Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0032200
Sequence Length
633 nt
GC Content
0.4676
AAUUCCCAACUUGUGAGCCACUAACCCAAUUCGUAUGCAAAAGUGGAAGAUGCAUUAGCAGCAAAUGGCACUGCGACUCUGAUGACGACUGUGGGGACGGGAGUGAUGAGGUGGGCUGUGUUCACUCUUGCUUUGAUAAUCAGUUCAGAUGUUCCAGUGGCAGAUGCAUCCCAGGCCACUGGGCCUGUGAUGGUGACAAUGACUGUGGGGACUUCAGUGAUGAAGCCCAGAUCAAUUGUACUAAAGAAGAGAUUCAUUCUCCUGCUGGUUGUAACGGAAAUGAAUUUCAGUGCCACCCUGAUGGUAAUUGCGUUCCUGAUUUGUGGCGCUGUGAUGGAGAAAAAGACUGUGAAGAUGGUAGUGAUGAAAAAGGUUGCAAUGGUACCAUACGAUUGUGUGACCACAAAACCAAGUUUUCCUGUUGGAGUACAGGGAGAUGCAUCAACAAAGCAUGGGUGUGUGAUGGAGAUAUUGAUUGCGAAGAUCAGUCAGAUGAAGAUGACUGUGACAGUUUCUUGUGUGGACCACCCAAGCAUCCUUGUGCUAAUGACACCUCAGUCUGCCUGCAGCCAGAGAAACUCUGCAAUGGGAAAAAGGAUUGUCCUGAUGGCUCUGAUGAAGGCUAUCUCUGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-189.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -201.71
Frequency: 0.0000
Diversity: 135.24
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((..((((((((((((....((.......))....)))))....(((....)))(((..((.(((((.((((((((....((.(((.(((.(((((((((..((.....))....))))))))).))).))).))...))))).))).))))).))..)))(((.((((((....)))))).)))((((.((((((.(.((((..(((((....))))))))).))).))))))))......((((.....))))((.(((((((((..((......(((.(((((((((......((..........))......))))))))).)))........((((((.......(((.((.((....((((.(((..((((.(((((((((((((....)))))......((((((((((......))))))))))(((((...........)))))(((((.((....)).)))))((((..((((((........))))))......)))))))))))))))).....))).))))......)).))))).)))))).)))))))))))))...))).))))))))))..((((...))))((((((.((.....))))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((..((((((((((((....,,.......}}....)))))....(((....))}(((..((.(((((.((((((((..,,((.(((.(((.(((((((((..{(,....))....))))))))),))).))).)).}}))))).))).))))).))..)))|{{.((((((....)))))).)}|(((,{((((((.(.((((,.(((((....))))))))).})),})))))))}.....((((.....))))((.(((((((((.,((,..{,,(((.(((((((((......((.,,,...,},))......))))))))).)))........,,((((,....},|||.{{.{{.....,(({(,,..((((.,(((((...,}||}}}})),..}}}}..{(((((((((......)))))))))},{|||,.,...((.((((((,{(,{|.(({{.,{{(|{{{|......{(((((........)))))),,.)))),)))),,}),,)))))))}.)),,}}))}}}},.,},}))}}}))}))),,,)))))))))))...))).))))))))))..((((...))))((((((,((.....})))))))......
Back