Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0026400
Sequence Length
2073 nt
GC Content
0.4351
AGAUUCAUUCUCCUGCUGGUUGUAACGGAAAUGAAUUUCAGUGCCACCCUGAUGGUAAUUGCGUUCCUGAUUUGUGGCGCUGUGAUGGAGAAAAAGACUGUGAAGAUGGUAGUGAUGAAAAAGGUUGCAAUGGUACCAUACGAUUGUGUGACCACAAAACCAAGUUUUCCUGUUGGAGUACAGGGAGAUGCAUCAACAAAGCAUGGGUGUGUGAUGGAGAUAUUGAUUGCGAAGAUCAGUCAGAUGAAGAUGACUGUGACAGUUUCUUGUGUGGACCACCCAAGCAUCCUUGUGCUAAUGACACCUCAGUCUGCCUGCAGCCAGAGAAACUCUGCAAUGGGAAAAAGGAUUGUCCUGAUGGCUCUGAUGAAGGCUAUCUCUGUGAUGAGUGUUCGCUGAACAAUGGAGGCUGUAGCAACCACUGUUCUGUUGUUCCUGGAAGAGGAAUUGUCUGUUCCUGCCCUGAAGGACUUCAACUCAACAAAGACAAUAAAACAUGUGAAAUUGUGGAUUAUUGUAGCAAUCAUCUAAAGUGCAGCCAAGUAUGUGAGCAGCACAAGCACACAGUCAAGUGCUCAUGUUAUGAAGGUUGGAAGCUGGAUGUAGACGGUGAAAGUUGUACAAGUGUUGAUCCUUUUGAAGCAUUCAUCAUCUUUUCUAUUCGUCAUGAGAUCAGAAGGAUUGAUCUUCACAAAAGAGACUAUAGUCUACUUGUUCCUGGAUUGAGAAACACAAUAGCACUUGAUUUUCACUUCAAUCAAAGUUUACUUUAUUGGACAGAUGUUGUAGAAGACAGAAUAUACCGGGGAAAGCUUUCUGAAAGUGGAGGUGUCAGUGCCAUUGAAGUGGUUGUGGAGCAUGGCCUGGCUACUCCAGAAGGCCUGACAGUCGACUGGAUAGCAGGAAACAUAUACUGGAUAGACAGCAAUCUGGACCAAAUCGAAGUGGCCAAACUAGAUGGCUCCCUAAGAACUACACUAAUAGCAGGAGCCAUGGAACACCCCAGGGCCAUUGCUUUGGACCCAAGAUAUGGAAUUCUUUUCUGGACAGACUGGGAUGCAAAUUUUCCUCGCAUUGAAUCUGCCUCUAUGAGUGGUGCUGGGAGAAAAACCAUCUAUAAAGACAUGAAAACUGGGGCUUGGCCUAAUGGACUAACUGUGGACCACUUUGAGAAAAGGAUAGUGUGGACAGACGCCAGGUCAGAUGCUAUUUAUUCAGCCCUCUAUGAUGGAACAAACAUGAUAGAAAUCAUCCGAGGUCAUGAAUACCUUUCCCAUCCCUUUGCUGUGUCUCUAUAUGGGAGUGAAGUCUACUGGACAGACUGGAGGACCAACACAUUGUCCAAAGCCAAUAAGUGGACAGGGCAGAAUGUCAGUGUGAUUCAGAAAACCAGUGCACAGCCAUUUGACCUUCAGAUAUACCAUCCCAGUCGCCAGCCACAGGCUCCCAAUCCUUGUGCAGCUAAUGAUGGCAAAGGCCCCUGCUCUCACAUGUGUCUAAUCAAUCACAAUAGGAGUGCUGCCUGUGCGUGCCCCCACUUGAUGAAGCUUUCUUCAGACAAGAAGACCUGCUAUGAAAUGAAAAAAUUUCUUCUUUAUGCAAGACGUUCUGAAAUCAGAGGAGUGGAUAUUGACAAUCCAUACUUUAACUUCAUCACGGCAUUUACAGUCCCUGAUAUUGAUGACGUUACUGUGAUAGACUUCGAUGCAUCUGAGGAACGUUUAUACUGGACAGAUAUUAAAACACAAACCAUUAAACGAGCUUUUAUUAACGGAACUGGGUUAGAAACUGUUAUUUCAAGAGAUAUUCAGAGUAUCAGAGGGCUAGCAGUGGAUUGGGUGUCACGUAAUUUAUACUGGAUUAGCUCAGAAUUUGAUGAAACGCAAAUUAAUGUGGCAAGGCUAGAUGGCUCUUUGAAAACCUCAAUUAUCCAUGGAAUCGAUAAGCCACAGUGUCUUGCAGCUCACCCAGUCAGGGGAAAACUCUACUGGACCGAUGGAAACACAAUUAACAUGGCAAAUAUGGAUGGCAGUAAUAGCAAGAUUCUGUUUCAGAAUCAGAAGGAGCCAGUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-583.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -623.11
Frequency: 0.0000
Diversity: 677.67
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.....)))(..(((((((.(....((((....))))(.(((((.(((.(((.((((((.((((((((.((((((((((((............(((((.(..(((((((....(((...(((((.((((((((((((((....))))).............((((((((((......))))))))))(((.(((....((.((((((.((....((((.((((.((((.......(((((........))))))))))))).))))......)))))))).))....))))))...(((((((((.((((..((((((((((((...)))))....(((((..(((((((((((..(((((((((((((..........((((((((((((....(((..((.((.((((((.(((((((((((..((((.((((((...((((((.....))))))..))...))))...)))).........(((((((..((((......))))..)))))))......((((((...(.(((((..(((((((((((......((.....))....)))))))).)))...))))).)...))))))..)))))))...))))))).))).)).))..)))...))))))))))))........))))))).))).)))..)))).))))))).....(((((((....)))).))).))))).((((((((((..(((......)))..))))...))))))...(((((......)))))....))))))).)))).........((((((....))))))......))))))))))))))))))(((((((((((...((((((((.((((.(((((..(((......)))..)))))))))............(((((((((.((((.((((.(((...((((((((((((......(((((((((((.............)))..))))))))......(((((((((((......))).))).(((........)))((((((.........(((((....(((((((.((((((..((.........)).)))))).)))))))....))))).......)).))))..))))).((((((....)).))))...))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).))))).........)))))))).....(.(((((((......((...))......))))))).).....((((((.....(((((..((..(((..((((((....(((.....)))...))))))..)))..))....)))))....)))))))))))))))))))))))))....)))))))))))))(((.(((((((((.((((((((...(((.((((....))))..((((....((.(((...((((..........))))....))).)).))))(((.(((((......((((((((...(((((......)))))..(((.(((((..((((...))))...)))))))).....(((((....)))))..((((((.......)))))).......)))))))).))))).)))(((((((((((((((((.((((...((.....))...)))))))).((((..((((((...(((...................))).))))))..))))...((((........))))....(((.(((((....)))))..))))))))))).))))).)))..)))))))).)))............((((......))))((((((........))))))..))))))..))).....((((..((((...((............))..))))..))))))))))))..)))).))).(((((.((((.....)))))))))......)).))).)))))).))).).......)).))))).)........(((((((...)))))))....).))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.,,,.}}|(..(((((({,|...|||||,,,,}))|{,(((((.{{,.{{(||{((((.((((({{{{{(((({,((((((((((((..{{((..(({((((((({{{(((,{{,{,,,((((....((((..(((((....)))))))))...}}}}..((((((((((......)))))))))),,{{{{{{,..((.((((((.((.,,.((((.{{{(,{{{{......((((((........))))))}},)))),))))..,}..)))))))).))...{((((((.,,{..((((...((((((.(.(((((((((...)))))....||{,...,(({,,.}))}((((((,((.....})))))))..,,{((((({({{{,,..(((((.(((..((....))..))).))))).((({,(({{((...((((((.....))))))..}}.,,)})),..}}}},,.......(((((((..((((......))))..))))))).,},.}||||,,..,(.(((((..{{(((((((({,,....{{.....,,...,)))))))},,})...))))).}.)))).).))))))))))...})}))))))))}))})}||}}}},,..))))})))))},,.{{{{{{{.{{.{{{,.{{|{{|,|,|||}|||||,,,.{{{(({{....||||.|||{{{.,{{{{{{({{{{,..{{{..,,,.|}|,||}||,.{|||||,{{{({{{,||||.,|||,,..,{{((,|....}))}.......,,((((((((({{{,,..{(((((.(({{||,||{(({{...,|||||(((((((((.(((((,((((.(((((..(((......)))..)))))))))))).........(((((((((.(((,{((({{(((...((((((((((((...,,,(((((((((({,,.......,,..}))..)))))))),,....{{(({({((((..,,,,))).}}|{{{{...,,...}}}|||||{{.,.,,...(((((....{(((({(.(((({,..{(,,,,.....}),}))))).)))))}}....))))).......,..,,,..,))))).{(((({....)).)))},,.))).)))))))))..........((((......})))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).)))))..{{{{..,,,|,.}}},...{{{{{.(((((.....((((({.{......(((((((...{{...((((.{.((((((.{{,,.......,|||||,...{{,.....)))}}|||||,{{{{{,{,|(({|,,.........,,,}}))),},)}||||,}}}}},||,...,},}}))))))}))))..}}..))))))),,....}})))))....))))).}}))),}}.))))).)))}((((..........)))),{{{{,,,,..,)))}}}},,))).))))))...)))))))))}||.,,,},),))),.|||,,,((({{,,,...})))),}}})},})})}},}.}))))}..))))),))})|||,...,...})))),.)))}..)))))))))))).,,}}}||||,{{{{{,{,{{{{.{(((,{,((.,,..,|,,,|||||}||{((({..((((((...(((...................))).))))))..||||..,{(((|,...,,.}}))}...|||}||,,,...,,},,,,})))))))))}),|||||{|{{(({(((((,({,..}).}}}}}..}}))},.}}}}}}||.,,{{||.,,...|||}}}}}..,||}(((((((....(((((..((((...((............))..))))..)))))....))))))).}}.,..(((((.((((.....))))))))).....,|}.,,}.}}}}}..))),}.......)),)))))}}.....,..(((((((...)))))))....).))))))).)
Back