Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0028100
Sequence Length
1620 nt
GC Content
0.4377
GGAGAUGCAUCAACAAAGCAUGGGUGUGUGAUGGAGAUAUUGAUUGCGAAGAUCAGUCAGAUGAAGAUGACUGUGACAGUUUCUUGUGUGGACCACCCAAGCAUCCUUGUGCUAAUGACACCUCAGUCUGCCUGCAGCCAGAGAAACUCUGCAAUGGGAAAAAGGAUUGUCCUGAUGGCUCUGAUGAAGGCUAUCUCUGUGAUGAGUGUUCGCUGAACAAUGGAGGCUGUAGCAACCACUGUUCUGUUGUUCCUGGAAGAGGAAUUGUCUGUUCCUGCCCUGAAGGACUUCAACUCAACAAAGACAAUAAAACAUGUGAAAUUGUGGAUUAUUGUAGCAAUCAUCUAAAGUGCAGCCAAGUAUGUGAGCAGCACAAGCACACAGUCAAGUGCUCAUGUUAUGAAGGUUGGAAGCUGGAUGUAGACGGUGAAAGUUGUACAAGUGUUGAUCCUUUUGAAGCAUUCAUCAUCUUUUCUAUUCGUCAUGAGAUCAGAAGGAUUGAUCUUCACAAAAGAGACUAUAGUCUACUUGUUCCUGGAUUGAGAAACACAAUAGCACUUGAUUUUCACUUCAAUCAAAGUUUACUUUAUUGGACAGAUGUUGUAGAAGACAGAAUAUACCGGGGAAAGCUUUCUGAAAGUGGAGGUGUCAGUGCCAUUGAAGUGGUUGUGGAGCAUGGCCUGGCUACUCCAGAAGGCCUGACAGUCGACUGGAUAGCAGGAAACAUAUACUGGAUAGACAGCAAUCUGGACCAAAUCGAAGUGGCCAAACUAGAUGGCUCCCUAAGAACUACACUAAUAGCAGGAGCCAUGGAACACCCCAGGGCCAUUGCUUUGGACCCAAGAUAUGGAAUUCUUUUCUGGACAGACUGGGAUGCAAAUUUUCCUCGCAUUGAAUCUGCCUCUAUGAGUGGUGCUGGGAGAAAAACCAUCUAUAAAGACAUGAAAACUGGGGCUUGGCCUAAUGGACUAACUGUGGACCACUUUGAGAAAAGGAUAGUGUGGACAGACGCCAGGUCAGAUGCUAUUUAUUCAGCCCUCUAUGAUGGAACAAACAUGAUAGAAAUCAUCCGAGGUCAUGAAUACCUUUCCCAUCCCUUUGCUGUGUCUCUAUAUGGGAGUGAAGUCUACUGGACAGACUGGAGGACCAACACAUUGUCCAAAGCCAAUAAGUGGACAGGGCAGAAUGUCAGUGUGAUUCAGAAAACCAGUGCACAGCCAUUUGACCUUCAGAUAUACCAUCCCAGUCGCCAGCCACAGGCUCCCAAUCCUUGUGCAGCUAAUGAUGGCAAAGGCCCCUGCUCUCACAUGUGUCUAAUCAAUCACAAUAGGAGUGCUGCCUGUGCGUGCCCCCACUUGAUGAAGCUUUCUUCAGACAAGAAGACCUGCUAUGAAAUGAAAAAAUUUCUUCUUUAUGCAAGACGUUCUGAAAUCAGAGGAGUGGAUAUUGACAAUCCAUACUUUAACUUCAUCACGGCAUUUACAGUCCCUGAUAUUGAUGACGUUACUGUGAUAGACUUCGAUGCAUCUGAGGAACGUUUAUACUGGACAGAUAUUAAAACACAAACCAUUAAACGAGCUUUUAUUAACGGAACUGGGUUAGAAACUGUUAUUUCAAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-440.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -474.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 526.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((.........))))(((((((((((((((.((..(.(((((((((.((((((........))))))....((((((((.((((((.............(((((((.(((..((((...((((((.(.(((((((((...)))))...........((((...))))((((((.((.....)))))))).((.((.(((((.......(((((.(((..((....))..))).))))).(((.(((..((...((((((.....))))))..)).))).)))....))))).)).))(((((((..((((......))))..)))))))..(((((.(((((.(((.((((..(..((((.((.......)).))))..)..).)))))).))).)).)))))...)))).).))))))))))...)))))))))).((((((((((((((.....((.((((..............)))))))))))))))))))).)))))).))))))))...((((.((((((....((((((((((..(((......)))..))))...))))))...(((((......)))))...((((......)))).........((((((((((((....((((((.((.((..(((((((....)))))(((((((((.((((((.(((.(((((..(((......)))..)))))))))))).........(((((((((.((((.((((.(((...((((((((((((......(((((((((((.............)))..))))))))......(((((((((((......))).))).(((........)))((((((.........(((((....(((((((.((((((..((.........)).)))))).)))))))....))))).......)).))))..))))).((((((....)).))))...))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).)))))..((((........))))...(((((.(((((.....((((((.(......(((((((...((...((((.(.((((((.((..........((((((...........))))))(((..(((((.(.((((................)))).).)))))..))).........))...)))))))))))..))..)))))))......)))))))....))))).))))).)).))))).))))((((..........))))(((((.......)))))))..))))))))))...)))))))))))).)))))).)))).......(((((......))))).)))))..))))....(((((....)))))..((((((.......)))))).)..)).))))))))).))))))....)))((......(((((((((.(((...(((..((((........((((..((((((...(((...................))).))))))..))))......)))).)))...))).))).)))))).....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{{(((((((......{{.(((((({(({(({(((,.{{{{,(({,{,,,,,((((((....,,,.}||||||,,}||||||||.{,|{{|,}}}}}}.||,..(((((((.,,{..((((...((((((.(.(((((((((...)))))....|||,...{(({,,.}))}(((((({((.....})))))))..,,{((((({({{{,,..(((({.(((..((....))..))}.})))).((({,(({{((...((((((.....))))))..}}.,,)})),..}}}}.,.......(((((((..((((......))))..))))))).,},.}||||,,..,(.(((((..{{(((((((({,,....{{.....,,...,)))))))},,})...))))).}.)))),),))))))))))...))}))))))))}))|}}|{|||{||||}||||}|}||,,..,{,.,|{||{||}|}|||||,}||}|||}}}}}},||.{{|((((....)))).})}||{,{{|{{{{{||.,{,,({,,.{{{{{||{{|{{{{{{{{{,,.(((((((.{{{,.,|{|,...,((((,,....}))).......}}||||{|||||||.}},||||||}||||||}}}||({{....}}}},(((((((((.(((((,{(((.(((((..(((......)))..)))))))))))).........(((((((((.(((,{((({{(((...((((((((((((...,,,(((((((((({,,.......,,..}))..)))))))),,....{{(((((((((...,,,))).}}|{{{{...,,...}}}|||||{{.,.,,...(((((....{((((((.(((({,..{(,,.,.....)),}))))).))))))}....))))).......,..},,..,))))).{(((((....)).)))},,.))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).)))))..{{{{....,,..}}}}...(((((.(((((.....((((({.{......(((((((...{{...((((.{.((((((.((,........,{||||,...,,,.....)))}}||((|.{{{((,{,{((({.,..........,.})))),}.)|||||,}}}},,|||...,,.,,)))))))))))..}}..)))))))......}})))))....))))).})))).}}.))))).))))||||,....,,,,,)))},||||,|,||..}}}})}}|||}}.}}}}}|,{,||||}}}|||||....,,)}))}..{|{.{{((({,,,,...,}))).}}})}}}))),,...|{(((....)))}||.((((((.......)))))}.},.,..))))))))}}}))),},}|||}}||,||..}|||}}|},,,,}}}}},,}},,,,)))))}}}}{(((..((((((...(((...................))).))))))..))))...(((({{..,,,.,,))}.,.}}))}}.}}},,,})
Back