Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0032400
Sequence Length
2306 nt
GC Content
0.4397
AAAACUUUUCUUUACUGACUACGGGAAUGUCGCCAAAGUGGAGAGAUGUGACAUGGAUGGGAUGAACCGAACAAGGAUAAUUGAUUCAAAGACAGAGCAGCCAGCUGCACUGGCACUAGACCUAGUCAACAAAUUGGUUUACUGGGUAGAUCUUUACUUGGACUAUGUGGGAGUAGUGGACUAUCAAGGAAAAAAUAGACACACUGUCAUUCAAGGCAGACAAGUUAGACAUCUUUAUGGUAUAACUGUGUUUGAAGAUUAUUUGUAUGCAACCAAUUCUGAUAACUACAAUAUCGUAAGGAUAAACCGAUUUAAUGGGACUGAUAUUCACUCAUUAAUUAAAAUUGAGAAUGCUUGGGGAAUCCGAAUUUAUCAAAAAAGAACUCAACCAACAGUCAGAAGCCAUGCAUGUGAAGUCGAUCCAUAUGGAAUGCCAGGGGGCUGUUCACACAUCUGUCUACUCAGCAGCAGUUACAAAACUCGGACUUGUCGCUGCAGGACUGGCUUCAACUUGGGAAGUGAUGGCAGGUCAUGCAAAAGACCAAAGAAUGAGUUGUUCCUCUUUUAUGGGAAAGGACGCCCAGGAAUUGUUAGAGGAAUGGACUUGAAUACCAAGAUAGCUGAUGAAUACAUGAUCCCCAUAGAAAAUCUGGUAAACCCUCGUGCUUUAGACUUUCACGCAGAAACCAAUUACAUCUACUUUGCUGACACCACCAGUUUCCUAAUUGGCCGGCAGAAGAUAGAUGGCACAGAGAGAGAAACCAUCCUGAAAGAUGAUCUGGAUAAUGUAGAGGGCAUUGCUGUGGACUGGAUUGGAAAUAAUCUUUACUGGACCAAUGAUGGCCAUAGGAAAACCAUUAAUGUGGCCAGGCUGGAAAAAGCUUCUCAGAGUCGGAAGACUCUUUUAGAGGGUGAAAUGUCUCAUCCCAGAGGAAUUGUGGUGGAUCCAGUUAAUGGUUGGAUGUAUUGGACAGACUGGGAGGAAGAUGAAAUAGAUGACAGCGUGGGAAGGAUUGAGAAGGCCUGGAUGGAUGGAUUCAAUCGGCAGAUUUUUGUGACUUCAAAGAUGCUGUGGCCAAACGGUUUAACUCUGGACUUUCACACCAACACAUUAUACUGGUGUGAUGCCUAUUACGAUCAUAUUGAAAAAGUAUUUUUGAAUGGGACUCACAGGAAGAUUGUUUACAGUGGGAGAGAGUUGAACCACCCUUUCGGACUGUCGCAUCAUGGAAAUUAUGUGUUCUGGACUGAUUAUAUGAAUGGUUCCAUUUUUCAACUAGAUUUGAUAACAAGUGAGGUGACAUUGCUGAGGCAUGAAAGACCACCCCUAUUUGGGCUUCAGAUUUAUGAUCCACGAAAGCAACAAGGUGACAAUAUGUGCCGAGUAAAUAAUGGGGGCUGUAGUACACUUUGCUUGGCUAUCCCAGGAGGCCGGGUGUGUGCUUGUGCCGAUAAUCAACUUUUGGAUGAAAAUGGGACAACUUGCACAUUUAAUCCUGGAGAAGCACUACCUCACAUAUGUAAAGCUGGAGAGUUUCGCUGCAAAAACAGACACUGUAUCCAAGCUCGGUGGAAAUGUGAUGGCGACGAUGACUGCCUAGACGGAAGCGAUGAGGAUUCAGUAAACUGCUUCAAUCAUAGCUGUCCUGAUGAUCAGUUUAAAUGCCAGAAUAAUCGCUGCAUCCCCAAGAGAUGGCUUUGUGAUGGAGCUAAUGACUGUGGGAGCAAUGAAGAUGAAUCCAAUCAAACUUGCACAGCCAGAACAUGCCAGGUAGACCAGUUUUCUUGCGGAAAUGGGCGUUGCAUUCCCAGAGCAUGGCUGUGUGACAGGGAAGACGACUGUGGUGACCAGACAGAUGAAAUGGCAUCUUGUGAAUUCCCAACUUGUGAGCCACUAACCCAAUUCGUAUGCAAAAGUGGAAGAUGCAUUAGCAGCAAAUGGCACUGCGACUCUGAUGACGACUGUGGGGACGGGAGUGAUGAGGUGGGCUGUGUUCACUCUUGCUUUGAUAAUCAGUUCAGAUGUUCCAGUGGCAGAUGCAUCCCAGGCCACUGGGCCUGUGAUGGUGACAAUGACUGUGGGGACUUCAGUGAUGAAGCCCAGAUCAAUUGUACUAAAGAAGAGAUUCAUUCUCCUGCUGGUUGUAACGGAAAUGAAUUUCAGUGCCACCCUGAUGGUAAUUGCGUUCCUGAUUUGUGGCGCUGUGAUGGAGAAAAAGACUGUGAAGAUGGUAGUGAUGAAAAAGGUUGCAAUGGUACCAUACGAUUGUGUGACCACAAAACCAAGUUUUCCUGUUGGAGUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-665.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -709.12
Frequency: 0.0000
Diversity: 555.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((.(.(((((((..((((((((....((((..(((....(.((..(((......)))..)).)....)))..))))....(((.((((....)))).))).......(((((((.(((......))).)))))))..((((((((((.(..((((((((..((((((.((..((((.....(((...(((((((((......)))))...........(((((((((((((...((((((...(((....(((....))).....)))...))).))))))))))))))))...((........))(((((.......((((...........))))..((.(((((........................))))).)).)))))(((.(((((.((((((.........))))))(((((((....))).))))...(((((((((..(((.((.(((((.......((...((((((((.((((..(..((((.....((((((((((((.(.((((........)))).....((.(((((((((((((((.((((........)))).))).....)))))).....((((.....)))))))))).)).....(((..(((.((.((((((.(((((..((((((((((.......((((.....)))).......((((((((((((((......((((((....)))))).)))))).)).)))))))))).)))........((((......)))).((((.......)))).(((((.(((((((((((((((.(..((((((((..((((........((((((((..((.....))..))))))))((((......)))).(((((((((....))))))....)))(((((......)))))))))))).)))))..).)))))))))..(((((((((.((((.(((((.((((((((...........(.(.(((((((..((((...((((((.((((((((......)))))...)))...))))))...))))....))))))).).)....(((((((((((......((((((((...........))))))))..((((((.(((..(((((.....)))))..))))))))).(((((.(............).)))))..)))))))))))..)))))))).)))))((((.((....)).))))((((((((((((((((..(((((....))))).((((......))))..(((.((((((((.(((..(((((((..(((((.......)).)))..)))))))....)))...........((((((((((((.(((.((.((.(........).)).))))).)).))))))).)))(((.((((((((....(((((((((.((((.(((...(((........))).....))).))))..)))))))))..)))))).)))))..))))))))...)))....((((..(((((((.(((....(((..(((((..........)))))....)))....))).))).))))..))))..((((((.((((.((..(((....)))..))..)))).))).)))..))))))))).......)))))))..(((.(((.((((((.....(((((((.....))))))).....)).))))))).))).)))).)))))))))......))))))......))))).)))..))))))))))))).))).)))).)))))).))))))))))..).))))))))))))...)).))))))).)))..)))))))))..))))).))))))).))).....))))..)))))))).))))...))))..)..)))).))))))((....)).(((..((.(((((.((((((((....((.(((.(((.(((((((((..((.....))....))))))))).))).))).))...))))).))).))))).))..)))(((.((((((....)))))).))))))))).))..)))))(((.(((((....))))))))....................((((((((((.((((((.....)))..)))))))))))))((((((((......((..........))......)))))))))).)))))))))...(((((....)))))............((((....((((..(((((....)))))))))...)))).))))))(.(((......))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((,,,|||((,((((..{,(((({{((((((({...,{||,..,|{||,||,{(,,(((......|||..||.}}...,}),,))),....,{{.((((,,..}}}}.}||{|{{{..(((((((.(((......))).)))))))..{(((((((((.,.,((((((((..((((((.((..((((.......,.{,{,,.(((((......))))).,,{{{{,...((({{{{{{{{{{..,|{|{||,,.{((,,.,(((,...||,...,||||,,,}}}.}}}}}}}})))}))))....,,,,{(((((((..{({...})})))))))}......|||{,.....{((({,,.|}}}}.,,,.}},.....,..,|........,})}|||,{{{{|,||||{{||,,,..|||,,.|{({{,,|||,,|}||,||}},,,(((((((((..(((.({,(((((.......((...((((((((.((((..(..((({....,((((((((((((.(.((((........))))......,{(((((((((((((({.((((........)))).})).....)))))))),,,|||{.....}}}}..,,}}.,,.....(((..(((.((.((((((.(((((..((((((((((.......{(((.....)))}.......((((((((((((((......((((((....)))))).)))))))}).)))))))))).)))........((((......)))).|{{{.,.....)})}.((((({(((((((({((((((.(..{{{(((({,.((({.,,,....((((((((..{,.....}}..))))))))((((......)))){((,((((((....))))))...,))|(((((......)))))))))})),,))))..},)))))))))..(((((((((.{{{{.(((((.((((((((...........,.{.(((((((..((((...{(((({.((({(({(,,,...,)))).,})))...)))))}...))))....))))))).}.,....(((((((((((...{{,(((({{{(..,........|}}|||||..((((((.(((..(((((.....)))))..))))))))).{||||,,..,,..,,)}....)))))}})))))))))))..)))))))).))))),||,{{(,...,}})))|((((((((((((((((..(((((....))))}.((({......}))}..{{{.((((((((.{{{..(((((((.,{({,,.......|,.}}}},)))))))....)))..,.....,{{(({{{(((((((.(((.((.((.(........).)).))))).)).))))))),))}(((.((((((((....{((((((({.((((.(({.,..(((.{,...}).)))..,))).))))..,)))))))}..)))))).)))))..))))))))...}}}...,((((..(((((((.(((....(((..(((((..........)))))....)))....))).))).))))..)))).,((((((.((((.((..(((....)))..))..)))).))).)))..))))))))).......)))))))}.(((.(((.(((({,{{...(((((((.....))))))).}..})}.))))))).))).}))}.))))))))}......)))))),}....})))).)))..))))))))))))).))).)))).)))))).))))))))))..}.))))))))))))...}}.))))))).)))..)))))))))..))))).)))})}).}))))}..))))..)))))))).))))...)))).,}..})))))}}))}((....)),(((..((.(((((.((((((((..,,((.(((.(((.(((((((((..{(,....))....)))))))))}))).))).)).}}))))).))).))))).))..))){((.((((((....)))))).))}|{{||(((({{,|.{{(({.(((((....))))))))}.,}}.,))))})}......((((((((((.((((((.....)))..)))))))))))))|||||||{....,{(({{{{{{{{..||{..{{{||,|||||{{..,,.{{.......||,|....))))).)).)}))}..}||,|}}}}|,{|},|||{|..,{|||,},})),,,,}}}.,}}}))}||||...,}}),))
Back