Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP1B_0030300

Sequence Length

1282 nt

GC Content

0.4501

AAUUCCCAACUUGUGAGCCACUAACCCAAUUCGUAUGCAAAAGUGGAAGAUGCAUUAGCAGCAAAUGGCACUGCGACUCUGAUGACGACUGUGGGGACGGGAGUGAUGAGGUGGGCUGUGUUCACUCUUGCUUUGAUAAUCAGUUCAGAUGUUCCAGUGGCAGAUGCAUCCCAGGCCACUGGGCCUGUGAUGGUGACAAUGACUGUGGGGACUUCAGUGAUGAAGCCCAGAUCAAUUGUACUAAAGAAGAGAUUCAUUCUCCUGCUGGUUGUAACGGAAAUGAAUUUCAGUGCCACCCUGAUGGUAAUUGCGUUCCUGAUUUGUGGCGCUGUGAUGGAGAAAAAGACUGUGAAGAUGGUAGUGAUGAAAAAGGUUGCAAUGGUACCAUACGAUUGUGUGACCACAAAACCAAGUUUUCCUGUUGGAGUACAGGGAGAUGCAUCAACAAAGCAUGGGUGUGUGAUGGAGAUAUUGAUUGCGAAGAUCAGUCAGAUGAAGAUGACUGUGACAGUUUCUUGUGUGGACCACCCAAGCAUCCUUGUGCUAAUGACACCUCAGUCUGCCUGCAGCCAGAGAAACUCUGCAAUGGGAAAAAGGAUUGUCCUGAUGGCUCUGAUGAAGGCUAUCUCUGUGAUGAGUGUUCGCUGAACAAUGGAGGCUGUAGCAACCACUGUUCUGUUGUUCCUGGAAGAGGAAUUGUCUGUUCCUGCCCUGAAGGACUUCAACUCAACAAAGACAAUAAAACAUGUGAAAUUGUGGAUUAUUGUAGCAAUCAUCUAAAGUGCAGCCAAGUAUGUGAGCAGCACAAGCACACAGUCAAGUGCUCAUGUUAUGAAGGUUGGAAGCUGGAUGUAGACGGUGAAAGUUGUACAAGUGUUGAUCCUUUUGAAGCAUUCAUCAUCUUUUCUAUUCGUCAUGAGAUCAGAAGGAUUGAUCUUCACAAAAGAGACUAUAGUCUACUUGUUCCUGGAUUGAGAAACACAAUAGCACUUGAUUUUCACUUCAAUCAAAGUUUACUUUAUUGGACAGAUGUUGUAGAAGACAGAAUAUACCGGGGAAAGCUUUCUGAAAGUGGAGGUGUCAGUGCCAUUGAAGUGGUUGUGGAGCAUGGCCUGGCUACUCCAGAAGGCCUGACAGUCGACUGGAUAGCAGGAAACAUAUACUGGAUAGACAGCAAUCUGGACCAAAUCGAAGUGGCCAAACUAGAUGGCUCCCUAAGAACUACACUAAUAGCAGGAGCCAUGGAACACCCCAGGGCCAUUGCUUUGGACCCAAGAUAUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-380.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -406.44

Frequency: 0.0000

Diversity: 241.06

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((..(((((..((((.(((((((((((...(((..((((((...(((....)))(((..((.(((((.((((((((....((.(((.(((.(((((((((..((.....))....))))))))).))).))).))...))))).))).))))).))..)))(((.((((((....)))))).)))((((.((((((.(.((((..(((((....))))))))).))).))))))))......((((((((((.((((((.....)))..)))))))))))))((((((((......((..........))......))))))))((((((((..........(.(((((((((((((....((((((......((((..(((((....))))))))).........((((((((((......))))))))))..(((((((..((.((((((.((....((((.((((.((((.......(((((........))))))))))))).))))......)))))))).))...(((((((.(((..((((...((((((.(.(((((((((...)))))...........((((...))))((((((.((.....)))))))).((.((.(((((.......(((((.(((..((....))..))).))))).(((.(((..((...((((((.....))))))..)).))).)))....))))).)).))(((((((..((((......))))..)))))))..(((((.(((((.(((.((((..(..((((.((.......)).))))..)..).)))))).))).)).)))))...)))).).))))))))))...)))))))))))))))))))))))....)))).))))))))).)..))))))))((((((((.....)))))))).................)))))))))...))))))).......((((.(((((..((((((((((((...(((((((.(((...(((.....((((......)))).......)))))).))))))).)).))))))))))...))))).))))....))))))))..)))))((((.(((.(((((..(((......)))..)))))))))))).........(((......)))..((((((.(((((....(((((((.......(((((((((((.............)))..))))))))((......))..)))))))..)))))..)).)))).)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....(((..{((((..((((.((((({{((({..,((,..{{{{{,...{((,,..))}(((..((.(((((.((((((((..,,((.(((.(((.(((((((((..{(,....))....))))))))),))).))).)).}}))))).))).))))).))..))){{(.((((((....)))))).)}|(((,{((((((.(.((((,.(((((....))))))))).})),}))))))),.....((((((((((.((((((.....)))..)))))))))))))((((((((......((.,,,...,},))......))))))))((((((((,,,,.,,{.,{,{{{{{{{{{{(((,{,,({{{(({(....((((..(((((....)))))))))...,}}}..((((((((((......)))))))))),.(((((((..((.((((((.((.,,.((((.{{{(,{{{{......((((((........))))))}},)))),))))..,}..)))))))).))...(((((((.{{(..((((...((((((.(.(((((((((...)))))....,{{,...{{{,...))))((((((,{{.....}))))))).,{.,(((((.({,|.,,.(((((.(((..((....))..))).))))).((({{(({{((...((((((.....))))))..}}.,,)}))}..}}}},,,.,...,(((((((..((((......))))..))))))),}}|.}}}}}....{(,(((((..{,{{((({(({,|,,..{{.,...,....})))))))},,}},..))))).,.)))).).))))))))))...}}}))))))))))))))}}}}}}....)))),)))))))))}),.))))))))((((((({.....}))))))),.....,{{{{{....}))),)))||,.,|}}}}}}.,..,,.((((.(((({,(((((((((((((...(((((((.(({,.,(((.....((((......)))).......)))))).))))))).))})))))))),,,}}))))).))))..,.))))))))..)))},(((,{(((.(((((..(((......)))..)))))))))))).........(((......)))..{(((((.(((((.,,.,((((((.......(((((((((((.,........,..)))..))))))))((......))..))))))),.))))).,)),}))).)))