Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0020400
Sequence Length
2835 nt
GC Content
0.4289
GUGUCAGUGCCAUUGAAGUGGUUGUGGAGCAUGGCCUGGCUACUCCAGAAGGCCUGACAGUCGACUGGAUAGCAGGAAACAUAUACUGGAUAGACAGCAAUCUGGACCAAAUCGAAGUGGCCAAACUAGAUGGCUCCCUAAGAACUACACUAAUAGCAGGAGCCAUGGAACACCCCAGGGCCAUUGCUUUGGACCCAAGAUAUGGAAUUCUUUUCUGGACAGACUGGGAUGCAAAUUUUCCUCGCAUUGAAUCUGCCUCUAUGAGUGGUGCUGGGAGAAAAACCAUCUAUAAAGACAUGAAAACUGGGGCUUGGCCUAAUGGACUAACUGUGGACCACUUUGAGAAAAGGAUAGUGUGGACAGACGCCAGGUCAGAUGCUAUUUAUUCAGCCCUCUAUGAUGGAACAAACAUGAUAGAAAUCAUCCGAGGUCAUGAAUACCUUUCCCAUCCCUUUGCUGUGUCUCUAUAUGGGAGUGAAGUCUACUGGACAGACUGGAGGACCAACACAUUGUCCAAAGCCAAUAAGUGGACAGGGCAGAAUGUCAGUGUGAUUCAGAAAACCAGUGCACAGCCAUUUGACCUUCAGAUAUACCAUCCCAGUCGCCAGCCACAGGCUCCCAAUCCUUGUGCAGCUAAUGAUGGCAAAGGCCCCUGCUCUCACAUGUGUCUAAUCAAUCACAAUAGGAGUGCUGCCUGUGCGUGCCCCCACUUGAUGAAGCUUUCUUCAGACAAGAAGACCUGCUAUGAAAUGAAAAAAUUUCUUCUUUAUGCAAGACGUUCUGAAAUCAGAGGAGUGGAUAUUGACAAUCCAUACUUUAACUUCAUCACGGCAUUUACAGUCCCUGAUAUUGAUGACGUUACUGUGAUAGACUUCGAUGCAUCUGAGGAACGUUUAUACUGGACAGAUAUUAAAACACAAACCAUUAAACGAGCUUUUAUUAACGGAACUGGGUUAGAAACUGUUAUUUCAAGAGAUAUUCAGAGUAUCAGAGGGCUAGCAGUGGAUUGGGUGUCACGUAAUUUAUACUGGAUUAGCUCAGAAUUUGAUGAAACGCAAAUUAAUGUGGCAAGGCUAGAUGGCUCUUUGAAAACCUCAAUUAUCCAUGGAAUCGAUAAGCCACAGUGUCUUGCAGCUCACCCAGUCAGGGGAAAACUCUACUGGACCGAUGGAAACACAAUUAACAUGGCAAAUAUGGAUGGCAGUAAUAGCAAGAUUCUGUUUCAGAAUCAGAAGGAGCCAGUUGGUCUAUCGAUAGACUAUGUGGAAAACAAGCUUUAUUGGAUCAGUUCAGGGAAUGGAACCAUAAAUAGAUGCAACCUGGAUGGUGGUAAUUUAGAAGUAAUCGAGUCAAUGAAAGAAGAAUUAACAAAAGCUACAGCCCUAACCAUCAUGGAUAAGAAACUGUGGUGGGCAGACCAAAACUUAGCCCAGCUAGGAACCUGCAGCAAAAGAGACGGAAGAAACCCCACCAUCCUACGGAAUAAGACUUCUGGGGUAGUUCAUAUGAAAGUCUAUGAUAAAGAAGCACAGCAAGGCAGCAAUUCCUGCCAACUAAACAAUGGUGGAUGCUCUCAACUUUGUUUACCAACAUCUGAAACUACAAGGACUUGUAUGUGUACAGUGGGAUAUUAUCUCCAAAAGAACCGUAUGUCAUGUCAAGGUAUAGAAUCAUUUCUUAUGUACUCUGUUCAUGAAGGAAUCAGGGGAAUACCUCUUGAACCAAGUGACAAAAUGGAUGCUUUGAUGCCUAUAUCAGGAACUUCAUUUGCCGUGGGAAUAGAUUUCCAUGCAGAAAAUGAUACCAUCUACUGGACAGACAUGGGCUUCAAUAAAAUUAGCAGAGCUAAAAGAGAUCAGACUUGGAAAGAAGAUAUCAUUACCAAUGGCUUGGGAAGAGUGGAAGGGAUAGCUGUUGACUGGAUUGCUGGUAACAUAUAUUGGACAGAUCAUGGUUUCAACUUAAUUGAAGUUGCAAGACUCAAUGGUUCUUUCCGUUAUGUAAUUAUUUCCCAAGGCCUGGAUCAACCAAGAUCUAUAGCUGUGCACCCAGAGAAAGGCCUCUUGUUCUGGACUGAAUGGGGACAAAUGCCCUGUAUUGGAAAGGCUCGCUUGGAUGGCUCAGAGAAGGUUGUCCUUGUAAGCAUGGGAAUAGCAUGGCCGAAUGGCAUCUCCAUCGACUAUGAGGAAAAUAAAUUGUACUGGUGUGAUGCUCGCACAGACAAGAUAGAGAGAAUCGACCUUGAGACUGGAGGGAAUCGCGAGAUGGUGCUGUCAGGAAGCAAUGUGGAUAUGUUUUCAGUUGCAGUCUUUGGGGCUUACAUCUACUGGUCUGACAGAGCACAUGCAAACGGGUCUGUCAGAAGGGGCCACAAGAAUGAUGCCACAGAAACGAUAACCAUGAGAACCGGCCUUGGAGUCAACCUGAAGGAGGUUAAAAUAUUUAACCGAGUAAGAGAGAAAGGGACCAAUGUUUGUGCCAGGGACAAUGGUGGCUGUAAGCAACUCUGUCUUUAUCGAGGAAAUUCCCGGAGAACUUGUGCUUGUGCCCAUGGAUAUUUGGCAGAAGAUGGAGUUACUUGCCUGAGGCAUGAAGGCUAUUUACUGUAUUCAGGAAGAACAAUAUUAAAAAGUAUACAUCUUUCUGAUGAAACCAAUUUAAAUUCCCCAAUAAGGCCAUAUGAGAAUCCACGUUAUUUCAAGAAUGUCAUAGCCUUGGCUUUUGACUAUAAUCAAAGAAGAAAAGGUACCAACCGAAUCUUUUACAGUGAUGCACACUUUGGAAAUAUACAGCUUAUUAAAGACAACUGGGAAGACAGACAAGUAAUUGUUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-769.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -828.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 758.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((.(((...((((((((((((.(((.((((.(((.(((((..(((......)))..)))))))))))).........(((((((((.((((.((((.(((...((((((((((((......(((((((((((.............)))..))))))))......(((((((((((......))).))).(((........)))((((((.........(((((....(((((((.((((((..((.........)).)))))).)))))))....))))).......)).))))..))))).((((((....)).))))...))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).)))))......(((.(((((((.......(((((((..((((((....((((.....)))))))))).....(((((((..(((....))).....)))))))...(((((......((((((((...((((......((((((.......(((((((((.((((((...))))))........(((((...........(((.((((((((...(((.((((....))))..((((....((.(((...((((..........))))....))).)).))))(((.(((((......((((((((...(((((......)))))..(((.(((((..((((...))))...)))))))).....(((((....)))))..((((((.......)))))).......)))))))).))))).)))(((((((((((((((((.((((...((.....))...)))))))).((((..((((((...(((...................))).))))))..))))...((((........))))....(((.(((((....)))))..))))))))))).))))).)))..)))))))).)))...........)))))......(((........)))..((((......))))(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).......(((((.((((.....))))))))).((...(((((...(((((.((((((...........((.......))..(((((((...))))))).((((((((((.(((((((..(((((((((.(((.....))))).)))))))((((.((((((...(((..(((.....(((((((.(((.....))).)).)))))..(((((((.(((((((..................(((((...((((..(((((((((........))))))))).....((...((((..((((((((((.......((((((.((((.((......))((((((((((.(((((......))))))))....(((((........))))).......((...))..(((((......))))).........)))))))....))))...))))))..(((....(((..(((((((....))))).))...))))))((((((.(((((((..(((.(.((((((.((((.((((((.(((.(((((.((.((((((..(((((..........(((((....))))))))))..))).))).)).))))).))).))))))......((....((((((..((((((((....))))))))....))))))..))........)))))))))).).))).......(((((...)))))............)))))..)).))))))....))..)))).))))..)))))).)))).)))))))))))).))))))))))..)))...)))))).)))).......((((((.....))))))..)))).))))))))))))).))))))))))).)))))...))..((((((......))))))..)))))))))((((((.(((....))).)))))).))))))...))))..)))))))))))))....(((.((..((((((((.......))))))))..)).))))))))))...)))))))...))))))))))).)))))))..........))).))))))((((((...))))))...((((...((.....))...))))..((((((((((.(((.(...(((((((.((..((((.(((((((((..(((((((((((..((.((((.(((.....(((..((((((((((((.(.(........)).)))))))).....))))..))).....))).)))).))..))))..))))))).(((((((((((.(((((.....)))))............(((..((((.(((.....((((.(((((.......))))).)))).(((...)))...))).))))..))).(((...)))..((((((((...(((.((((...........)))).)))...))))).)))((((.........))))............(((((((((...(((((....)))))...)))))))))..............))))).....))))))........))))))))).))))..))..((((......))))((((((......)))))).......))))))).)))).)))))).)))).....))))(((.((....(((..(((....)))....(((......)))....)))....)).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..,(((((((.(((((((((((((((.(((((,{(((.(((((..(((......)))..)))))))))))).........(((((((((.(((,,((({{(((...((((((((((((...{{,(((((((((({,,.......,,..}))..)))))))),,....{((((((((((...,,,))).}||{{{{...,,...}}}|{{{|{{.,,,....(((((....{((((((.(((({...{{,,.......)),}))))).))))))}....))))).......,..},,..,))))).{{((((....)).))),...))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).)))))..{{{{....,,..}}}}...(((((.(((((.....((((({.{......(((((((...{{...((((.(.((((((.((,........,{||||,...,,,.....)))})|{((,.({{((,{.{((({.,..........,.})))),}.)}|}}|.}}}},,||,...,,.,,)))))))))))..}}..)))))))......}})))))....))))).))))).)).))))).)))}((((..........)))).,(((((((((((((.(((((((((((,{.((((((((...(((((......)))))..(((.{{(((,.(((....}))).,,})))}))).}...,((((....))))|{.((((((.......)))))).},....)))))))).}(((((((((.(((((((.((((((,..{(((((((.{(...(((((((((.((((((...({((({...{{(,,,,...............||}.}}}}}}..{{,,,.,{{{{||...||..}))}...))))),....,}},}...})))))))))).))||{{{{|{{({{(((((.((...}).}))}}..,))))..}))))}|,.,{{{{{.,....,{||}}}}..,||}(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).,,.,,,(((((.((((.....))))))))).{(,{((.............||||,....,,}}.}).))))))))..}..(((((((...)))))))........(((..(((((({....|))))))..)))....|||..,,,,))).))))))))))))).))..........)))))))..,,.(((((((((....,,.....,..{{...,..............,,.......(((.(((..((..(((((((((........)))))))))..)).......((((((...))))))...))).})).........{{......}})))))))))...||{,......,}})))))....(((((.{,...}}))))).......)))).))))))))))},)))))))),,))...))))))).)))))(.((((((((((({.((..,.(((((.,{.,({{((((((,{,,{.(({(((,((,({.,,.{(({{{...{{{,(.({((((,((((.,((((({(((.{{{||||..{||||{.|{{{{|,|,.{{..{({{{{{....})))}))),),.,))}}}}.,|||||,{{{((,(({{||..,,||{{,,,|{{{({(({(((((({{....|}|||||||,,,.||}|||,{{.|{|.||{|}||}}||||||,|||..........(((.(((((....,{,{{....((((,{,{{.....)).)).)))}.(((((((((({{((.,.,{,....,||(((,{{{{(....))}}}}}}{(({{.{(((.((((((((((({((((((.....))))))..})))},.))))}})).)))).)))))..,,.}))))))))}))((({{{..,,,.))))),))))).)))..((((({.(((....))).})))))......|||||}...,,.)))))))),,,..})),)),}}))..,)..))))),,.}||||||,||{{{,|||||||,||..{{{,{{({,|{|||,|,{||,|{}..,,}))))}.......,{((.((,{(((((...)))))))))))|{,{,{{|,,.|||.||}|||...{{||{|||,||||,..}}}|}}|)}.||,,{{{{,||{||{|||..(((({((((((,.((,((((,{((..,({(({..((((((((((((.(.(........)).)))))))),...{||}}..}},.})..))).)}}}.}}..}}}}..}}}}}}}.{{(((({{,{{,..{{{...,,.((((((,...,)))))).,...,,,.,....||,{|||.|||{{}|.}}}})))),.}}))||||,,|}))|.})})}))||,.|((.(({...)))))||||,{,{.,,|||,{|||}|,,......})))).}})}}}))))).))}|{{,.,)))}}.})))).,,}},}}}}..(((((((((...(((((....)))))...))))))))).,............,,,})},,..}}}))),,,}}},.})))}}))}.))))..)}.,{|{{.{{{,,|,)}|,{|||,.....}}},|{{{{{...|||....}))...)))))}..||||,,...))}}|||}...,...}}}|||,,..,,),,,,|||},.}}})))}.........))))).)
Back