Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0020200
Sequence Length
2465 nt
GC Content
0.4211
GUCAGAUGCUAUUUAUUCAGCCCUCUAUGAUGGAACAAACAUGAUAGAAAUCAUCCGAGGUCAUGAAUACCUUUCCCAUCCCUUUGCUGUGUCUCUAUAUGGGAGUGAAGUCUACUGGACAGACUGGAGGACCAACACAUUGUCCAAAGCCAAUAAGUGGACAGGGCAGAAUGUCAGUGUGAUUCAGAAAACCAGUGCACAGCCAUUUGACCUUCAGAUAUACCAUCCCAGUCGCCAGCCACAGGCUCCCAAUCCUUGUGCAGCUAAUGAUGGCAAAGGCCCCUGCUCUCACAUGUGUCUAAUCAAUCACAAUAGGAGUGCUGCCUGUGCGUGCCCCCACUUGAUGAAGCUUUCUUCAGACAAGAAGACCUGCUAUGAAAUGAAAAAAUUUCUUCUUUAUGCAAGACGUUCUGAAAUCAGAGGAGUGGAUAUUGACAAUCCAUACUUUAACUUCAUCACGGCAUUUACAGUCCCUGAUAUUGAUGACGUUACUGUGAUAGACUUCGAUGCAUCUGAGGAACGUUUAUACUGGACAGAUAUUAAAACACAAACCAUUAAACGAGCUUUUAUUAACGGAACUGGGUUAGAAACUGUUAUUUCAAGAGAUAUUCAGAGUAUCAGAGGGCUAGCAGUGGAUUGGGUGUCACGUAAUUUAUACUGGAUUAGCUCAGAAUUUGAUGAAACGCAAAUUAAUGUGGCAAGGCUAGAUGGCUCUUUGAAAACCUCAAUUAUCCAUGGAAUCGAUAAGCCACAGUGUCUUGCAGCUCACCCAGUCAGGGGAAAACUCUACUGGACCGAUGGAAACACAAUUAACAUGGCAAAUAUGGAUGGCAGUAAUAGCAAGAUUCUGUUUCAGAAUCAGAAGGAGCCAGUUGGUCUAUCGAUAGACUAUGUGGAAAACAAGCUUUAUUGGAUCAGUUCAGGGAAUGGAACCAUAAAUAGAUGCAACCUGGAUGGUGGUAAUUUAGAAGUAAUCGAGUCAAUGAAAGAAGAAUUAACAAAAGCUACAGCCCUAACCAUCAUGGAUAAGAAACUGUGGUGGGCAGACCAAAACUUAGCCCAGCUAGGAACCUGCAGCAAAAGAGACGGAAGAAACCCCACCAUCCUACGGAAUAAGACUUCUGGGGUAGUUCAUAUGAAAGUCUAUGAUAAAGAAGCACAGCAAGGCAGCAAUUCCUGCCAACUAAACAAUGGUGGAUGCUCUCAACUUUGUUUACCAACAUCUGAAACUACAAGGACUUGUAUGUGUACAGUGGGAUAUUAUCUCCAAAAGAACCGUAUGUCAUGUCAAGGUAUAGAAUCAUUUCUUAUGUACUCUGUUCAUGAAGGAAUCAGGGGAAUACCUCUUGAACCAAGUGACAAAAUGGAUGCUUUGAUGCCUAUAUCAGGAACUUCAUUUGCCGUGGGAAUAGAUUUCCAUGCAGAAAAUGAUACCAUCUACUGGACAGACAUGGGCUUCAAUAAAAUUAGCAGAGCUAAAAGAGAUCAGACUUGGAAAGAAGAUAUCAUUACCAAUGGCUUGGGAAGAGUGGAAGGGAUAGCUGUUGACUGGAUUGCUGGUAACAUAUAUUGGACAGAUCAUGGUUUCAACUUAAUUGAAGUUGCAAGACUCAAUGGUUCUUUCCGUUAUGUAAUUAUUUCCCAAGGCCUGGAUCAACCAAGAUCUAUAGCUGUGCACCCAGAGAAAGGCCUCUUGUUCUGGACUGAAUGGGGACAAAUGCCCUGUAUUGGAAAGGCUCGCUUGGAUGGCUCAGAGAAGGUUGUCCUUGUAAGCAUGGGAAUAGCAUGGCCGAAUGGCAUCUCCAUCGACUAUGAGGAAAAUAAAUUGUACUGGUGUGAUGCUCGCACAGACAAGAUAGAGAGAAUCGACCUUGAGACUGGAGGGAAUCGCGAGAUGGUGCUGUCAGGAAGCAAUGUGGAUAUGUUUUCAGUUGCAGUCUUUGGGGCUUACAUCUACUGGUCUGACAGAGCACAUGCAAACGGGUCUGUCAGAAGGGGCCACAAGAAUGAUGCCACAGAAACGAUAACCAUGAGAACCGGCCUUGGAGUCAACCUGAAGGAGGUUAAAAUAUUUAACCGAGUAAGAGAGAAAGGGACCAAUGUUUGUGCCAGGGACAAUGGUGGCUGUAAGCAACUCUGUCUUUAUCGAGGAAAUUCCCGGAGAACUUGUGCUUGUGCCCAUGGAUAUUUGGCAGAAGAUGGAGUUACUUGCCUGAGGCAUGAAGGCUAUUUACUGUAUUCAGGAAGAACAAUAUUAAAAAGUAUACAUCUUUCUGAUGAAACCAAUUUAAAUUCCCCAAUAAGGCCAUAUGAGAAUCCACGUUAUUUCAAGAAUGUCAUAGCCUUGGCUUUUGACUAUAAUCAAAGAAGAAAAGGUACCAACCGAAUCUUUUACAGUGAUGCACACUUUGGAAAUAUACAGCUUAUUAAAGACAACUGGGAAGACAGACAAGUAAUUGUUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-650.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -698.83
Frequency: 0.0000
Diversity: 727.16
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((.((((..((..((..((((((((.(((.......))).)))))..(((((((((....(((...(((((((.....((((((....((((.....)))))))))).....(((((((..(((....))).....)))))))...(((.....)))((((((((...((((......((((((.......(((((((((.((((((...))))))........(((((...........(((.((((((((...(((.((((....))))..((((....((.(((...((((..........))))....))).)).))))(((.(((((......((((((((...(((((......)))))..(((.(((((..((((...))))...)))))))).....(((((....)))))..((((((.......)))))).......)))))))).))))).)))(((((((((((((((((.((((...((.....))...)))))))).((((..((((((...(((...................))).))))))..))))...((((........))))....(((.(((((....)))))..))))))))))).))))).)))..)))))))).)))...........)))))......(((........)))..((((......))))(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).......(((((.((((.....))))))))).((...(((((...(((((.((((((...........((.......))..(((((((...))))))).((((((((((.(((((((..(((((((((.(((.....))))).)))))))((((.((((((...(((..(((.....(((((((.(((.....))).)).)))))..(((((((.(((((((..................(((((...((((..(((((((((........))))))))).....((...((((..((((((((((.......((((((.((((.((......))((((((((((.(((((......))))))))....(((((........))))).......((...))..(((((......))))).........)))))))....))))...))))))..(((....(((..(((((((....))))).))...))))))((((((.(((((((..(((.(.((((((.((((.((((((.(((.(((((.((.((((((..(((((..........(((((....))))))))))..))).))).)).))))).))).))))))......((....((((((..((((((((....))))))))....))))))..))........)))))))))).).))).......(((((...)))))............)))))..)).))))))....))..)))).))))..)))))).)))).)))))))))))).))))))))))..)))...)))))).)))).......((((((.....))))))..)))).))))))))))))).))))))))))).)))))...))..((((((......))))))..)))))))))((((((.(((....))).)))))).))))))...))))..))))))))...))))))).)))))))))))).........(((((((...((((((.(((..((((((.(((((((((((((.(((.((......))))).........(((((..((((((.(((...(((.((((...((.....))...))))...)))..))).))))))....)))))..((..((((.(((((((((..(((((((((((..((.((((.(((.....(((..((((((((((((.(.(........)).)))))))).....))))..))).....))).)))).))..))))..))))))).(((((((((((.(((((.....)))))............(((..((((.(((.....((((.(((((.......))))).)))).(((...)))...))).))))..))).(((...)))..((((((((...(((.((((...........)))).)))...))))).)))((((.........))))............(((((((((...(((((....)))))...)))))))))..............))))).....))))))........))))))))).))))..)))))))))....))))))..)).))))..))).((((((...(((....)))...))))))..((((.....)))).((........))))))))....))))))))))..))..))..)))).)))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..((({{.(((((..,,,(((((.(((.......))).)))))..,{,{((({(((,.,{{...{(((({{{{({..{{{(((,(({({,,...{{{{{{{,..,,,,.{((({({(,,(((.,,.,,,.....}}))))}...||{.....}))|||{|||||,.((((.{{{({(,,{{,....,,,{{{{||{{{,{{{{({|||||,}},...{{{{{{|{({|{|{||({{{,||}},|||..,,,||||||||{,..|,}|||,,,}}|{{(({{((((...((((..........)))).{(((((((((((((.(((((((((((,{.((((((((...(((((......)))))..(((.{{(((,.(((....}))).,,})))}))).}...,((((....))))|{.((((((.......)))))).},....)))))))).}(((((((((.(((((((.((((((,..{(((((((.{(...(((((((((.((((((...({((({...{{(,,.,...............||}.}}}}}}..{{,,,.,{{{{||...||..}))}...))))),....,}},}...})))))))))).))||{{{{||{({{(((((,((...}}.}}}}}..,})))..}))))}|,.,{{{{{.,....,{||}}}}..,||}(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).,,.,,.(((((.((((.....))))))))).{(,{((.............||||,....,,}}.}).))))))))..}..(((((((...)))))))........(((..(((((({....|))))))..))}....|||..,,,,))).))))))))))))).))..........)))))))..,,.(((((((((....,,.....,..{{...,..............,,.......(((.(((..((..(((((((((........)))))))))..)).......((((((...))))))...))).})).........{{......}})))))))))...||{,......,}})))))....(((((.{,...}}))))).......)))).)))))))))),,)))))).....,,,,{{,.({({({,.,,{||..,,|||||}}{{,.,.,(((,.,({{(((,,,.||}}}.}},{,||||{((((,{,.{{{|{{...(((,(.((((((.((((.,(((({,({(,(((((,{,.{{{{{{..(((((,{..((..(({{{{|....))))})))}),.}))}})),||{|||,}.|||{|||,,,.,}}}}||...,||||||(,{(((((({....})))))))))},}})))),.,..,,},}}.)))))))))),).))).......,{{((,.,})|},..,,,,.,....||||,,,||.,,,,)).}}.}}},.({((((((({||||,,.,||,...|}}|{|||||||...,}))))}||((({{.((((.((((((((((({((((((.....))))))..})))},.))))}})).)))).)))))...,.,}))))}}}})}((((((......)))))),})))))))},((((({.(((....))).}))))).,,,,|}|||)},,..}})))))),},}}..,))}}}}))})}}})}.,},,,}}}))}|,(({(((({.,({(({{.,,..{{{.,,{,.}|)|}}},|)))),}..)))))))).......,|||,||||{({{{...))))))}))))},.,.}}}}}..)),)))})),}}{||||||}.|{{,,,.}}}}}}||}.||,,((((.(((((((((..(((((((((((..((.((((.(((.,.{{(((..((((((((((((.(.(........)).)))))))),...,})))..))}.}),.))).)))).))..))))..))))))).(((((((({{{...{{{...,,.((((((,...,}))))).,..,,|{,,{,..{|,(({{.{{(((.|.,,|.}}}}}.}}}),(({.,,||},.|}}},||||,.,((.(({...})))}|||{{{{{.,,|||.{{||,{.......,})))).))),,,)}))}.}}|((({..}}},...)}}),.,,,,}},|..(((((((((...(((((....)))))...))))))))).,............,}})),,...))))))........))))))))).))))..))})),.))))).)))))(((((({.....,,..{(((((...(((....)))...))))))..{(((.....)))),{{........}}}|||....}}}.,..{{{......)})...,....},)))))))
Back