Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0031200
Sequence Length
1263 nt
GC Content
0.4616
UUAAUCCUGGAGAAGCACUACCUCACAUAUGUAAAGCUGGAGAGUUUCGCUGCAAAAACAGACACUGUAUCCAAGCUCGGUGGAAAUGUGAUGGCGACGAUGACUGCCUAGACGGAAGCGAUGAGGAUUCAGUAAACUGCUUCAAUCAUAGCUGUCCUGAUGAUCAGUUUAAAUGCCAGAAUAAUCGCUGCAUCCCCAAGAGAUGGCUUUGUGAUGGAGCUAAUGACUGUGGGAGCAAUGAAGAUGAAUCCAAUCAAACUUGCACAGCCAGAACAUGCCAGGUAGACCAGUUUUCUUGCGGAAAUGGGCGUUGCAUUCCCAGAGCAUGGCUGUGUGACAGGGAAGACGACUGUGGUGACCAGACAGAUGAAAUGGCAUCUUGUGAAUUCCCAACUUGUGAGCCACUAACCCAAUUCGUAUGCAAAAGUGGAAGAUGCAUUAGCAGCAAAUGGCACUGCGACUCUGAUGACGACUGUGGGGACGGGAGUGAUGAGGUGGGCUGUGUUCACUCUUGCUUUGAUAAUCAGUUCAGAUGUUCCAGUGGCAGAUGCAUCCCAGGCCACUGGGCCUGUGAUGGUGACAAUGACUGUGGGGACUUCAGUGAUGAAGCCCAGAUCAAUUGUACUAAAGAAGAGAUUCAUUCUCCUGCUGGUUGUAACGGAAAUGAAUUUCAGUGCCACCCUGAUGGUAAUUGCGUUCCUGAUUUGUGGCGCUGUGAUGGAGAAAAAGACUGUGAAGAUGGUAGUGAUGAAAAAGGUUGCAAUGGUACCAUACGAUUGUGUGACCACAAAACCAAGUUUUCCUGUUGGAGUACAGGGAGAUGCAUCAACAAAGCAUGGGUGUGUGAUGGAGAUAUUGAUUGCGAAGAUCAGUCAGAUGAAGAUGACUGUGACAGUUUCUUGUGUGGACCACCCAAGCAUCCUUGUGCUAAUGACACCUCAGUCUGCCUGCAGCCAGAGAAACUCUGCAAUGGGAAAAAGGAUUGUCCUGAUGGCUCUGAUGAAGGCUAUCUCUGUGAUGAGUGUUCGCUGAACAAUGGAGGCUGUAGCAACCACUGUUCUGUUGUUCCUGGAAGAGGAAUUGUCUGUUCCUGCCCUGAAGGACUUCAACUCAACAAAGACAAUAAAACAUGUGAAAUUGUGGAUUAUUGUAGCAAUCAUCUAAAGUGCAGCCAAGUAUGUGAGCAGCACAAGCACACAGUCAAGUGCUCAUGUUAUGAAGGUUGGAAGCUGGAUGUAGACGGUGAAAGUUGUACAAGUGUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-368.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -394.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 302.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.............((((((...((((((.(.((.(((((((........(((......)))........))).))))...)).).))))))(((((.....(((((..((...((((((.((((.((..(((....)))..))..)))).))).)))...))..)))))....))))).....((((((((((((.........(.(((((((((.((((...((((((((...((.....((((((............((((((((((......(((.((((((((((.(((((.((((((..((((.(((((((..(((.....)))..))))))).(((((....((...((((.(((...........)))))))..))...))))).....(((...)))...)))).)))))).).)))).))..((.((((((((((.(((.((.(((((.((((((((....((.(((.(((.(((((((((..((.....))....))))))))).))).))).))...))))).))).))))).))((((((((.((((((....))))))...(((((.((((((.(.((((..(((((....))))))))).))).))))))))).....((((((((((.((((((.....)))..)))))))))))))((((((((......((..........))......))))))))...............(((((....)))))............((((....((((..(((((....)))))))))...)))).....(((((((......)))))))))))))))......((.((((((.((....((((.((((.((((.......(((((........))))))))))))).))))......)))))))).))....))))))))))).)).))..)))))))))))((.((((...))))))..........((((...))))((((((.((.....))))))))((.((((.......)))).))........)))))).))))....((((..((((.((((((...((((((.....))))))..))...))))...))))..))))...(((((((..((((......))))..))))))).....))))))...((((.((((......)).)).))))..)).))))))))...))))..))))))))).)........)))))))).))))............)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,.......,.,,((((((.{{{(,({{.{,{..{({((({,.||,,,.{{{.....,|||,,|||,,.||||,}}|,,,||||..|{{..(((((.....(((((..,,...((((((.((((.((..(((....)))..))..)))).))).)))...,,..)))))....)))))..}}},{(((({(((({...((((((((((((.,..{(((((({.{(.(((((.(((...(((.,,{{....,,.))}..))).))))).}}.....(({{((((((((((.(((((.((((((..((((.((((..(((((.,.((((....))))..}.)))))..)))).(((((,,{{(,({(((((......)))),,))....,,,,...,,}|,.}})))...)))).)))))).).)))).))|.,(.(((((((((((((..((.(((((.((((((((..,,((.(((.(((.(((((((((..{(,....))....))))))))),))).))).)).}}))))).))).))))).)),,|||(((.((((((....)))))).)}|(((,{((((((.(.((((,.(((((....))))))))).})),})))))))}.....((((((((((.((((((.....)))..)))))))))))))((((((((......((.{,,...,,,))......)))))))),,.,,,.........(((((....)))))..|.,,,.....((((....((((..(((((....)))))))))...))))..{{{(((((((......)))))))))),)))),.....((.((((((.((.,,.((((.{{{(,{{{{......((((((........))))))},,)))),))))..,}..)))))))).))....,}})))))))).)).})}.))))))))))){,{((((...))))))...{{{,...,{{,...))))..))))))),...)))))))))))),.|||||}|||}}}},|||||.|||,,|{,||.}|,,|||,||||}.((((,(((({{...((((((.....))))))..,}...)))),..))}}....,....(((((((..((((......))))..))))))).,,..,||||{,..,(,({(((..{{{{((({{{{,|,,..||.,...}}....)))))}))}}))...))))).,...})))))})),)))),...}},}}}},)))))).
Back