Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0029100
Sequence Length
2199 nt
GC Content
0.4561
GUGACAAUAUGUGCCGAGUAAAUAAUGGGGGCUGUAGUACACUUUGCUUGGCUAUCCCAGGAGGCCGGGUGUGUGCUUGUGCCGAUAAUCAACUUUUGGAUGAAAAUGGGACAACUUGCACAUUUAAUCCUGGAGAAGCACUACCUCACAUAUGUAAAGCUGGAGAGUUUCGCUGCAAAAACAGACACUGUAUCCAAGCUCGGUGGAAAUGUGAUGGCGACGAUGACUGCCUAGACGGAAGCGAUGAGGAUUCAGUAAACUGCUUCAAUCAUAGCUGUCCUGAUGAUCAGUUUAAAUGCCAGAAUAAUCGCUGCAUCCCCAAGAGAUGGCUUUGUGAUGGAGCUAAUGACUGUGGGAGCAAUGAAGAUGAAUCCAAUCAAACUUGCACAGCCAGAACAUGCCAGGUAGACCAGUUUUCUUGCGGAAAUGGGCGUUGCAUUCCCAGAGCAUGGCUGUGUGACAGGGAAGACGACUGUGGUGACCAGACAGAUGAAAUGGCAUCUUGUGAAUUCCCAACUUGUGAGCCACUAACCCAAUUCGUAUGCAAAAGUGGAAGAUGCAUUAGCAGCAAAUGGCACUGCGACUCUGAUGACGACUGUGGGGACGGGAGUGAUGAGGUGGGCUGUGUUCACUCUUGCUUUGAUAAUCAGUUCAGAUGUUCCAGUGGCAGAUGCAUCCCAGGCCACUGGGCCUGUGAUGGUGACAAUGACUGUGGGGACUUCAGUGAUGAAGCCCAGAUCAAUUGUACUAAAGAAGAGAUUCAUUCUCCUGCUGGUUGUAACGGAAAUGAAUUUCAGUGCCACCCUGAUGGUAAUUGCGUUCCUGAUUUGUGGCGCUGUGAUGGAGAAAAAGACUGUGAAGAUGGUAGUGAUGAAAAAGGUUGCAAUGGUACCAUACGAUUGUGUGACCACAAAACCAAGUUUUCCUGUUGGAGUACAGGGAGAUGCAUCAACAAAGCAUGGGUGUGUGAUGGAGAUAUUGAUUGCGAAGAUCAGUCAGAUGAAGAUGACUGUGACAGUUUCUUGUGUGGACCACCCAAGCAUCCUUGUGCUAAUGACACCUCAGUCUGCCUGCAGCCAGAGAAACUCUGCAAUGGGAAAAAGGAUUGUCCUGAUGGCUCUGAUGAAGGCUAUCUCUGUGAUGAGUGUUCGCUGAACAAUGGAGGCUGUAGCAACCACUGUUCUGUUGUUCCUGGAAGAGGAAUUGUCUGUUCCUGCCCUGAAGGACUUCAACUCAACAAAGACAAUAAAACAUGUGAAAUUGUGGAUUAUUGUAGCAAUCAUCUAAAGUGCAGCCAAGUAUGUGAGCAGCACAAGCACACAGUCAAGUGCUCAUGUUAUGAAGGUUGGAAGCUGGAUGUAGACGGUGAAAGUUGUACAAGUGUUGAUCCUUUUGAAGCAUUCAUCAUCUUUUCUAUUCGUCAUGAGAUCAGAAGGAUUGAUCUUCACAAAAGAGACUAUAGUCUACUUGUUCCUGGAUUGAGAAACACAAUAGCACUUGAUUUUCACUUCAAUCAAAGUUUACUUUAUUGGACAGAUGUUGUAGAAGACAGAAUAUACCGGGGAAAGCUUUCUGAAAGUGGAGGUGUCAGUGCCAUUGAAGUGGUUGUGGAGCAUGGCCUGGCUACUCCAGAAGGCCUGACAGUCGACUGGAUAGCAGGAAACAUAUACUGGAUAGACAGCAAUCUGGACCAAAUCGAAGUGGCCAAACUAGAUGGCUCCCUAAGAACUACACUAAUAGCAGGAGCCAUGGAACACCCCAGGGCCAUUGCUUUGGACCCAAGAUAUGGAAUUCUUUUCUGGACAGACUGGGAUGCAAAUUUUCCUCGCAUUGAAUCUGCCUCUAUGAGUGGUGCUGGGAGAAAAACCAUCUAUAAAGACAUGAAAACUGGGGCUUGGCCUAAUGGACUAACUGUGGACCACUUUGAGAAAAGGAUAGUGUGGACAGACGCCAGGUCAGAUGCUAUUUAUUCAGCCCUCUAUGAUGGAACAAACAUGAUAGAAAUCAUCCGAGGUCAUGAAUACCUUUCCCAUCCCUUUGCUGUGUCUCUAUAUGGGAGUGAAGUCUACUGGACAGACUGGAGGACCAACACAUUGUCCAAAGCCAAUAAGUGGACAGGGCAGAAUGUCAGUGUGAUUCAGAAAACCAGUGCACAGCCAUUUGACCUUCAGAUAUACCAUCCCAGUCGCCAGCCACAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-650.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -694.93
Frequency: 0.0000
Diversity: 613.34
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((.((.((.(........).)).))))).)).)))((((..(((((.((((((((....(((((((((.((((.(((...(((........))).....))).))))..)))))))))..)))))).))....((((((....(((((...((((..((((((..(((......))).(((((..........)))))....(((..(((((.....(((((..((...((((((.((((.((..(((....)))..))..)))).))).)))...))..)))))....)))))..))).(((.(((.((((((.....(((((((.....))))))).....)).))))))).))).(((.......)))))))))...))))....)))))..)))))).(((.(((((.((((((..((((.(((((((..(((.....)))..))))))).(((((....((...((((.(((...........)))))))..))...))))).....(((...)))...)))).)))))).).)))).)))....(((....)))(((..((.(((((.((((((((....((.(((.(((.(((((((((..((.....))....))))))))).))).))).))...))))).))).))))).))..)))(((.((((((....)))))).)))((((.((((((.(.((((..(((((....))))))))).))).))))))))......((((((((((.((((((.....)))..)))))))))))))((((((((......((..........))......))))))))..............(((((.(..(((((((....(((...(((((.((((((((((((((....))))).............((((((((((......))))))))))(((.(((....((.((((((.((....((((.((((.((((.......(((((........))))))))))))).))))......)))))))).))....))))))...(((((((((.((((..((((((((((((...)))))....(((((..(((((((((((..(((((((((((((..........((((((((((((....(((..((.((.((((((.(((((((((((..((((.((((((...((((((.....))))))..))...))))...)))).........(((((((..((((......))))..)))))))......((((((...(.(((((..(((((((((((......((.....))....)))))))).)))...))))).)...))))))..)))))))...))))))).))).)).))..)))...))))))))))))........))))))).))).)))..)))).))))))).....(((((((....)))).))).))))).((((((((((..(((......)))..))))...))))))...(((((......)))))....))))))).)))).........((((((....))))))......))))))))))))))))))(((((((((((...((((((((.((((.(((((..(((......)))..)))))))))............(((((((((.((((.((((.(((...((((((((((((......(((((((((((.............)))..))))))))......(((((((((((......))).))).(((........)))((((((.........(((((....(((((((.((((((..((.........)).)))))).)))))))....))))).......)).))))..))))).((((((....)).))))...))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).))))).........)))))))).....(.(((((((......((...))......))))))).).....((((((.....(((((..((..(((..((((((....(((.....)))...))))))..)))..))....)))))....)))))))))))))))))))))))))....)))))))))))))...)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.(((.((.((.(........).)).))})).)).)))(((((((((((.((,,,,||}}}}|||(((((((((((((,{....,,..(({,.((({..{{{{{|.,|,...,}),))))).}))),))})..,......(((((((((,,..,({(((({,,({{{{,,(({..{(((({({.,,..{{||.,..,|||||}..{((..(((((.....(((((..,,...((((((.((((.((..(((....)))..))..)))).))).)))...,,..)))))....)))))..))}..{(((,(({(,,,.((((((((((((....{(((((((.{(.(((((.(((...(((.,,{,....,,.)))..))).))))).}}.....(({{((((((((((.(((((.((((((..((((.((((..(((((.,.((({....))))..).)))))..)))).(((((,,{{(,{{(((((......)))),,))....}},}...,,}|,.}})))...)))).)))))).).)))).))|.,(.((((((((({{((..((.(((((.((((((((..,,((.(((.(((.(((((((((..{(,....))....)))))))))}))).))).)).},))))).))).))))).)),,|||{((.((((((....)))))).)}|(((,{((((((.(.((((,.(((((....))))))))).})),})))))))}.....((((((((((.((((((.....)))..)))))))))))))((((((((......((.,,,...,,,))......)))))))),,,,,{.........(((((....)))))..,.,,,.....((((.,..((((..(((((....)))))))))...}}))..{{{(((((((......)))))))))),)))),.....((.((((((.((.,,.((((.{{{(,{{{{......((((((........))))))},,)))),))))..,}..)))))))).))....}}})))))))).)).})}.})))))))))}(,(((((...)))))}...{{{,...{{{,...))))..))))))),...)))))))))))),.||||}}||,,,|{.((({{.(((..((,,,.))..))).))}}).||.((((((.....))))}}}}}}}))),,)}}..}}})),,}}}}}.}|...,....(((((((..((({......))))..))))))).{{,..,,,,....,}}}|||,..}))))))))|.)))))}))}}})}.|,...,||||||,,.,)}}.((((((..((((({{({{{{,{{({{{.{(({{..{((,((((((((((((((....,{{,{,{{...........,..}})))}))))))))))))))}}}.}},.,{{((((....)))).)}|{{{.((......}}.}}},((((.(((({,{(({(((((((((...(((((((.(({,.,{((.....({((,,....}))).......)})))).))))))).))}}}))))))},}}}))))).)))){((((((((((..,({((((((,((((.(((((..(((......)))..))))))))),|}.........(((((((((.(((,{((({{(((...((((((((((((...{,,(((((((((({,,.......,,..}))..)))))))),,....{{(((((((((...,,,))).}}|{{{{...,,...}}||{{{{{{.,,.,...(((((....{((((((.(((({...{(,,.......)),}))))).))))))}....))))).......,..,,,..,))))).{(((((....)).)))},,.))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).))))).....,.,,||||}}}}...,,}}}|||||{,,,,,.{{,,|||,,,...,}))))},},,|,,{{(((({{{..{(({,..,|...,{,.||||||,...{{{.....))),},)))))},.))},,)}}},.)))))....)))))})))))))))))|}}.})))....},,})))}))))..)))))).))))
Back