Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP1B_0034100

Sequence Length

1984 nt

GC Content

0.4370

AAAACUUUUCUUUACUGACUACGGGAAUGUCGCCAAAGUGGAGAGAUGUGACAUGGAUGGGAUGAACCGAACAAGGAUAAUUGAUUCAAAGACAGAGCAGCCAGCUGCACUGGCACUAGACCUAGUCAACAAAUUGGUUUACUGGGUAGAUCUUUACUUGGACUAUGUGGGAGUAGUGGACUAUCAAGGAAAAAAUAGACACACUGUCAUUCAAGGCAGACAAGUUAGACAUCUUUAUGGUAUAACUGUGUUUGAAGAUUAUUUGUAUGCAACCAAUUCUGAUAACUACAAUAUCGUAAGGAUAAACCGAUUUAAUGGGACUGAUAUUCACUCAUUAAUUAAAAUUGAGAAUGCUUGGGGAAUCCGAAUUUAUCAAAAAAGAACUCAACCAACAGUCAGAAGCCAUGCAUGUGAAGUCGAUCCAUAUGGAAUGCCAGGGGGCUGUUCACACAUCUGUCUACUCAGCAGCAGUUACAAAACUCGGACUUGUCGCUGCAGGACUGGCUUCAACUUGGGAAGUGAUGGCAGGUCAUGCAAAAGACCAAAGAAUGAGUUGUUCCUCUUUUAUGGGAAAGGACGCCCAGGAAUUGUUAGAGGAAUGGACUUGAAUACCAAGAUAGCUGAUGAAUACAUGAUCCCCAUAGAAAAUCUGGUAAACCCUCGUGCUUUAGACUUUCACGCAGAAACCAAUUACAUCUACUUUGCUGACACCACCAGUUUCCUAAUUGGCCGGCAGAAGAUAGAUGGCACAGAGAGAGAAACCAUCCUGAAAGAUGAUCUGGAUAAUGUAGAGGGCAUUGCUGUGGACUGGAUUGGAAAUAAUCUUUACUGGACCAAUGAUGGCCAUAGGAAAACCAUUAAUGUGGCCAGGCUGGAAAAAGCUUCUCAGAGUCGGAAGACUCUUUUAGAGGGUGAAAUGUCUCAUCCCAGAGGAAUUGUGGUGGAUCCAGUUAAUGGUUGGAUGUAUUGGACAGACUGGGAGGAAGAUGAAAUAGAUGACAGCGUGGGAAGGAUUGAGAAGGCCUGGAUGGAUGGAUUCAAUCGGCAGAUUUUUGUGACUUCAAAGAUGCUGUGGCCAAACGGUUUAACUCUGGACUUUCACACCAACACAUUAUACUGGUGUGAUGCCUAUUACGAUCAUAUUGAAAAAGUAUUUUUGAAUGGGACUCACAGGAAGAUUGUUUACAGUGGGAGAGAGUUGAACCACCCUUUCGGACUGUCGCAUCAUGGAAAUUAUGUGUUCUGGACUGAUUAUAUGAAUGGUUCCAUUUUUCAACUAGAUUUGAUAACAAGUGAGGUGACAUUGCUGAGGCAUGAAAGACCACCCCUAUUUGGGCUUCAGAUUUAUGAUCCACGAAAGCAACAAGGUGACAAUAUGUGCCGAGUAAAUAAUGGGGGCUGUAGUACACUUUGCUUGGCUAUCCCAGGAGGCCGGGUGUGUGCUUGUGCCGAUAAUCAACUUUUGGAUGAAAAUGGGACAACUUGCACAUUUAAUCCUGGAGAAGCACUACCUCACAUAUGUAAAGCUGGAGAGUUUCGCUGCAAAAACAGACACUGUAUCCAAGCUCGGUGGAAAUGUGAUGGCGACGAUGACUGCCUAGACGGAAGCGAUGAGGAUUCAGUAAACUGCUUCAAUCAUAGCUGUCCUGAUGAUCAGUUUAAAUGCCAGAAUAAUCGCUGCAUCCCCAAGAGAUGGCUUUGUGAUGGAGCUAAUGACUGUGGGAGCAAUGAAGAUGAAUCCAAUCAAACUUGCACAGCCAGAACAUGCCAGGUAGACCAGUUUUCUUGCGGAAAUGGGCGUUGCAUUCCCAGAGCAUGGCUGUGUGACAGGGAAGACGACUGUGGUGACCAGACAGAUGAAAUGGCAUCUUGUGAAUUCCCAACUUGUGAGCCACUAACCCAAUUCGUAUGCAAAAGUGGAAGAUGCAUUAGCAGCAAAUGGCACUGCGACUCUGAUGACGACUGUGGGGACGGGAGUGAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-558.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -594.19

Frequency: 0.0000

Diversity: 392.78

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(..((.((((((((((.....(((.....)))....)))))))))).)).........((......))((((((......))).))).........((((((((((((....((.....(((((((.(((......))).)))))))..((((((((((.(..((((((((..((((((.((..((((.....(((...(((((((((......)))))...........(((((((((((((...((((((...(((....(((....))).....)))...))).))))))))))))))))...((........))(((((.......((((...........))))..((.(((((........................))))).)).)))))(((.(((((.((((((.........))))))(((((((....))).))))...(((((((((..(((.((.(((((.......((...((((((((.((((..(..((((.....((((((((((((.(.((((........)))).....((.(((((((((((((((.((((........)))).))).....)))))).....((((.....)))))))))).)).....(((..(((.((.((((((.(((((..((((((((((.......((((.....)))).......((((((((((((((......((((((....)))))).)))))).)).)))))))))).)))........((((......)))).((((.......)))).(((((.(((((((((((((((.(..((((((((..((((........((((((((..((.....))..))))))))((((......)))).(((((((((....))))))....)))(((((......)))))))))))).)))))..).)))))))))..(((((((((.((((.(((((.((((((((...........(.(.(((((((..((((...((((((.((((((((......)))))...)))...))))))...))))....))))))).).)....(((((((((((......((((((((...........))))))))..((((((.(((..(((((.....)))))..))))))))).(((((.(............).)))))..)))))))))))..)))))))).)))))((((.((....)).))))((((((((((((((((..(((((....))))).((((......))))..(((.((((((((.(((..(((((((..(((((.......)).)))..)))))))....)))...........((((((((((((.(((.((.((.(........).)).))))).)).))))))).)))(((.((((((((....(((((((((.((((.(((...(((........))).....))).))))..)))))))))..)))))).)))))..))))))))...)))....((((..(((((((.(((....(((..(((((..........)))))....)))....))).))).))))..))))..((((((.((((.((..(((....)))..))..)))).))).)))..))))))))).......)))))))..(((.(((.((((((.....(((((((.....))))))).....)).))))))).))).)))).)))))))))......))))))......))))).)))..))))))))))))).))).)))).)))))).))))))))))..).))))))))))))...)).))))))).)))..)))))))))..))))).))))))).))).....))))..)))))))).))))...))))..)..)))).))))))))....)))))...))))..)))...)((.((.((..((((....))))..)).)).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(..((.((((((((((.....{({.....))}....)))))))))).))....(({,(,(,.,...||,..,,.}}....}}.}))),........((((((((((((....((.....(((((((.(((......))).)))))))..((((((((((.,..((((((((..((((((.((..((((.........,,{,..(((((......)))))...,{{{....(((((((((((((...{((({{,,.(((,,.,(((,...||}...,|})}.,,}}}.}}})))))))))))))....,,,,{(((((((..{({...})})))))))}......|||{,.....{((({,,.{}}|}.,,..}}......,..,|........,}}}|||,(((({,|||{((||,,,,.|{|...|{({{,,|||.,,)}},|})),,,(((((((((..(((.({,(((((.......((...((((((((.((((..(..((({....,((((((((((((.(.((((........))))......,,(((((((((((((({.((((........)))).})).....)))))))},,,|||{.....}}}}..,,}}.,,.....(((..(((.((.((((((.(((((..((((((((((.......{(((.....)))}.......((((((((((((((......((((((....)))))).)))))))}).)))))))))).)))........((((......)))).|{{{.,.....)))}.((((({(((((((((((((((.(..{(((((({,.((((.,,,....((((((((..{,.....}}..))))))))((((......)))){((,((((((....))))))...,))|(((((......)))))))))})),,))))..}.)))))))))..(((((((((.{{{{.(((((.((((((((...........,.{.(((((((..((((...{(((({.((({(({(,,,...,)))).,})))...)))))}...))))....))))))).}.,....(((((((((((...{{,(((({{{(..,........|}}|||||..((((((.(((..(((((.....)))))..))))))))).{||||,,..,,..,,)}....)))))}})))))))))))..)))))))).))))),||,{((,...,}})))|((((((((((((((((..(((((....))))}.((({......}))}..{{{.((((((((.{{{..(((((((.,{({,,.......|,.}}}},)))))))....)))..,.....,{{(({{{(((((((.(((.((.((.(........).)).))))).)).))))))),))}(((.((((((((....{((((((({.((((.(({.,..(((.{,...}).)))..,))).))))..,)))))))}..)))))).)))))..))))))))...}}}...,((((..(((((((.(((....(((..(((((..........)))))....)))....))).))).))))..)))).,((((((.((((.((..(((....)))..))..)))).))).)))..))))))))).......)))))))}.(((.(((.(((({,{{...(((((((.....))))))).}..})}.))))))).))).}))}.))))))))}......)))))),}....})))).)))..))))))))))))).))).)))).)))))).))))))))))..).))))))))))))...)}.))))))).)))..)))))))))..))))).)))})}),}))))}..))))..)))))))).))))...))))..}..))))}))))))))....)))))...))))..)))...)((.((.((..((((....))))..)).)).))