Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0029200
Sequence Length
2790 nt
GC Content
0.4495
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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-837.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -893.35
Frequency: 0.0000
Diversity: 614.22
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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