCGCUGUGCAGAUGGGACUUGUAUUCCAAGAUCAGCACGAUGCAACCAGAACAUAGAUUGUGCAGAUGCUUCAGAUGAAAAGAACUGCAAUAACACAGACUGCACACAUUUCUAUAAGCUUGGAGUGAAAACCACAGGGUUCAUAAGAUGUAAUUCUACCUCACUGUGUGUUCUGCCAACCUGGAUAUGCGACGGGUCUAAUGACUGUGGAGACUAUUCAGAUGAAUUAAAGUGCCCAGUUCAAAACAAACACAAAUGUGAAGAAAAUUAUUUUAGUUGUCCUAGUGGAAGAUGCAUUUUGAAUACCUGGAUAUGCGAUGGUCAGAAAGAUUGUGAGGAUGGACGUGAUGAAUUCCACUGUGAUUCUUCUUGCUCUUGGAACCAAUUUGCUUGUUCCGCACAAAAAUGUAUUUCUAAGCAUUGGAUUUGUGAUGGAGAAGAUGACUGUGGGGAUGGGUUAGAUGAAAGUGACAGCAUUUGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-292.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -313.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 319.34
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((.((.((..((((((.(((.(((((((((((((((((((((..((((.......))))..).))))))))))))))).....((......))))))).(((((((....((((((((.........)))))..)))....((((.(((......)))))))((((((((((((..........))))))))))))..(((((((((..((((..(((....((((.(((((((.((((.(((((((..(((((...)))))..(((.(((((..(((((.((((((((((((((((..(((((..(((....)))..........)))))..))))....))))))).......((((.(....(((((((.............))))))).....).))))))))).)))))..))))).)))........((.(((...((((....)))).))).))..)))))))..)))).))))..............)))..))))....)))...)))).)))))))))......((((((((((.(((((....))))))))).....(((((((........)))))))))))))(((((((.(((((......)))))..(((.(((((((...............))))))).)))..(((....))).....(((........))).)))))))...(((((..(((..((((.(((...((((((((((((...(((....((((((((((.((.(.((((((((..(((((((..(..((((((....)))).))..)..)))))))...((((((((((.....(((...(((........)))...)))...)))))))))).(((....)))....((((.((.(.....).)).))))..))).)))))).)).)))))).))))))).)))))..)).))))).))))))).)))..)))))......)))))))(((.((((...((.(.((((((.(((.......)))..))))))).))...)))).)))))).))))))..)).)).)).((....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((.((.((..((((((.(((.(({((((((((((((((((((..((((,...,},)),)..,.))))))))))))))),....((......|}||}}},,,.....((((((..(((((........{({(((({,,{{{{,{{({(({......,|{({{{((((((((((((..........))))))))))))...}||{||||,}},|.,}}}}}))))))|..({((((.((((.(((((((..(((((...)))))..{((.(((((..(((((.((({,(((((((((((..(((((..{{{....}}}..........)))))..))))....))))))).....,{((((.{.,..(((((((.............))))))).,}..,.))))))))).)))))..))))).)))........{{.(((...((((....)))).))).}}..)))))))..)))).))))}......{.({{{.{{{{{|,{{{{.{|{.....))).)))),)},,})).}.)))),}|{{{.(((({....)))))))))...}))))..)))))){{{{{||||||||||||{{{,{||.|||||}}|.,,|||||{{{{{.((({{{{,,..........,.,}}|||||,|}}.,{{{....,,...,..{||,,......}},.))))))},,,{{|{{..,,|,|||||||....,((((((({(({{..,({({...((((((((((.((.(.((((((((..(((((((..(..({((((....)))),}},.}..)))))))...{((({{{(({....,(((,..{{{..,.,...})),..}}}...}}))))}}}}.(((....))}.,,.{{{{,||.,.....},)).)}}),.))).)))))}.)).)))))).))))}}}.}}}}}.,}}.))))).}|||||||}}||,}|||}||{,..,{(((||{{{{((({,,,{|||.....,},))))),,.))))}),}}))))))},,})))))),..))).))))))..}}.)).)).({....))
Back