Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0020600
Sequence Length
819 nt
GC Content
0.4359
GCCUGGAUCAACCAAGAUCUAUAGCUGUGCACCCAGAGAAAGGCCUCUUGUUCUGGACUGAAUGGGGACAAAUGCCCUGUAUUGGAAAGGCUCGCUUGGAUGGCUCAGAGAAGGUUGUCCUUGUAAGCAUGGGAAUAGCAUGGCCGAAUGGCAUCUCCAUCGACUAUGAGGAAAAUAAAUUGUACUGGUGUGAUGCUCGCACAGACAAGAUAGAGAGAAUCGACCUUGAGACUGGAGGGAAUCGCGAGAUGGUGCUGUCAGGAAGCAAUGUGGAUAUGUUUUCAGUUGCAGUCUUUGGGGCUUACAUCUACUGGUCUGACAGAGCACAUGCAAACGGGUCUGUCAGAAGGGGCCACAAGAAUGAUGCCACAGAAACGAUAACCAUGAGAACCGGCCUUGGAGUCAACCUGAAGGAGGUUAAAAUAUUUAACCGAGUAAGAGAGAAAGGGACCAAUGUUUGUGCCAGGGACAAUGGUGGCUGUAAGCAACUCUGUCUUUAUCGAGGAAAUUCCCGGAGAACUUGUGCUUGUGCCCAUGGAUAUUUGGCAGAAGAUGGAGUUACUUGCCUGAGGCAUGAAGGCUAUUUACUGUAUUCAGGAAGAACAAUAUUAAAAAGUAUACAUCUUUCUGAUGAAACCAAUUUAAAUUCCCCAAUAAGGCCAUAUGAGAAUCCACGUUAUUUCAAGAAUGUCAUAGCCUUGGCUUUUGACUAUAAUCAAAGAAGAAAAGGUACCAACCGAAUCUUUUACAGUGAUGCACACUUUGGAAAUAUACAGCUUAUUAAAGACAACUGGGAAGACAGACAAGUAAUUGUUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-209.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -226.59
Frequency: 0.0000
Diversity: 279.03
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((......))))))..((((((((.((((((.(((....))).)))))).((((((((((.(....))))))).))))....(((.((..((((((((.......))))))))..)).)))..........(((((.(((.(((.....)))))).))))).............(((((..((((((.(((...(((.((((...((.....))...))))...)))..))).))))))....)))))..((..((((.(((((((((..(((((((((((..((.((((.(((.....(((..((((((((((((.(.(........)).)))))))).....))))..))).....))).)))).))..))))..))))))).(((((((((((.(((((.....)))))............(((..((((.(((.....((((.(((((.......))))).)))).(((...)))...))).))))..))).(((...)))..((((((((...(((.((((...........)))).)))...))))).)))((((.........))))............(((((((((...(((((....)))))...)))))))))..............))))).....))))))........))))))))).))))..)).)).))))))...)))(((((((.........((((((...(((....)))...))))))..((((.....))))(((........)))(((....)))....(((......)))..........)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((((((((......)))))}.,((((((,,.((((((.{((....))}.|))))).{{{,{(((((.{....})))))).}}}}....(((.((,.((((({((,......||||}||}..||,}}|,{{{,.,|,,{{{,{{(,,{{|{{{{{{{{,{{|....}))))).......,{((.((,,(((((...})))))))))||{.,,((,....||.,{}|||...{|{|{||{,,{({,,.,.|||||||.||.,((({.(((((((({..(((((((((((..((.((((,(((.,.{{(((..((((((((((((.(.(........)).)))))))),...,|))}..}),.}),.))).)))}.}}..}}))..})))))).((((((({,{{...{({...,,.((((((,...,)))))).,..,,,,.,,...||,{{{{.{{{{{,|.|||,})))}.}}})||||.,|}}},.}}}),})}}..,((.(({...)))))|||{{{{{.,,{{{.{{||,{.......,})))).))),,,))))}.}}|((({..},},...)}}),,,},.}},|..(((((((((...(((((....)))))...)))))))))..............,,}))},,..})))))...,,,..})))))))).})))..}}.,||||,,||,,}})}|{{{{{,.....}},,||{{|{...|||.,,,})),,.)))))).,}|||}}}).)}})}}}}.....,,)))}},......,....|||,,....}}|{{{{....}))))...,
Back