Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0020700
Sequence Length
1979 nt
GC Content
0.3689
UCUGUCAGUGUGCCAGAGGGAAAUUUUAUUGGUCUUAAAGGAUUUAUUCUUCAAAUGGCCAUGUAGGUCGCAACACAAAAACGUACUUAGUUGCUGGCAAAUUUAUUAUUUAAUGAUUCUUCCCCAGUGUCUUUCUGGUGGCUGUGUUUAAAAUCAUUGGCCUGUAAUUACUACCCUUUAUGCAUAUGCAUGCACAUAUAUUUCAUUUAUAGUCUUUAGACACAUUUUUCAUUCAAGUAUUCAAAAAGUACUCUUAUAUAAAGACUCUGUGAUCACAUAGAACAAUUCUUCAAGUAUUCUCAAGCCCAUUUGGACAAUGAGAGUUUGAAAAAUAAUGUAAGGGUCUUGUAGUUGACAUUUAAGAAACUCGUACCUUAGAAGGAAUAAUCGGAUUAUAAGGCAUUUUUAAGACUUUGUACUUUCUGAGUGGCCUUAUGCUUAAAACACUCUUGAUAUAAUUGAAAUGCUCUUAUGUUUCUUUCUGUCCUCUCUCUACUUUGAGGUUUUGUUGAGUUGAUUUUCCCUAGUAGUAUUCAUUUUAAUAGGAGAUUCAGACAUAGGUAUAGCUGUGAAGAGAAAAACUGUGGUCCAAAAUAACAUGGUUUGGAAUCAAAGCUGCAAAUUCAUGCAGGAUAAGGAUUUAUUGAGUUAAAAUAAGUAGAGAAAUUAAUAAAAACAAUAAACAAUGCAAUAGAUUAUUUCUAUAAUAUUUCAAAAAAUACUUCAAAAAUCAUUUGACUGAAAUAUAAGUUCUUUCAUGUUCUUUUCAUGCUUUUUUUUUACUAUUUAUAUUAGUAAAUUAUCCUGAAGAAUACUUAAAAAUCUAGCAUACCCAGGAUGAUAUCCUAAAAGAUACUGUUGCAAUAUGAUCCUAACACCGAUAUUGAUACCUUUUACAGUGUGUGUAUAUGUAUUUUUUUUCUGUGUCUUAUCCAUAGAAAAUGAUACCAUCUACUGGACAGACAUGGGCUUCAAUAAAAUUAGCAGAGCUAAAAGAGAUCAGACUUGGAAAGAAGAUAUCAUUACCAAUGGCUUGGGAAGAGUGGAAGGGAUAGCUGUUGACUGGAUUGCUGGUAACAUAUAUUGGACAGAUCAUGGUUUCAACUUAAUUGAAGUUGCAAGACUCAAUGGUUCUUUCCGUUAUGUAAUUAUUUCCCAAGGCCUGGAUCAACCAAGAUCUAUAGCUGUGCACCCAGAGAAAGGCCUCUUGUUCUGGACUGAAUGGGGACAAAUGCCCUGUAUUGGAAAGGCUCGCUUGGAUGGCUCAGAGAAGGUUGUCCUUGUAAGCAUGGGAAUAGCAUGGCCGAAUGGCAUCUCCAUCGACUAUGAGGAAAAUAAAUUGUACUGGUGUGAUGCUCGCACAGACAAGAUAGAGAGAAUCGACCUUGAGACUGGAGGGAAUCGCGAGAUGGUGCUGUCAGGAAGCAAUGUGGAUAUGUUUUCAGUUGCAGUCUUUGGGGCUUACAUCUACUGGUCUGACAGAGCACAUGCAAACGGGUCUGUCAGAAGGGGCCACAAGAAUGAUGCCACAGAAACGAUAACCAUGAGAACCGGCCUUGGAGUCAACCUGAAGGAGGUUAAAAUAUUUAACCGAGUAAGAGAGAAAGGGACCAAUGUUUGUGCCAGGGACAAUGGUGGCUGUAAGCAACUCUGUCUUUAUCGAGGAAAUUCCCGGAGAACUUGUGCUUGUGCCCAUGGAUAUUUGGCAGAAGAUGGAGUUACUUGCCUGAGGCAUGAAGGCUAUUUACUGUAUUCAGGAAGAACAAUAUUAAAAAGUAUACAUCUUUCUGAUGAAACCAAUUUAAAUUCCCCAAUAAGGCCAUAUGAGAAUCCACGUUAUUUCAAGAAUGUCAUAGCCUUGGCUUUUGACUAUAAUCAAAGAAGAAAAGGUACCAACCGAAUCUUUUACAGUGAUGCACACUUUGGAAAUAUACAGCUUAUUAAAGACAACUGGGAAGACAGACAAGUAAUUGUUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-476.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -519.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 676.02
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((....(((((.((..((((((.(((.((((.....))))((((((.(((((..((.((((((((((....((.(((.(((((((((((..........((((((((((((.((((.((((((((..(((((.((((..........((((((((.....))).....((((((((((((((((.((((.......))))(((....))).............((((((((...(((.((((((((((......((((((....))))))...(((.(((((..(((((((...((....))....)))))))))))).))).)))))))))))))((((((...((((((.(((.....((((((((((((......(((.(((((((((((((.......(((((...((.(((((...(((....)))..)))))..)))))))..))))))).)))))).)))......))))........))))))))))).))))))(((.(((((.((.(((........))).))))))).)))..(((((......)))))..((...((((((((...........))))))))....))..)))))).........(((((((...(((((((((..((((...((((((((((........................(((((.....))))).((((((((.........(((((.....))))).)))))))).........((((.......))))...)))))))))).))))..))))))))))))))))..)))))))).................(((((...)))))(((((.....((..((((((.............))))))..)))))))...)))))))))))))))).........((((((..((((((((...((....)))))).)))).)))))))))))...........)))).)))))..))))...))))))))...))))).)))))))((((....))))....(((.((.((.....)).)).)))...)))))))))))(((((.((((.((((((((((((((((((.....))))))..)))))..)))).))).)))).))))).........((((((((((((((......))))))..(((((((..((((((.(((....))).)))))).((((((((((.(....))))))).))))....(((.((..((((((((.......))))))))..)).))).........)))))))....((((((((((.((......)))))......(((.(..(((((((((.(((...(((.((((...((.....))...))))...)))..))).))))).(((((..(((.(.((((.(((((.((((......)))))))))..)))).).)))...))))).((..(((((((((.(.(........)).)))))))))..))))))..).)))))))))).......................))))))))....(((((.....)))))............(((..((((.(((.....((((.(((((.......))))).)))).(((...)))...))).))))..))).(((...)))..))).))))))).)))))))))))).))))))((((.((((((..((.(.((((...)))).)))..)))))).))))..(((((((((...(((((....)))))...)))))))))))).))))))..)).)))))...((((((..(((((.(.((.............)).).)))))))))))...(((((......)))))(((((...(((....)))...))))).........)))))))...........((((((....)))....)))....))))))(((.......)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,(,{((.(((((((((({{{{{{.,,{,,..,,,}}))}},.})))))...}))))}}}}}))(,,(((({...........,,.}||||||,,,...,,{{{,,,..,||}.(((({((((((((((({..{{{((((((((......,((((((((({{,,{{,{{,{((({({((({{..,,)))}}..,,,,.......,}||((({{{{||,.....,,{,..,,.((((((.....}))))|,,,...,,}}}},((((((....))))))....,{{(((.....((((((((((,,.{(((..{(((({{(({{,,..,,,.,{,(((({{{,.,{,{{{{,,,.,|||,{,,}}},|..|||||,||||.,,..,,|||,(((((((({{{{,,||..,.||||{,,,||,||{{{.,.|{,..,,},,..})))),,}}}})})}}}}}}})),)))))}|(((((((((((.(((((.{,(((((.((((((((((((((.(({((..(((((((...(((((((..,.(((.....(((((((({...(((.((((((((({...((.(((((({{{.,....,,,))))),,))).))(((((......)))))((.(((((((((((.(((((((...,((({{({{{,,..................,,..{{(({.....)))))..{{{{{,...,,,},..,.........)))))}).)}..)))))))))}}}...})))))))))))}.....,{(((((.......))))))|{(((((((..,.,,.{,.........,,..,...)))))))}}.,...{{{((((((,{{,,(({{{{.............}}}}}}..},....,|||}}}},)))}...)))))))}}.}))))))))..))).,..)))))))......)))))))..})).)).)))}}))))))))))..))))).},..)))))...)))..))))))))}...}}}}}.)))),)))))))))).,,},))))}}.,.,,,((({(((,{....|||||,||((({{.((((.((((((((((({((((((.....))))))..})))},.))))}})).)))).)))))..,},.,,,((({((({((((((......)))))}..||{{{{{..(((((,.{((....))}.}))))).{{{{((((((.{....})))))).}}}}...,(((.((..((((((((,......}))}))))..}}.}}},||||,,,.}||||||{..,||||||,|||}|{}..,,}))))}.......{(((.((,{(((((...}))))))))))},.,.{{.....||.,{||||,..||||||||.||||,.,||||}}|||.||||{,.{||{{,{{{{,..{{{||||||||}.{|}||{|.|||.,.|||||.,{{{(((((((((.(.{.,......)).))))))))}.,}})))}..}},.}),,))),))),.,,..},,}..}},},,}.)))}}}}}}}}}}}},|,,,}}.(((((({...})))))).,}}}},,,.....}}}{|||,||{{(,{,{,|,|||||.}|||,((,.,{|||,,|}.}}||||,.,((.(((...)))))||||{{{{.,,|||,{|||,{,,,...,,}))}},)))|||}}))}.},|{{{,..}})},}})}}),,,||,||||..(((((((((...(((((....)))))...))))))))).,.............,,,,,....,||||},,||||.,.{{,,.{,,.|.||..|}.,{|||,,||,,)))}}|||||......)}},|(((((...(((....)))...)))))),,||||,.,,,)}}}.}}},...)))))))}.,},)))))),,)))))))))))},|||,}},,}))))..}
Back