Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0023300
Sequence Length
1794 nt
GC Content
0.4320
GUGUCAGUGCCAUUGAAGUGGUUGUGGAGCAUGGCCUGGCUACUCCAGAAGGCCUGACAGUCGACUGGAUAGCAGGAAACAUAUACUGGAUAGACAGCAAUCUGGACCAAAUCGAAGUGGCCAAACUAGAUGGCUCCCUAAGAACUACACUAAUAGCAGGAGCCAUGGAACACCCCAGGGCCAUUGCUUUGGACCCAAGAUAUGGAAUUCUUUUCUGGACAGACUGGGAUGCAAAUUUUCCUCGCAUUGAAUCUGCCUCUAUGAGUGGUGCUGGGAGAAAAACCAUCUAUAAAGACAUGAAAACUGGGGCUUGGCCUAAUGGACUAACUGUGGACCACUUUGAGAAAAGGAUAGUGUGGACAGACGCCAGGUCAGAUGCUAUUUAUUCAGCCCUCUAUGAUGGAACAAACAUGAUAGAAAUCAUCCGAGGUCAUGAAUACCUUUCCCAUCCCUUUGCUGUGUCUCUAUAUGGGAGUGAAGUCUACUGGACAGACUGGAGGACCAACACAUUGUCCAAAGCCAAUAAGUGGACAGGGCAGAAUGUCAGUGUGAUUCAGAAAACCAGUGCACAGCCAUUUGACCUUCAGAUAUACCAUCCCAGUCGCCAGCCACAGGCUCCCAAUCCUUGUGCAGCUAAUGAUGGCAAAGGCCCCUGCUCUCACAUGUGUCUAAUCAAUCACAAUAGGAGUGCUGCCUGUGCGUGCCCCCACUUGAUGAAGCUUUCUUCAGACAAGAAGACCUGCUAUGAAAUGAAAAAAUUUCUUCUUUAUGCAAGACGUUCUGAAAUCAGAGGAGUGGAUAUUGACAAUCCAUACUUUAACUUCAUCACGGCAUUUACAGUCCCUGAUAUUGAUGACGUUACUGUGAUAGACUUCGAUGCAUCUGAGGAACGUUUAUACUGGACAGAUAUUAAAACACAAACCAUUAAACGAGCUUUUAUUAACGGAACUGGGUUAGAAACUGUUAUUUCAAGAGAUAUUCAGAGUAUCAGAGGGCUAGCAGUGGAUUGGGUGUCACGUAAUUUAUACUGGAUUAGCUCAGAAUUUGAUGAAACGCAAAUUAAUGUGGCAAGGCUAGAUGGCUCUUUGAAAACCUCAAUUAUCCAUGGAAUCGAUAAGCCACAGUGUCUUGCAGCUCACCCAGUCAGGGGAAAACUCUACUGGACCGAUGGAAACACAAUUAACAUGGCAAAUAUGGAUGGCAGUAAUAGCAAGAUUCUGUUUCAGAAUCAGAAGGAGCCAGUUGGUCUAUCGAUAGACUAUGUGGAAAACAAGCUUUAUUGGAUCAGUUCAGGGAAUGGAACCAUAAAUAGAUGCAACCUGGAUGGUGGUAAUUUAGAAGUAAUCGAGUCAAUGAAAGAAGAAUUAACAAAAGCUACAGCCCUAACCAUCAUGGAUAAGAAACUGUGGUGGGCAGACCAAAACUUAGCCCAGCUAGGAACCUGCAGCAAAAGAGACGGAAGAAACCCCACCAUCCUACGGAAUAAGACUUCUGGGGUAGUUCAUAUGAAAGUCUAUGAUAAAGAAGCACAGCAAGGCAGCAAUUCCUGCCAACUAAACAAUGGUGGAUGCUCUCAACUUUGUUUACCAACAUCUGAAACUACAAGGACUUGUAUGUGUACAGUGGGAUAUUAUCUCCAAAAGAACCGUAUGUCAUGUCAAGGUAUAGAAUCAUUUCUUAUGUACUCUGUUCAUGAAGGAAUCAGGGGAAUACCUCUUGAACCAAGUGACAAAAUGGAUGCUUUGAUGCCUAUAUCAGGAACUUCAUUUGCCGUGGGAAUAGAUUUCCAUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-483.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -520.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 378.85
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((((((((....)))))(((((((((.((((((.(((.(((((..(((......)))..)))))))))))).........(((((((((.((((.((((.(((...((((((((((((......(((((((((((.............)))..))))))))......(((((((((((......))).))).(((........)))((((((.........(((((....(((((((.((((((..((.........)).)))))).)))))))....))))).......)).))))..))))).((((((....)).))))...))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).)))))..((((........))))...(((((.(((((.....((((((.(......(((((((...((...((((.(.((((((.((..........((((((...........))))))(((..(((((.(.((((................)))).).)))))..))).........))...)))))))))))..))..)))))))......)))))))....))))).))))).)).))))).)))).(((((((.....((((..((((((((((((((.(((((((.............(((..(((((......)))))...)))..(((((......)))))((((((((.((((((.(((((((...((((..((((((.......)))))).))))...)))).....(((((((((.(((((((.(((((((..((((((((.((...(((((((((.((((((...((((((...(((...................))).))))))..(((((..((((((..(((...)))...))))))....)))))...))))))))))).))))(((((((((((((((.((...)).)))))..)))))..)))))(((........)))..((((......))))(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).......(((((.((((.....))))))))).((.(((.............))))).........)).))))))))..)..(((((((...)))))))........(((..(((((((....)))))))..)))....(((......))).))))))))))))).))..........))))))).(((((((((((((...........................................(((.(((..((..(((((((((........)))))))))..)).......((((((...))))))...))).))).........((......)))))))))))..(((((......))))))))).........))).)))).)))))))))))))).)))))))))).)))))))............((((((((............))))))))....(((..(((((((....))))).))...)))((((((...))).))).............(((((.((.(((((((((....))))...))))).))..))))).((..(((((((.....))))))).))..)))).....)))))))(((((((....))))))).))).)))((((.(((((((....)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..((((((((....}}}}}(((((((((.(((((,{(((.(((((..(((......)))..)))))))))))).........(((((((((.(((,,((({{(((...((((((((((((...{{,(((((((((({,,.......,,..}))..)))))))),,....{((((((((((...,,,))).}||{{{{...,,...}}}|{{{|{{.,,,....(((((....{((((((.(((({...{{,,.......)),}))))).))))))}....))))).......,..},,..,))))).{{((((....)).))),...))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).)))))..{({{.....,..}}}}...(((((.(((((.....((((({.{......(((((((...{{...((((.(.((((((.((,........,{||||,...,,,.....)))})|{((,.({{((,{.{((({.,..........,.})))),}.)}}})|.)}}},,||,...,,.,,)))))))))))..}}..)))))))......}})))))....))))).))))).)).))))).)))),((({{{,.....{|||,.{(((((((((((((.(((((((((((,{.((((((((...(((((......)))))..(((.{{(((,.(((....}))).,,})))}))).}...,((((....))))|{.((((((.......)))))).},....)))))))).}(((((((((.(((((((.((((((,..{(((((((.{(...(((((((((.((((((...({((({...{{(,,,,...............||}.}}}}}}..{{,,,.,{{{{||...||..}))}...))))),....,}},}...})))))))))).))||{{{{|{{({{(((((.((...}).}))}}..,))))..}))))}|,.,{{{{{.,....,{||}}}}..,||}(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).,,.,,,(((((.((((.....))))))))).{(,{((.............||||,....,,}}.}).))))))))..}..(((((((...)))))))........(((..(((((({....|))))))..)))....|||..,,,,))).))))))))))))).))..........)))))))..,,.(((((((((....,,.....,..{{...,..............,,.......(((.(((..((..(((((((((........)))))))))..)).......((((((...))))))...))).})).........{{......}})))))))))...||{,......,}})))))....(((((.{,...}}))))).......)))).))))))))))},)))))).....{{,{{{{,||{{({.....,},.},}})))}},,..,,.{({..{{{(({{....})))}.)).,.}}}||(((,...,}}})},......,,,,,,,(((((.{{{(((((((((....}))}..,)})}|.}|..)))}}.((..(((((((....,))))))).)}..)))),,...)))))))||{{{{{....}}))))).))).)))((({,(((((({....}))))))))))
Back