Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0019700
Sequence Length
776 nt
GC Content
0.4317
CCUCUUGUUCUGGACUGAAUGGGGACAAAUGCCCUGUAUUGGAAAGGCUCGCUUGGAUGGCUCAGAGAAGGUUGUCCUUGUAAGCAUGGGAAUAGCAUGGCCGAAUGGCAUCUCCAUCGACUAUGAGGAAAAUAAAUUGUACUGGUGUGAUGCUCGCACAGACAAGAUAGAGAGAAUCGACCUUGAGACUGGAGGGAAUCGCGAGAUGGUGCUGUCAGGAAGCAAUGUGGAUAUGUUUUCAGUUGCAGUCUUUGGGGCUUACAUCUACUGGUCUGACAGAGCACAUGCAAACGGGUCUGUCAGAAGGGGCCACAAGAAUGAUGCCACAGAAACGAUAACCAUGAGAACCGGCCUUGGAGUCAACCUGAAGGAGGUUAAAAUAUUUAACCGAGUAAGAGAGAAAGGGACCAAUGUUUGUGCCAGGGACAAUGGUGGCUGUAAGCAACUCUGUCUUUAUCGAGGAAAUUCCCGGAGAACUUGUGCUUGUGCCCAUGGAUAUUUGGCAGAAGAUGGAGUUACUUGCCUGAGGCAUGAAGGCUAUUUACUGUAUUCAGGAAGAACAAUAUUAAAAAGUAUACAUCUUUCUGAUGAAACCAAUUUAAAUUCCCCAAUAAGGCCAUAUGAGAAUCCACGUUAUUUCAAGAAUGUCAUAGCCUUGGCUUUUGACUAUAAUCAAAGAAGAAAAGGUACCAACCGAAUCUUUUACAGUGAUGCACACUUUGGAAAUAUACAGCUUAUUAAAGACAACUGGGAAGACAGACAAGUAAUUGUUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-192.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -209.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 252.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..(((((((...((((((((((.(....))))))).))))..))(((.((..((((((((.......))))))))..)).)))(((((......((..(((((((((((((((.((......))))).........(((((..((((((.(((...(((.((((...((.....))...))))...)))..))).))))))....)))))..((..((((.(((((((((..(((((((((((..((.((((.(((.....(((..((((((((((((.(.(........)).)))))))).....))))..))).....))).)))).))..))))..))))))).(((((((((((.(((((.....)))))............(((..((((.(((.....((((.(((((.......))))).)))).(((...)))...))).))))..))).(((...)))..((((((((...(((.((((...........)))).)))...))))).)))((((.........))))............(((((((((...(((((....)))))...)))))))))..............))))).....))))))........))))))))).))))..))..((((.(((....)))..)))).........((((((...(((....)))...)))))).....))))).)).)))))..))......)))))....)))))..))...(((((........)))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{,{(((((((,..{{{|{{((((.{....|}}}}}}.,,}}...,{{{.((,.{{{{{|{{,......|||||||},,||{|||.((,..,,,.,{{..(((((((((((((((.((,....,))))).......{{((.((,,(((((...})))))))))||{.,.{{,....||..,}||}..,{{{{{||{,.(({.{.,.|{{{{||.{(..((((.(((((((((..(((((((((((..((.((((.(((.,.{{(((..((((((((((((.(.(........)).)))))))),...,})))..))}.}),.))).)))).))..))))..))))))).(((((((({{{...{({...,,.((((((,...,}))))).,..,,,,.,,,..{{,{({{.{{(((,|.,,|,}}}}}.}}}),((|.,,||},.}}}},|||}..,((.(({...)))))||||{{{{.,,|||.{{||,{.......,})))).))),,,)}}}}.}}|((({..}}},...)}}),,,,,.}},}..(((((((((...(((((....)))))...)))))))))..............,}})),,...})))))........))))))))).))))..)}..||||..{{,,|,}}|{{|||,.....}}},|||||,...|||,}},,))}}.)))))).}}||))})).)).)))))..,,...}}}))))}..,.)))))}}}}...,.|||||||,...}}))}....
Back