Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0017800
Sequence Length
2376 nt
GC Content
0.4314
GUAACAUAUAUUGGACAGAUCAUGGUUUCAACUUAAUUGAAGUUGCAAGACUCAAUGGUUCUUUCCGUUAUGUAAUUAUUUCCCAAGGCCUGGAUCAACCAAGAUCUAUAGCUGUGCACCCAGAGAAAGGCCUCUUGUUCUGGACUGAAUGGGGACAAAUGCCCUGUAUUGGAAAGGCUCGCUUGGAUGGCUCAGAGAAGGUUGUCCUUGUAAGCAUGGGAAUAGCAUGGCCGAAUGGCAUCUCCAUCGACUAUGAGGAAAAUAAAUUGUACUGGUGUGAUGCUCGCACAGACAAGAUAGAGAGAAUCGACCUUGAGACUGGAGGGAAUCGCGAGAUGGUGCUGUCAGGAAGCAAUGUGGAUAUGUUUUCAGUUGCAGUCUUUGGGGCUUACAUCUACUGGUCUGACAGAGCACAUGCAAACGGGUCUGUCAGAAGGGGCCACAAGAAUGAUGCCACAGAAACGAUAACCAUGAGAACCGGCCUUGGAGUCAACCUGAAGGAGGUUAAAAUAUUUAACCGAGUAAGAGAGAAAGGGACCAAUGUUUGUGCCAGGGACAAUGGUGGCUGUAAGCAACUCUGUCUUUAUCGAGGAAAUUCCCGGAGAACUUGUGCUUGUGCCCAUGGAUAUUUGGCAGAAGAUGGAGUUACUUGCCUGAGGCAUGAAGGCUAUUUACUGUAUUCAGGAAGAACAAUAUUAAAAAGUAUACAUCUUUCUGAUGAAACCAAUUUAAAUUCCCCAAUAAGGCCAUAUGAGAAUCCACGUUAUUUCAAGAAUGUCAUAGCCUUGGCUUUUGACUAUAAUCAAAGAAGAAAAGGUACCAACCGAAUCUUUUACAGUGAUGCACACUUUGGAAAUAUACAGCUUAUUAAAGACAACUGGGAAGACAGACAAGUAAUUGUUGAAAAUGUGGGUUCUGUGGAAGGACUUGCCUAUCACAGAGCCUGGGAUACACUGUACUGGACAAGCUCUACCACCUCAUCCAUCACCAGACACACUGUGGACCAGACUCGGCCUGGAGCAUUUGACAGGGAAGCUGUCAUCACCAUGUCAGAAGAUGACCAUCCACAUGUGCUAGCCUUGGAUGAAUGUCAAAAUUUAAUGUUUUGGACCAACUGGAAUGAACAACAUCCAAGUAUCAUGAGAUCUACUCUGACUGGGAAAAAUGCUCAAGUGGUGGUCAGUACAGACAUACUCACUCCAAAUGGACUUACUAUCGACUACCGUGCAGAGAAGCUGUAUUUCUCAGAUGGCAGUCUAGGAAAAAUUGAAAGGUGUGAAUACGAUGGAUCCCAGAGACAUGUGAUAGUUAAAUCUGGGCCAGGGACUUUCCUCAGUUUGGCUGUUUAUGACAAUUAUAUAUUCUGGUCGGACUGGGGAAGAAGAGCUAUACUGCGGUCCAACAAGUACACAGGAGGAGAUACAAAAAUUCUUCGUUCCGAUAUUCCACAUCAGCCAAUGGGAAUCAUAGCUGUUGCCAAUGACACCAAUAGCUGUGAACUUUCUCCAUGUGCAUUAUUGAAUGGAGGCUGCCAUGACUUGUGCCUUUUAACUCCCAAUGGGAGAGUGAAUUGUUCCUGCAGAGGGGACCGAAUAUUGCUAGAGGACAACAGAUGUGUGACUAAAAAUUCCUCCUGCAACGCUUAUUCGGAGUUUGAAUGUGGAAAUGGUGAGUGCAUUGACUACCAGCUCACCUGUGAUGGCAUUCCUCACUGUAAAGAUAAAUCAGAUGAAAAACUGCUCUACUGUGAAAACAGAAGCUGUCGAAGAGGCUUCAAGCCAUGCUAUAAUCGCCGCUGCAUUCCUCAUGGCAAGUUAUGUGAUGGAGAAAAUGACUGCGGAGACAACUCUGAUGAAUUAGAUUGUAAAGUUUCAACCUGUGCCACGGUUGAGUUCCGCUGUGCAGAUGGGACUUGUAUUCCAAGAUCAGCACGAUGCAACCAGAACAUAGAUUGUGCAGAUGCUUCAGAUGAAAAGAACUGCAAUAACACAGACUGCACACAUUUCUAUAAGCUUGGAGUGAAAACCACAGGGUUCAUAAGAUGUAAUUCUACCUCACUGUGUGUUCUGCCAACCUGGAUAUGCGACGGGUCUAAUGACUGUGGAGACUAUUCAGAUGAAUUAAAGUGCCCAGUUCAAAACAAACACAAAUGUGAAGAAAAUUAUUUUAGUUGUCCUAGUGGAAGAUGCAUUUUGAAUACCUGGAUAUGCGAUGGUCAGAAAGAUUGUGAGGAUGGACGUGAUGAAUUCCACUGUGAUUCUUCUUGCUCUUGGAACCAAUUUGCUUGUUCCGCACAAAAAUGUAUUUCUAAGCAUUGGAUUUGUGAUGGAGAAGAUGACUGUGGGGAUGGGUUAGAUGAAAGUGACAGCAUUUGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-666.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -712.50
Frequency: 0.0000
Diversity: 732.43
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...(((((.((((.((((((((((((((((((.....))))))..)))))..)))).))).)))).))))).......(((((.(((.((((((......))))))..)))......((((((.(((....))).)))))).((((((((((.(....))))))).))))....(((.((..((((((((.......))))))))..)).))).)))))((((((((((...(((((((((((((.....................(((((..((((((.(((...(((.((((...((.....))...))))...)))..))).))))))....)))))..((..((((.(((((((((..(((((((((((..((.((((.(((.....(((..((((((((((((.(.(........)).)))))))).....))))..))).....))).)))).))..))))..))))))).(((((((((((.(((((.....)))))............(((..((((.(((.....((((.(((((.......))))).)))).(((...)))...))).))))..))).(((...)))..((((((((...(((.((((...........)))).)))...))))).)))((((.........))))............(((((((((...(((((....)))))...)))))))))..............))))).....))))))........))))))))).))))..))..((((.(((....)))..)))).........((((((...(((....)))...)))))).((((((((((((...((((...(((((((((...........(((......)))((((....)))).........(((((((((((.(((.....))).)))))))))))(((.....(((((((((.......(((((((.(((((((...(.((.((((.((((((((((.......))))......((((((.....)))))).......((((.....))))..)))))))))))).)...)))))))...(((((((.....)))))))....((((((.((.....))))).))).(((.(((.....)))))).((((.......)))).)))))))))))))))).....))).(((...((((...............))))...))))))))))))((((.((((....)))).)))).....((((((((((.......(((..(((((((((........)))...))))))))).(((((((((((((((((((((..((((.......))))..).))))))))))))))).....((......)))))))......))))).((((((((.........)))))..)))....((((.(((......)))))))((((((((((((..........)))))))))))).))))))))))))))))))))).))))))).))))))...(((.(((((((..(((((...)))))..(((.(((((..(((((.((((((((((((((((..(((((..(((....)))..........)))))..))))....))))))).......((((.(....(((((((.............))))))).....).))))))))).)))))..))))).)))........((.(((...((((....)))).))).))..)))))))..)))))))))))))...(.((((.((((((.((((.(((.....))).)))).))..))).).)))).)((((.(((((....))))))))).((((((((..((((((..(((.......)))..)))))).)))))))).(((((((((....(((...))).........(((((.(((((((....(((....))).....(((........))).)))))))....)))))...)))))))))...))((((((((((((...((.((((((..((((((.((((.((((.(((..(((((((..(..((((((....)))).))..)..))))))).((((((.........))))))..(((((..(((.(((..(((((..((((((...(((....((((((.(.(((..(((....((.(((...((((.((..((((..((.(((.((((...........))))))).))..))))))))))))).))...)))..))).).)))))))))))))))..)))))..))))))..)))))..))))))).)).)).))))))..)))))).))....))))..)).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.,{((({{.((((.((((((((((({((((((.....))))))..})))},.)))),})).)))).)))))...,...{{{{{,(((,((((((......)))))}..}||.,....{||{{|.,||,,,,|||,||||||.,{{,((((((.{....,)))))).}||}....(((.((..((((((((.......))))))))..)).))).}||}}((((((((((...((((((((((((({,...,,,.,,....,...{(((.((,,(((((...}))))))))))|,.,.((,,,,.||,.{{{{|...||,}}}}|.||(||,.,,||{|{|,.((..((((.(((((((((..(((((((((((..((.((((.(((.,.{{(((..((((((((((((.(.(........)).)))))))),...,})))..))}.}),.))).)))).))..))))..})))))).((((((({{{{.,.{({...,,.((((((,...,)))))),{,,{{{{,,{,..{{,(({{.{{(((,|.|,|,|}}}}.}}}},(({.,,||},.}}}},|||},.,((.(({...)))))|||{{{{{...(({.(({{,{.......,})))).))).,,))))}.|}|((({..}},,.,.}}}).,,,,.,,,|..(((((((((...(((((....)))))...)))))))))......,,..,,..}}})),,...})))))........))))))))).})))..}}..||||.,{({{|,}||{{{{|,.....}}},|{{{|{...|||....}}),..)))))).((((((((((((...((({...,,,{{{(({......,....(((......))){{{{....))))},....,,,{((((((((((.(((.....))).))))))))))|(((.....(((((((((.......(((((((.(((((((...,.((.((((.((((((((((.......)))).,....((((((.....))))))....,..((((.....))))..)))))))))))).}...)))))))..{(((((((.....))))))},}..((((({,((.....)))))},)).{{{.(((.....)))))}.{{|{.......)))}.))))))))))))))))...,.}}},,(({...{|||.,..{{,,,{,,,.||||,,.|||||}))))))||||},|}|}}.}))))}}},....,,,...||{|||{,{{,,.{({.,((((({{{{.,....,,)))...))))))))},{{{{(((((((((((((((((..((((,...,},)),)..,.))))))))))))))),....{{......))})))).....,,.,.},{(((((({.........))))).,}})}.}}||||}|||}.,,},}||||||((((((((((((..........))))))))))))...}}}}))))))))))))))).})))))).))))))...{{{.(((((((..(((((...)))))..{({.{((((..(((((.{(({|(((((((((((..(((((..{{{....}}}..........)))))..))))....))))))).....,{((((.{....(((((((.............)))))))..}..}.))))))))).))))}..}))}}.})}........{{.(((...((((....)))).))).}}..)))))))..)}}))))))))))..,|.((((.((((({{((((.(((.....))).)))),),..})).).)))).}((((.(((((....)))))))))..,,,(((({{({{{,{.,{||}}}},,|))}|,||||}|.|||||}}}...|||||{,,||.||{||,|}}..}}},,}}}.}}},||(((((.|.,{({....,,,..,..|||},......}}|.}))))}}{,,{{{{{..,,|,}|}}|}}...,,((((((((((((...(({{,,.((({((((((.((.(.(((({(((..(((((((..(..({((((....)))),}},.}..)))))))..,{(((,,{{{,...,}|||,..(((.,..{...|||..,|||...||}}}},}||,(((..,,|}|,.{.((({.{{,,...,,,|||.},|||.})).}}}}}}.}}.))}}||,}}}}}}}.}}}}}.,}),)}))}.})))))}})))},}}}},,|||..|||{|,|||||{{{{|||||||.,,||},.))))),..)))))}.))))))),}},})})))))),})))))}.)),...}))},,)),))))))
Back