Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0029300
Sequence Length
1260 nt
GC Content
0.4468
GGAGAUGCAUCAACAAAGCAUGGGUGUGUGAUGGAGAUAUUGAUUGCGAAGAUCAGUCAGAUGAAGAUGACUGUGACAGUUUCUUGUGUGGACCACCCAAGCAUCCUUGUGCUAAUGACACCUCAGUCUGCCUGCAGCCAGAGAAACUCUGCAAUGGGAAAAAGGAUUGUCCUGAUGGCUCUGAUGAAGGCUAUCUCUGUGAUGAGUGUUCGCUGAACAAUGGAGGCUGUAGCAACCACUGUUCUGUUGUUCCUGGAAGAGGAAUUGUCUGUUCCUGCCCUGAAGGACUUCAACUCAACAAAGACAAUAAAACAUGUGAAAUUGUGGAUUAUUGUAGCAAUCAUCUAAAGUGCAGCCAAGUAUGUGAGCAGCACAAGCACACAGUCAAGUGCUCAUGUUAUGAAGGUUGGAAGCUGGAUGUAGACGGUGAAAGUUGUACAAGUGUUGAUCCUUUUGAAGCAUUCAUCAUCUUUUCUAUUCGUCAUGAGAUCAGAAGGAUUGAUCUUCACAAAAGAGACUAUAGUCUACUUGUUCCUGGAUUGAGAAACACAAUAGCACUUGAUUUUCACUUCAAUCAAAGUUUACUUUAUUGGACAGAUGUUGUAGAAGACAGAAUAUACCGGGGAAAGCUUUCUGAAAGUGGAGGUGUCAGUGCCAUUGAAGUGGUUGUGGAGCAUGGCCUGGCUACUCCAGAAGGCCUGACAGUCGACUGGAUAGCAGGAAACAUAUACUGGAUAGACAGCAAUCUGGACCAAAUCGAAGUGGCCAAACUAGAUGGCUCCCUAAGAACUACACUAAUAGCAGGAGCCAUGGAACACCCCAGGGCCAUUGCUUUGGACCCAAGAUAUGGAAUUCUUUUCUGGACAGACUGGGAUGCAAAUUUUCCUCGCAUUGAAUCUGCCUCUAUGAGUGGUGCUGGGAGAAAAACCAUCUAUAAAGACAUGAAAACUGGGGCUUGGCCUAAUGGACUAACUGUGGACCACUUUGAGAAAAGGAUAGUGUGGACAGACGCCAGGUCAGAUGCUAUUUAUUCAGCCCUCUAUGAUGGAACAAACAUGAUAGAAAUCAUCCGAGGUCAUGAAUACCUUUCCCAUCCCUUUGCUGUGUCUCUAUAUGGGAGUGAAGUCUACUGGACAGACUGGAGGACCAACACAUUGUCCAAAGCCAAUAAGUGGACAGGGCAGAAUGUCAGUGUGAUUCAGAAAACCAGUGCACAGCCAUUUGACCUUCAGAUAUACCAUCCCAGUCGCCAGCCACAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-353.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -378.38
Frequency: 0.0000
Diversity: 429.01
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((.........)))).(((((((..(((((....(((((.....)))))(((((((((((..((((((...((((((((.((((((.............(((((((.(((..((((...((((((.(.(((((((((...)))))...........((((...))))((((((.((.....)))))))).((.((.(((((.......(((((.(((..((....))..))).))))).(((.(((..((...((((((.....))))))..)).))).)))....))))).)).))(((((((..((((......))))..)))))))..(((((.(((((.(((.((((..(..((((.((.......)).))))..)..).)))))).))).)).)))))...)))).).))))))))))...)))))))))).((((((((((((((.....((.((((..............)))))))))))))))))))).)))))).))))))))))))))..)))(((.((......)).))).((((.(((((..((((((((((((...(((((((.(((...(((.....((((......)))).......)))))).))))))).)).))))))))))...))))).))))(((.((.((.((((((((((((.((((.(((((..(((......)))..)))))))))............(((((((((.((((.((((.(((...((((((((((((......(((((((((((.............)))..))))))))......(((((((((((......))).))).(((........)))((((((.........(((((....(((((((.((((((..((.........)).)))))).)))))))....))))).......)).))))..))))).((((((....)).))))...))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).))))).........)))))))).......)))))).))))).(((((((((((.....))))........(((((.....(((((..((..(((..((((((....(((.....)))...))))))..)))..))....)))))....))))))))))))))))))))))))).))))))).)))(.((........))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({.{(((.........}}}|{(((({((,,(((((,..,{{{((,.,,,||||{(((({,,,,{{.,{||||{,.,|||{||||.{{{({|.,,,,},,||{..(((((((,,,{,,({{{...{((({(.(.(((((((((...))))),...|||,...{{{{...})))(((((({({.....}))))))).,{{,(((({{({{,..{.((({{.(((..((,,,.||..}}}.}}|||,({{{{(((({{...((((((.....}))))}.,||,|.}|)}|,,||}|{{..,....(((((((..((((......))))..))))))).,,,.,||||{,..,(.(((((..{{(((((((({,,....{{.....,,...,)))))))}},})...))))).}.}})),),)}})))))))..,||}))}}}})||||{{{{{{{{{({..,.,|||||||,.,........,,.}})))})))))))))))}}}|}}}}}}.|||||||,,,,)))}.))}{{{.{{..,,..)}.,}}.((({.((((|,|(({(((((((((...(((((((.{({,.,{({.....{{((,,....}))).......}}))}).})))))}.))}}})))))}}|}}|))))).}))}{(({(({(({({,{({((((((,((((.(((((..(((......)))..))))))))),||.........(((((((((.(((,,((({{(((...((((((((((((...{{,(((((((((({,,.......,,..}))..)))))))),,....{{(((((((((...,,,))).}}|{{{{...,,...}}}|{{{{{{.,,.,...(((((....{((((((.(((({...{{,,.......)),}))))).))))))}....))))).......,..},,..,))))).{{((((....)).)))}.,.))).)))))))))..........((((......))))..))))))))))).)))))))))...(((((.(((.......))).))))).....,,,,}}})))}).....}})}}}}|,,,,,,.{|||||||||,,,,,}}))}|}}}||||{{((({{{,.{(({....|,..,,,.||||||,...{{{.....))),)})))))),,))}},}}}},,)}))}....))))))))))))))))),,.})))),}}))))),))}|,||,,,,,.,,)).})
Back