Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0020000
Sequence Length
2220 nt
GC Content
0.4167
CUCCCAAUCCUUGUGCAGCUAAUGAUGGCAAAGGCCCCUGCUCUCACAUGUGUCUAAUCAAUCACAAUAGGAGUGCUGCCUGUGCGUGCCCCCACUUGAUGAAGCUUUCUUCAGACAAGAAGACCUGCUAUGAAAUGAAAAAAUUUCUUCUUUAUGCAAGACGUUCUGAAAUCAGAGGAGUGGAUAUUGACAAUCCAUACUUUAACUUCAUCACGGCAUUUACAGUCCCUGAUAUUGAUGACGUUACUGUGAUAGACUUCGAUGCAUCUGAGGAACGUUUAUACUGGACAGAUAUUAAAACACAAACCAUUAAACGAGCUUUUAUUAACGGAACUGGGUUAGAAACUGUUAUUUCAAGAGAUAUUCAGAGUAUCAGAGGGCUAGCAGUGGAUUGGGUGUCACGUAAUUUAUACUGGAUUAGCUCAGAAUUUGAUGAAACGCAAAUUAAUGUGGCAAGGCUAGAUGGCUCUUUGAAAACCUCAAUUAUCCAUGGAAUCGAUAAGCCACAGUGUCUUGCAGCUCACCCAGUCAGGGGAAAACUCUACUGGACCGAUGGAAACACAAUUAACAUGGCAAAUAUGGAUGGCAGUAAUAGCAAGAUUCUGUUUCAGAAUCAGAAGGAGCCAGUUGGUCUAUCGAUAGACUAUGUGGAAAACAAGCUUUAUUGGAUCAGUUCAGGGAAUGGAACCAUAAAUAGAUGCAACCUGGAUGGUGGUAAUUUAGAAGUAAUCGAGUCAAUGAAAGAAGAAUUAACAAAAGCUACAGCCCUAACCAUCAUGGAUAAGAAACUGUGGUGGGCAGACCAAAACUUAGCCCAGCUAGGAACCUGCAGCAAAAGAGACGGAAGAAACCCCACCAUCCUACGGAAUAAGACUUCUGGGGUAGUUCAUAUGAAAGUCUAUGAUAAAGAAGCACAGCAAGGCAGCAAUUCCUGCCAACUAAACAAUGGUGGAUGCUCUCAACUUUGUUUACCAACAUCUGAAACUACAAGGACUUGUAUGUGUACAGUGGGAUAUUAUCUCCAAAAGAACCGUAUGUCAUGUCAAGGUAUAGAAUCAUUUCUUAUGUACUCUGUUCAUGAAGGAAUCAGGGGAAUACCUCUUGAACCAAGUGACAAAAUGGAUGCUUUGAUGCCUAUAUCAGGAACUUCAUUUGCCGUGGGAAUAGAUUUCCAUGCAGAAAAUGAUACCAUCUACUGGACAGACAUGGGCUUCAAUAAAAUUAGCAGAGCUAAAAGAGAUCAGACUUGGAAAGAAGAUAUCAUUACCAAUGGCUUGGGAAGAGUGGAAGGGAUAGCUGUUGACUGGAUUGCUGGUAACAUAUAUUGGACAGAUCAUGGUUUCAACUUAAUUGAAGUUGCAAGACUCAAUGGUUCUUUCCGUUAUGUAAUUAUUUCCCAAGGCCUGGAUCAACCAAGAUCUAUAGCUGUGCACCCAGAGAAAGGCCUCUUGUUCUGGACUGAAUGGGGACAAAUGCCCUGUAUUGGAAAGGCUCGCUUGGAUGGCUCAGAGAAGGUUGUCCUUGUAAGCAUGGGAAUAGCAUGGCCGAAUGGCAUCUCCAUCGACUAUGAGGAAAAUAAAUUGUACUGGUGUGAUGCUCGCACAGACAAGAUAGAGAGAAUCGACCUUGAGACUGGAGGGAAUCGCGAGAUGGUGCUGUCAGGAAGCAAUGUGGAUAUGUUUUCAGUUGCAGUCUUUGGGGCUUACAUCUACUGGUCUGACAGAGCACAUGCAAACGGGUCUGUCAGAAGGGGCCACAAGAAUGAUGCCACAGAAACGAUAACCAUGAGAACCGGCCUUGGAGUCAACCUGAAGGAGGUUAAAAUAUUUAACCGAGUAAGAGAGAAAGGGACCAAUGUUUGUGCCAGGGACAAUGGUGGCUGUAAGCAACUCUGUCUUUAUCGAGGAAAUUCCCGGAGAACUUGUGCUUGUGCCCAUGGAUAUUUGGCAGAAGAUGGAGUUACUUGCCUGAGGCAUGAAGGCUAUUUACUGUAUUCAGGAAGAACAAUAUUAAAAAGUAUACAUCUUUCUGAUGAAACCAAUUUAAAUUCCCCAAUAAGGCCAUAUGAGAAUCCACGUUAUUUCAAGAAUGUCAUAGCCUUGGCUUUUGACUAUAAUCAAAGAAGAAAAGGUACCAACCGAAUCUUUUACAGUGAUGCACACUUUGGAAAUAUACAGCUUAUUAAAGACAACUGGGAAGACAGACAAGUAAUUGUUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-579.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -627.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 568.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.((((((.(((((((....))))...((.((((.(((((...((((..........)))).((((((((((((((.(((((((.............(((..(((((......)))))...)))..(((((......)))))((((((((.((((((.(((((((...((((..((((((.......)))))).))))...)))).....(((((((((.(((((((.(((((((..((((((((.((...(((((((((.((((((...((((((...(((...................))).))))))..(((((..((((((..(((...)))...))))))....)))))...))))))))))).))))(((((((((((((((.((...)).)))))..)))))..)))))(((........)))..((((......))))(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).......(((((.((((.....))))))))).((.(((.............))))).........)).))))))))..)..(((((((...)))))))........(((..(((((((....)))))))..)))....(((......))).))))))))))))).))..........))))))).(((((((((((((...........................................(((.(((..((..(((((((((........)))))))))..)).......((((((...))))))...))).))).........((......)))))))))))..(((((......))))))))).........))).)))).)))))))))))))).)))))))))).)))))))((..(((..(((.(((.(((.(((((...((((((((((....(((((..(..(((((((((......((((((.((.((.((.((((((...(((.(.((((((.((((.((((((.(((.(((((.((.((((((..(((((..........(((((....))))))))))..))).))).)).))))).))).))))))......((....((((((..((((((((....))))))))....))))))..))........)))))))))).).)))..........(((.(((((.............((((((.((.....)).)).)))).((((((((((((((...((......))((((.((((....))))))))(((((.((((.((((((((((((((((((.....))))))..)))))..)))).))).)))).))))).))).)))))))).)))((((((......))))))))))).)))..((((((.(((....))).))))))......)))))).)))).)))))))).....))).)).))))...)..)))))...)))..((((((((..((((((.((..(((......)))..)).))))).)..))))))))...............((((((...)))))))))))))...))))).))).))))))....)))..))...(((......)))((.(((((..(((((.((((......))))))))).(.((((((((((....(((..((((((((((((.(.(........)).))))))))....(((..((....))..)))............))))..)))...)))))))))).)..))))).)).(((((((...)))))))......)))))..)))).))........)))))))))....(((.(((...))).))).((((((((..(((...(((.(((((((((((...(((.((((...........)))).)))...)))))...((((...)))).....((...((((((((.(((((((((...(((((....)))))...))))))))).......................((((((..(((((.(.((.............)).).)))))))))))...(((((......)))))(((((...(((....)))...))))))))))))).))...)))))).)))......)))..))))))))..))))).....(((((....)))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((.,{{,(((((((((,....||||,..(({((((.(((((...((((..........)))).{{{|||((((((((.(((((((((((,{.((((((((...(((((......)))))..(((.{{(((,.(((....}))).,,})))}))).}...,((((....))))|{.((((((.......)))))).},....)))))))).}(((((((((.(((((((.((((((,..{(((((((.{(...(((((((((.((((((...({((({...{{(,,,,...............||}.}}}}}}..{{,,,.,{{{{||...||..}))}...))))),....,}},}...})))))))))).))||{{{{|{{({{(((((.((...}).}))}}..,))))..}))))}|,.,{{{{{.,....,{||}}}}..,||}(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).,,.,,,(((((.((((.....))))))))).{(,{((.............||||,....,,}}.}).))))))))..}..(((((((...)))))))........(((..(((((({....|))))))..)))....|||..,,,,))).))))))))))))).))..........)))))))..,,.(((((((((....,,.....,..{{...,..............,,.......(((.(((..((..(((((((((........)))))))))..)).......((((((...))))))...))).})).........{{......}})))))))))...||{,......,}})))))....(((((.{,...}}))))).......)))).)))))))))),||||||,{{,.,,...(({.(((.(({.(((((...{{((({{{((..,.(((((..(..(((((((((......((((((.((.((.{{.((((((...(((,(.((((((.((((.{(((({,({(,(((((,{,.{{{{{{..(((((,{..((..(({{{{|....))))})))}),.}))}})),||{|||}}.|||{|||,,,.,}}}}||...,||||||(,{(((((({....})))))))}}},,}))))}.,,.},},}}.))))))))))}).)))..........(((.(((((....,,,,,....{(((,{,{{.....)).}).)))}.(((((((((({{((.,.,{,....,||(((,{{{{(....))}}}}}}{(({{.{(((.((((((((((({((((((.....))))))..})))},.))))}})).)))).))))).,,,.}))))))))}))((({{{..,,,.))))),))))).)))..((((({.(((....))).})))))......}))))).,,)).)))))))).....))).)).))))...)..)))))...)))..{(((((({.,{(((({.,,..{((,{,{..}|)|,,},})))).).,))))))))...,...,{{{.{{.((((((...)))))))))))),.,.))))).})).)))})),,..})).})),||{,,.,{{{{,,{((.({((({.(((((.((((.....,})}||)))).{||||{|.|||...|}|||..{{{(((((((((.(.(........)).))))))))},,}||)),..,,..}},,))}.|||...,..,.,}|,,,}}}.,.||||||||,|,}..|||.,.}}.((((((,...}))))))......}}}}}..}}}},||,.{||{{.|}}}}}))}},.}|||,{{|.,,|}},||},|{((({{,.{(,({,...|}|||{{{{{{{(...(((.((((,{........})))).))),,,))))).}}|{({|..)))},..,,|}...{(((((({.(((((((((...(((((....)))))...))))))))).,.................,,...{{(((..{((((.{.{{...,......,..)).).)))))))))))),,{{(({......)))}}(((((...(((....)))...))))))))))))}}))})}}}|||}.,,.......||}..}}))),,...))))).....(((((....)))))....
Back