Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP1B_0031700

Sequence Length

996 nt

GC Content

0.4649

CCAGAACAUGCCAGGUAGACCAGUUUUCUUGCGGAAAUGGGCGUUGCAUUCCCAGAGCAUGGCUGUGUGACAGGGAAGACGACUGUGGUGACCAGACAGAUGAAAUGGCAUCUUGUGAAUUCCCAACUUGUGAGCCACUAACCCAAUUCGUAUGCAAAAGUGGAAGAUGCAUUAGCAGCAAAUGGCACUGCGACUCUGAUGACGACUGUGGGGACGGGAGUGAUGAGGUGGGCUGUGUUCACUCUUGCUUUGAUAAUCAGUUCAGAUGUUCCAGUGGCAGAUGCAUCCCAGGCCACUGGGCCUGUGAUGGUGACAAUGACUGUGGGGACUUCAGUGAUGAAGCCCAGAUCAAUUGUACUAAAGAAGAGAUUCAUUCUCCUGCUGGUUGUAACGGAAAUGAAUUUCAGUGCCACCCUGAUGGUAAUUGCGUUCCUGAUUUGUGGCGCUGUGAUGGAGAAAAAGACUGUGAAGAUGGUAGUGAUGAAAAAGGUUGCAAUGGUACCAUACGAUUGUGUGACCACAAAACCAAGUUUUCCUGUUGGAGUACAGGGAGAUGCAUCAACAAAGCAUGGGUGUGUGAUGGAGAUAUUGAUUGCGAAGAUCAGUCAGAUGAAGAUGACUGUGACAGUUUCUUGUGUGGACCACCCAAGCAUCCUUGUGCUAAUGACACCUCAGUCUGCCUGCAGCCAGAGAAACUCUGCAAUGGGAAAAAGGAUUGUCCUGAUGGCUCUGAUGAAGGCUAUCUCUGUGAUGAGUGUUCGCUGAACAAUGGAGGCUGUAGCAACCACUGUUCUGUUGUUCCUGGAAGAGGAAUUGUCUGUUCCUGCCCUGAAGGACUUCAACUCAACAAAGACAAUAAAACAUGUGAAAUUGUGGAUUAUUGUAGCAAUCAUCUAAAGUGCAGCCAAGUAUGUGAGCAGCACAAGCACACAGUCAAGUGCUCAUGUUAUGAAGGUUGGAAGCUGGAUGUAGACGGUGAAAGUUGUACAAGUGUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-296.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -315.95

Frequency: 0.0000

Diversity: 273.54

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((...........))(((.(((.(((((.((((((..((((.(((((((..(((.....)))..))))))).(((((....((...((((.(((...........)))))))..))...))))).....(((...)))...)))).)))))).).)))).)))..((((((((....(((..((.(((((.((((((((....((.(((.(((.(((((((((..((.....))....))))))))).))).))).))...))))).))).))))).))..)))(((.((((((....)))))).)))((((.((((((.(.((((..(((((....))))))))).))).))))))))......((((((((((.((((((.....)))..)))))))))))))((((((((......((..........))......))))))))...............(((((....)))))............((((....((((..(((((....)))))))))...)))).....(((((((......)))))))))))))))......((.((((((.((....((((.((((.((((.......(((((........))))))))))))).))))......)))))))).))...(((((((.(((..((((...((((((.(.(((((((((...)))))...........((((...))))((((((.((.....)))))))).((.((.(((((.......(((((.(((..((....))..))).))))).(((.(((..((...((((((.....))))))..)).))).)))....))))).)).))(((((((..((((......))))..)))))))..(((((.(((((.(((.((((..(..((((.((.......)).))))..)..).)))))).))).)).)))))...)))).).))))))))))...))))))))))..)))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((...{{{{.({{|,(,..(((,(((((.((((((,.((((.{{{{,,||||{,{,(((({{,,||||{.|.|||||..||||.{{((({.{{(.{{{{{{{...,,,)))),,))...,}}}}...,,|,{,||||}...}}}}.}}}}}},|,|}}},||}..{,((({{{,|||(((..((.(((((.((((((((..,,((.(((.(((.(((((((((..{(,....))....))))))))),))).))).)).}}))))).))).))))).))..))){((.((((((....)))))).)}|(((,{((((((.(.((((,.(((((....))))))))).})),}))))))),.....((((((((((.((((((.....)))..)))))))))))))((((((((......((.{,,...,,,))......)))))))),,.,,,.........{((({....))))).,|.,|,.....((((....((((..(((((....)))))))))...))))..{{((((((((......)))))))))),))))......((.((((((.((.,,.((((.{{{(,{{{{......{(((((........))))))},,)))),))))..,}..)))))))).))...{{{{|||,|||,.||{|...{|||{{.|,|{(((((((...))))),...|||....{(({...))))((((((||{...,,,))))))).,{,{({(((,(,,,.,,.(((((.(((..((....))..))).))))).((({{(({{((...((((((.....))))))..}}.,,)}))}..}}}),},.,,.,,(((((((..((((......))))..)))))))}}},.})}}}....{({(,(((,.,.,,,||,||,}}}}..||}},,,}},..,))))),}},.,,}},))))),..}))),),))}}}}))||...,||}}}}))},,)))