Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP1B_0028800

Sequence Length

1692 nt

GC Content

0.4515

AAUUCCCAACUUGUGAGCCACUAACCCAAUUCGUAUGCAAAAGUGGAAGAUGCAUUAGCAGCAAAUGGCACUGCGACUCUGAUGACGACUGUGGGGACGGGAGUGAUGAGGUGGGCUGUGUUCACUCUUGCUUUGAUAAUCAGUUCAGAUGUUCCAGUGGCAGAUGCAUCCCAGGCCACUGGGCCUGUGAUGGUGACAAUGACUGUGGGGACUUCAGUGAUGAAGCCCAGAUCAAUUGUACUAAAGAAGAGAUUCAUUCUCCUGCUGGUUGUAACGGAAAUGAAUUUCAGUGCCACCCUGAUGGUAAUUGCGUUCCUGAUUUGUGGCGCUGUGAUGGAGAAAAAGACUGUGAAGAUGGUAGUGAUGAAAAAGGUUGCAAUGGUACCAUACGAUUGUGUGACCACAAAACCAAGUUUUCCUGUUGGAGUACAGGGAGAUGCAUCAACAAAGCAUGGGUGUGUGAUGGAGAUAUUGAUUGCGAAGAUCAGUCAGAUGAAGAUGACUGUGACAGUUUCUUGUGUGGACCACCCAAGCAUCCUUGUGCUAAUGACACCUCAGUCUGCCUGCAGCCAGAGAAACUCUGCAAUGGGAAAAAGGAUUGUCCUGAUGGCUCUGAUGAAGGCUAUCUCUGUGAUGAGUGUUCGCUGAACAAUGGAGGCUGUAGCAACCACUGUUCUGUUGUUCCUGGAAGAGGAAUUGUCUGUUCCUGCCCUGAAGGACUUCAACUCAACAAAGACAAUAAAACAUGUGAAAUUGUGGAUUAUUGUAGCAAUCAUCUAAAGUGCAGCCAAGUAUGUGAGCAGCACAAGCACACAGUCAAGUGCUCAUGUUAUGAAGGUUGGAAGCUGGAUGUAGACGGUGAAAGUUGUACAAGUGUUGAUCCUUUUGAAGCAUUCAUCAUCUUUUCUAUUCGUCAUGAGAUCAGAAGGAUUGAUCUUCACAAAAGAGACUAUAGUCUACUUGUUCCUGGAUUGAGAAACACAAUAGCACUUGAUUUUCACUUCAAUCAAAGUUUACUUUAUUGGACAGAUGUUGUAGAAGACAGAAUAUACCGGGGAAAGCUUUCUGAAAGUGGAGGUGUCAGUGCCAUUGAAGUGGUUGUGGAGCAUGGCCUGGCUACUCCAGAAGGCCUGACAGUCGACUGGAUAGCAGGAAACAUAUACUGGAUAGACAGCAAUCUGGACCAAAUCGAAGUGGCCAAACUAGAUGGCUCCCUAAGAACUACACUAAUAGCAGGAGCCAUGGAACACCCCAGGGCCAUUGCUUUGGACCCAAGAUAUGGAAUUCUUUUCUGGACAGACUGGGAUGCAAAUUUUCCUCGCAUUGAAUCUGCCUCUAUGAGUGGUGCUGGGAGAAAAACCAUCUAUAAAGACAUGAAAACUGGGGCUUGGCCUAAUGGACUAACUGUGGACCACUUUGAGAAAAGGAUAGUGUGGACAGACGCCAGGUCAGAUGCUAUUUAUUCAGCCCUCUAUGAUGGAACAAACAUGAUAGAAAUCAUCCGAGGUCAUGAAUACCUUUCCCAUCCCUUUGCUGUGUCUCUAUAUGGGAGUGAAGUCUACUGGACAGACUGGAGGACCAACACAUUGUCCAAAGCCAAUAAGUGGACAGGGCAGAAUGUCAGUGUGAUUCAGAAAACCAGUGCACAGCCAUUUGACCUUCAGAUAUACCAUCCCAGUCGCCAGCCACAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-500.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -533.80

Frequency: 0.0000

Diversity: 537.45

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.........((((((..(((((....((.......))....)))))....(((....)))(((..((.(((((.((((((((....((.(((.(((.(((((((((..((.....))....))))))))).))).))).))...))))).))).))))).))..)))(((.((((((....)))))).)))((((.((((((.(.((((..(((((....))))))))).))).))))))))......((((.....))))..((((((..............(((.(((((((((......((..........))......))))))))).))).........(((((.(..(((((((....(((...(((((.((((((((((((((....))))).............((((((((((......))))))))))(((.(((....((.((((((.((....((((.((((.((((.......(((((........))))))))))))).))))......)))))))).))....))))))...(((((((((.((((..((((((((((((...)))))....(((((..(((((((((((..(((((((((((((..........((((((((((((....(((..((.((.((((((.(((((((((((..((((.((((((...((((((.....))))))..))...))))...)))).........(((((((..((((......))))..)))))))......((((((...(.(((((..(((((((((((......((.....))....)))))))).)))...))))).)...))))))..)))))))...))))))).))).)).))..)))...))))))))))))........))))))).))).)))..)))).))))))).....(((((((....)))).))).))))).((((((((((..(((......)))..))))...))))))...(((((......)))))....))))))).)))).........((((((....))))))......))))))))))))))))))(((((((((((...((((((((.((((.(((((..(((......)))..)))))))))............(((((((((.((((.((((.(((...((((((((((((......(((((((((((.............)))..))))))))......(((((((((((......))).))).(((........)))((((((.........(((((....(((((((.((((((..((.........)).)))))).)))))))....))))).......)).))))..))))).((((((....)).))))...))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).))))).........)))))))).....(.(((((((......((...))......))))))).).....((((((.....(((((..((..(((..((((((....(((.....)))...))))))..)))..))....)))))....)))))))))))))))))))))))))....)))))))))))))))))))))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((({{{...,{{(((..((((,,,,,{{,,,,,..,{{...|||||....(((,,..))}(((..((.(((((.((((((((..,,((.(((.(((.(((((((((..{(,....))....))))))))),))).))).)).}}))))).))).))))).))..))){{(.((((((....)))))).)}|(((,{((((((.(.((((,.(((((....))))))))).})),}))))))),.....((((((((((.((((((.....)))..)))))))))))))((((((((......((.|,,...}}}))......))))))))({(((((,......{{{{(,(,,(((((({{((.({,{,,,((((.,..((((..(((((....)))))}))}...,}}}..((((((((((......)))))))))){,{{((({,..((.((((((.((.,,.((((.{{{(,{{{{......((((((........))))))}},)))),))))..,}..)))))))).))...{{{||||.,,(..((((.,.((((((.(.(((((((((...)))))....{{{{...{(({,,.}))}(((((({((...,,|})))))).,,,{((((({({{{,,..(((((.(((..((....))..))).))))).((({,(({{((...((((((.....))))))..}}.,,)})),..}}}},,.......(((((((..((((......))))..))))))).,},.}||||,,..,(.(((((..{{(((((((({,,....{{.....,,...,)))))))},,})...))))).}.)))),),))))))))))...}}}))))))))}))})),|}}}},...)}))})))))}}}},}..}))))))}|||{||||.,,,,}))))))},,,..,{{((((....)))).)))||{.{|,}}}}}}}.,|,.((((.(((({,{(({(((((((((...(((((((.(({,.,{({.....({((,,....)))).......}})))).))))))).))}}}))))))}}}))))))).)))).,|||||||||}..||||{(((,{(((.(((((..(((......)))..)))))))))})).........(((,,,,,,}||,.{(((((,(({,,,{{{(((((((,......(((((((((({.,.......,,..)))..)))))))){{....,,|||,|||||},,.}}))).,)},|}|,..}}}}}){{{.,((((.{.{({{{(((((....{((((,({((((({{.(({{{{{{{,.||,||||,},|||}}|,...|}}|||....,,,,,.,.....|||||{((((({...,|}.|,,|||{|}}.}}}}|}|,}.....||}}}||{{|..,,.,}))}}))))}}}}|}}.}}}||}})),,,(((((.(((.......))).)))))........|||||,,}},..}}}}}||||||,,,...,,,,,}|||....}}))}}|,|..{{{(,((((,,,,.||||.,,,}...}}}.}|||)),..,|||....})))}}.})))))).,,)}})))))),,,,},,,,,,,,}}}},,}},|||{{|...)))}}}...,)))))))))))))))..,,)))