Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0033200
Sequence Length
1347 nt
GC Content
0.4543
AUCUGGAUAAUGUAGAGGGCAUUGCUGUGGACUGGAUUGGAAAUAAUCUUUACUGGACCAAUGAUGGCCAUAGGAAAACCAUUAAUGUGGCCAGGCUGGAAAAAGCUUCUCAGAGUCGGAAGACUCUUUUAGAGGGUGAAAUGUCUCAUCCCAGAGGAAUUGUGGUGGAUCCAGUUAAUGGUUGGAUGUAUUGGACAGACUGGGAGGAAGAUGAAAUAGAUGACAGCGUGGGAAGGAUUGAGAAGGCCUGGAUGGAUGGAUUCAAUCGGCAGAUUUUUGUGACUUCAAAGAUGCUGUGGCCAAACGGUUUAACUCUGGACUUUCACACCAACACAUUAUACUGGUGUGAUGCCUAUUACGAUCAUAUUGAAAAAGUAUUUUUGAAUGGGACUCACAGGAAGAUUGUUUACAGUGGGAGAGAGUUGAACCACCCUUUCGGACUGUCGCAUCAUGGAAAUUAUGUGUUCUGGACUGAUUAUAUGAAUGGUUCCAUUUUUCAACUAGAUUUGAUAACAAGUGAGGUGACAUUGCUGAGGCAUGAAAGACCACCCCUAUUUGGGCUUCAGAUUUAUGAUCCACGAAAGCAACAAGGUGACAAUAUGUGCCGAGUAAAUAAUGGGGGCUGUAGUACACUUUGCUUGGCUAUCCCAGGAGGCCGGGUGUGUGCUUGUGCCGAUAAUCAACUUUUGGAUGAAAAUGGGACAACUUGCACAUUUAAUCCUGGAGAAGCACUACCUCACAUAUGUAAAGCUGGAGAGUUUCGCUGCAAAAACAGACACUGUAUCCAAGCUCGGUGGAAAUGUGAUGGCGACGAUGACUGCCUAGACGGAAGCGAUGAGGAUUCAGUAAACUGCUUCAAUCAUAGCUGUCCUGAUGAUCAGUUUAAAUGCCAGAAUAAUCGCUGCAUCCCCAAGAGAUGGCUUUGUGAUGGAGCUAAUGACUGUGGGAGCAAUGAAGAUGAAUCCAAUCAAACUUGCACAGCCAGAACAUGCCAGGUAGACCAGUUUUCUUGCGGAAAUGGGCGUUGCAUUCCCAGAGCAUGGCUGUGUGACAGGGAAGACGACUGUGGUGACCAGACAGAUGAAAUGGCAUCUUGUGAAUUCCCAACUUGUGAGCCACUAACCCAAUUCGUAUGCAAAAGUGGAAGAUGCAUUAGCAGCAAAUGGCACUGCGACUCUGAUGACGACUGUGGGGACGGGAGUGAUGAGGUGGGCUGUGUUCACUCUUGCUUUGAUAAUCAGUUCAGAUGUUCCAGUGGCAGAUGCAUCCCAGGCCACUGGGCCUGUGAUGGUGACAAUGACUGUGGGGACUUCAGUGAUGAAGCCCAGAUCAAUUGUACUAAAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-405.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -431.05
Frequency: 0.0000
Diversity: 294.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((...((((....(((..(((.((.(((((((((.(..((((((((..((((........((((((((..((.....))..))))))))((((......)))).(((((((((....))))))....)))(((((......)))))))))))).)))))..).)))))))))..(((((((((.((((.(((((.((((((((...........(.(.(((((((..((((...((((((.((((((((......)))))...)))...))))))...))))....))))))).).)....(((((((((((......((((((((...........))))))))..((((((.(((..(((((.....)))))..))))))))).(((((.(............).)))))..)))))))))))..)))))))).)))))((((.((....)).))))((((((((((((((((..(((((....))))).((((......))))..(((.((((((((.(((..(((((((..(((((.......)).)))..)))))))....)))...........((((((((((((.(((.((.((.(........).)).))))).)).))))))).)))(((.((((((((....(((((((((.((((.(((...(((........))).....))).))))..)))))))))..)))))).)))))..))))))))...)))....((((..(((((((.(((....(((..(((((..........)))))....)))....))).))).))))..))))..((((((.((((.((..(((....)))..))..)))).))).)))..))))))))).......)))))))..(((.(((.((((((.....(((((((.....))))))).....)).))))))).))).)))).))))))))).))..)))..)))...)))).))))))...(((.(((((.((((((..((((.(((((((..(((.....)))..))))))).(((((....((...((((.(((...........)))))))..))...))))).....(((...)))...)))).)))))).).)))).)))....(((....)))(((..((.(((((.((((((((....((.(((.(((.(((((((((..((.....))....))))))))).))).))).))...))))).))).))))).))..)))(((.((((((....)))))).)))((((.((((((.(.((((..(((((....))))))))).))).)))))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,((((...,(,(,...((({{{((((({(((((((((.(..((((((((,.((((.,,.....((((((((..{,.....}}..))))))))((((......)))){((,((((((....))))))...,))|(((((......)))))))))})),}))))..).)))))))))..{((((((((.{{{{.(((((.((((((((...........,.{.(((((((..((((...{(((({.((({(({(,,,...,)))).,})))...)))))}...))))....))))))).}.,....(((((((((((...{{,(((({{{(..,........|}}|||||..((((((.(((..(((((.....)))))..))))))))).{||||,,..,,..,,)}....)))))}})))))))))))..)))))))).))))),||,{{({....,,))}|((((((((((((((((..(((((....))))}.((({......})))..{{{.((((((((.{{{..(((((((.,{({,,.......|,.}}}},)))))))....)))..,.....,{{(({{{(((((((.(((.((.((.(........).)).))))).)).))))))),))}(((.((((((((....{((((((({.((((.(({.,..(((.{,...}).)))..,))).))))..,)))))))}..)))))).)))))..))))))))...}}}...,((((..(((((((.(((....(((..(((((..........)))))....)))....))).))).))))..)))).,((((((.((((.((..(((....)))..))..)))}.))).)))..))))))))).......))))))),.(((.(((.(((({,{{...(((((((.....))))))).}..})}.))))))).))).}}),.})))))))}.....,))}}))|,....})})),.|)}.,|||}|(((({((((((..((((.((((..(((((.,.((((....))))..).)))))..)))).(((((,,{{(,{{(((((......)))),,))....,},,...,,}|,.}})))...)))).)))))},|,}}}|,||}....|||,},.)))(((..((.(((((.((((((((..,,{(.(((.(((.(((((((((..{(,....))....)))))))))}))).))).)).}}))))).))).))))).))..)))|{{.((((((....)))))).)}|(((,{(((({{.{.{{((,.(((((....))))))))).})},}))))))),,}}}}}
Back