Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0022600
Sequence Length
819 nt
GC Content
0.4127
AUAUUCAGAGUAUCAGAGGGCUAGCAGUGGAUUGGGUGUCACGUAAUUUAUACUGGAUUAGCUCAGAAUUUGAUGAAACGCAAAUUAAUGUGGCAAGGCUAGAUGGCUCUUUGAAAACCUCAAUUAUCCAUGGAAUCGAUAAGCCACAGUGUCUUGCAGCUCACCCAGUCAGGGGAAAACUCUACUGGACCGAUGGAAACACAAUUAACAUGGCAAAUAUGGAUGGCAGUAAUAGCAAGAUUCUGUUUCAGAAUCAGAAGGAGCCAGUUGGUCUAUCGAUAGACUAUGUGGAAAACAAGCUUUAUUGGAUCAGUUCAGGGAAUGGAACCAUAAAUAGAUGCAACCUGGAUGGUGGUAAUUUAGAAGUAAUCGAGUCAAUGAAAGAAGAAUUAACAAAAGCUACAGCCCUAACCAUCAUGGAUAAGAAACUGUGGUGGGCAGACCAAAACUUAGCCCAGCUAGGAACCUGCAGCAAAAGAGACGGAAGAAACCCCACCAUCCUACGGAAUAAGACUUCUGGGGUAGUUCAUAUGAAAGUCUAUGAUAAAGAAGCACAGCAAGGCAGCAAUUCCUGCCAACUAAACAAUGGUGGAUGCUCUCAACUUUGUUUACCAACAUCUGAAACUACAAGGACUUGUAUGUGUACAGUGGGAUAUUAUCUCCAAAAGAACCGUAUGUCAUGUCAAGGUAUAGAAUCAUUUCUUAUGUACUCUGUUCAUGAAGGAAUCAGGGGAAUACCUCUUGAACCAAGUGACAAAAUGGAUGCUUUGAUGCCUAUAUCAGGAACUUCAUUUGCCGUGGGAAUAGAUUUCCAUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-204.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -218.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 173.45
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((((((((((...(((((((((((((((((.((...)).)))))..)))))..)))))))..((((((........))))))...((.(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).))....(((((.((((.....))))))))).....((......))....((((((((..(((((((..((((((.(((..(((((((...)))))))........(((..(((((((....)))))))..))).......))))))))).))).((((..(((((((..((((..(((.((((((((((((((.((((((....(((((....((((.......................(((.(((..((..(((((((((........)))))))))..)).......((((((...))))))...))).))).........((......))((((((((((.(((((......))))))))....(((((........))))).......((...))..(((((......))))).........)))))))..))))...)))))..)))))).))))).........)))..)))))).)))...))))....)))).)))....))))))))))))))))...(((((((((....))))...))))).(((.(((...((..(((((((.....))))))).))..)))))).....))))))))))..(((.....)))......))((((.(((((((....)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..((((((((((...(((((({((((((((((.((...)).)))))..}))))..}))))))..{(((((......,,)))))}...({,(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).,}....(((((.((((.....))))))))).....{{,.....}..,,.((((((((.,(((((.((((((.(({.((..(((((((...))))))).......(((.(((((((((((.,(((((((((((({..,,..((((((((((.((.((((...)))).)).))}...))))).)).,{{{(((((((((....,......,..,,..,{..............,,.......(((.(((..((..(((((((((........)))))))))..)).......((((((...))))))...))).})).........({......}})))))))))..(((((......)))))}}))..))))))),..}))))))))),..,..}}.))))..))).)).})}.)))))}..{{{{{{{,({({({.....,}.,},})))))),,,.,,.(((..(((((({....))))).))...)))||(((,...,}}})),......))))))))))))).,,(((((((((....)))}..,))))}.|{,{(((...((..(((((((....,))))))).))..))))}}.....))))))))))..(((.....)))......))((({{(((((({....}))))))))))
Back