Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0028700
Sequence Length
813 nt
GC Content
0.4453
AUCCUUUUGAAGCAUUCAUCAUCUUUUCUAUUCGUCAUGAGAUCAGAAGGAUUGAUCUUCACAAAAGAGACUAUAGUCUACUUGUUCCUGGAUUGAGAAACACAAUAGCACUUGAUUUUCACUUCAAUCAAAGUUUACUUUAUUGGACAGAUGUUGUAGAAGACAGAAUAUACCGGGGAAAGCUUUCUGAAAGUGGAGGUGUCAGUGCCAUUGAAGUGGUUGUGGAGCAUGGCCUGGCUACUCCAGAAGGCCUGACAGUCGACUGGAUAGCAGGAAACAUAUACUGGAUAGACAGCAAUCUGGACCAAAUCGAAGUGGCCAAACUAGAUGGCUCCCUAAGAACUACACUAAUAGCAGGAGCCAUGGAACACCCCAGGGCCAUUGCUUUGGACCCAAGAUAUGGAAUUCUUUUCUGGACAGACUGGGAUGCAAAUUUUCCUCGCAUUGAAUCUGCCUCUAUGAGUGGUGCUGGGAGAAAAACCAUCUAUAAAGACAUGAAAACUGGGGCUUGGCCUAAUGGACUAACUGUGGACCACUUUGAGAAAAGGAUAGUGUGGACAGACGCCAGGUCAGAUGCUAUUUAUUCAGCCCUCUAUGAUGGAACAAACAUGAUAGAAAUCAUCCGAGGUCAUGAAUACCUUUCCCAUCCCUUUGCUGUGUCUCUAUAUGGGAGUGAAGUCUACUGGACAGACUGGAGGACCAACACAUUGUCCAAAGCCAAUAAGUGGACAGGGCAGAAUGUCAGUGUGAUUCAGAAAACCAGUGCACAGCCAUUUGACCUUCAGAUAUACCAUCCCAGUCGCCAGCCACAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-216.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -234.33
Frequency: 0.0000
Diversity: 258.70
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((.....((.((((..............))))))))))))))))((((((......(((((((....)))).)))......)))))........((((.(((((..((((((((((((...(((((((.(((...(((.....((((......)))).......)))))).))))))).)).))))))))))...))))).))))..((((((((((.(.((((((((.(((.(((((..(((......)))..)))))))))))).........(((((((((.((((.((((.(((...((((((((((((......(((((((((((.............)))..))))))))......(((((((((((......))).))).(((........)))((((((.........(((((....(((((((.((((((..((.........)).)))))).)))))))....))))).......)).))))..))))).((((((....)).))))...))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).)))))....(((.(((((((.(((.....)))..........(((((((((((.....))))........(((((.....(((((..((..(((..((((((....(((.....)))...))))))..)))..))....)))))....))))))))))))....)))))))..)))...)))))))).....)))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((.....{{{{,{{,.,...........}})))})))))))))){{{,{{||{,..{((((((....)))).))),,{,({|,||,{|{,.,|,((((.(((({,(((((((((((((...(((((((.(({,.,(((.....((((......)))).......)))))).))))))).))}}))))))),,}}}))))).)))),,({(({((,(({({(((((((,((((.(((((..(((......)))..))))))))),}}.........(((((((((.(((,,((({{{((...((((((((((({...,,,(((((((((({,,.......,,..}))..)))))))){{....{{{{{({{(({..,,,,))).}}|,,{{...||...}}||,{{{{{.,.,,.,,(((((....{(((({(.(((((,..((,,,,.....}},|}))}).)))))}}...,))))).......,..,,,..,})}||,{(((({....)).))}},,,))).)))))))))..........((((,.....}))),.))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).))))).....,,.{||||||}|.......}}}}}}.,},,,.{,||||||}|....})))}}||}}|||{,((((.{.,,((({.{,,,...,,,.|{{|||,...{{,.....))),},}||}}},.||}|}}|||},}},,,....,}}}}))))})},||||||}},}},}}}...,}})})))))),)))),,,,..)
Back