Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP1B_0026600

Sequence Length

1040 nt

GC Content

0.4298

AAUUCUUUUCUGGACAGACUGGGAUGCAAAUUUUCCUCGCAUUGAAUCUGCCUCUAUGAGUGGUGCUGGGAGAAAAACCAUCUAUAAAGACAUGAAAACUGGGGCUUGGCCUAAUGGACUAACUGUGGACCACUUUGAGAAAAGGAUAGUGUGGACAGACGCCAGGUCAGAUGCUAUUUAUUCAGCCCUCUAUGAUGGAACAAACAUGAUAGAAAUCAUCCGAGGUCAUGAAUACCUUUCCCAUCCCUUUGCUGUGUCUCUAUAUGGGAGUGAAGUCUACUGGACAGACUGGAGGACCAACACAUUGUCCAAAGCCAAUAAGUGGACAGGGCAGAAUGUCAGUGUGAUUCAGAAAACCAGUGCACAGCCAUUUGACCUUCAGAUAUACCAUCCCAGUCGCCAGCCACAGGCUCCCAAUCCUUGUGCAGCUAAUGAUGGCAAAGGCCCCUGCUCUCACAUGUGUCUAAUCAAUCACAAUAGGAGUGCUGCCUGUGCGUGCCCCCACUUGAUGAAGCUUUCUUCAGACAAGAAGACCUGCUAUGAAAUGAAAAAAUUUCUUCUUUAUGCAAGACGUUCUGAAAUCAGAGGAGUGGAUAUUGACAAUCCAUACUUUAACUUCAUCACGGCAUUUACAGUCCCUGAUAUUGAUGACGUUACUGUGAUAGACUUCGAUGCAUCUGAGGAACGUUUAUACUGGACAGAUAUUAAAACACAAACCAUUAAACGAGCUUUUAUUAACGGAACUGGGUUAGAAACUGUUAUUUCAAGAGAUAUUCAGAGUAUCAGAGGGCUAGCAGUGGAUUGGGUGUCACGUAAUUUAUACUGGAUUAGCUCAGAAUUUGAUGAAACGCAAAUUAAUGUGGCAAGGCUAGAUGGCUCUUUGAAAACCUCAAUUAUCCAUGGAAUCGAUAAGCCACAGUGUCUUGCAGCUCACCCAGUCAGGGGAAAACUCUACUGGACCGAUGGAAACACAAUUAACAUGGCAAAUAUGGAUGGCAGUAAUAGCAAGAUUCUGUUUCAGAAUCAGAAGGAGCCAGUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-266.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -286.05

Frequency: 0.0000

Diversity: 290.40

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((((((((((((..((((((((((((..(((((.(((((((((.(((((((........((.((((((.(((....(((((...................((((((((....((..(..(((((....(.((((....))))))))))..)..))...)))))))))))))...))).))))))))(((((.(((.......))).)))))........(((((.......)))))((((((......((...))......))))))(((..((((.((((.....)))).))))...)))..((((((...........)))))))))))))...)))))))))....)))))....)))......((((((...)))))).....)))))))))(((.(((((((((.((((((((...(((.((((....))))..((((....((.(((...((((..........))))....))).)).))))(((.(((((......((((((((...(((((......)))))..(((.(((((..((((...))))...)))))))).....(((((....)))))..((((((.......)))))).......)))))))).))))).)))(((((((((((((((((.((((...((.....))...)))))))).((((..((((((...(((...................))).))))))..))))...((((........))))....(((.(((((....)))))..))))))))))).))))).)))..)))))))).)))............((((......))))((((((........))))))..))))))..))).....((((..((((...((............))..))))..))))((((.(((((((.......(((((.((((.....))))))))).....((......))....((.((.((........)).))))....))))))).))))))))))....))))))..(....)

Thermodynamic Ensemble Prediction

..{{{{,{,((((,..((((((((((....{((((.(((((((((.(((((((((,,,,,((({,,{{({,,,,...|||{{{,,,.|||,{,,.....,{{((((((((....((..(..(((({...,|.|{{{....,,,}})))))..)..))...)))))))}.,,,({{...{{{{{||}{{(((((.(((.......))).))))}...,,,..||||{..}},,,),}}},,{||{||,,,,,,,||}},|.,,,}}))}}{{|..((((.((((,,.|,}|||.}},}...}}}.}}}))),..,|||....})))},.}))))))...)))))))))....}}}},...,}||...,,.((((({...))))))....})))))))))(((||(((,,(((.((((((((...(((.((({....})))..((((....(((((,...((((..........))))...})))}),.))))(((.(((((......((((((((...(((((......)))))..(((.(((((..(((,...,))).,.}))))))).}...,((((....))))|{.((((((.......)))))).,,....)))))))).))))).)))(((((((((((((((((.((((...((.....}}...}})))))),((((..((((((...(((...................))).))))))..)))}..,((((,,......))))}...|||,||{,,....,)}}}.,))))))))))).))))).)))..)))))))).)))...,,..,....{{||,,,...}}}}{{((((......,,)))))}..})))||{{|||....(((((..((((...((............))..))))..))))}..,.||}||}|..,....(((((.((((.....))))))))).,{.,{|....,,,......|,||}|,....,}}.))}},,,....)),.(((((((...))))))).,,,,,,,}}}},,}