Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0035200
Sequence Length
1479 nt
GC Content
0.4490
UCAGAAGCCAUGCAUGUGAAGUCGAUCCAUAUGGAAUGCCAGGGGGCUGUUCACACAUCUGUCUACUCAGCAGCAGUUACAAAACUCGGACUUGUCGCUGCAGGACUGGCUUCAACUUGGGAAGUGAUGGCAGGUCAUGCAAAAGACCAAAGAAUGAGUUGUUCCUCUUUUAUGGGAAAGGACGCCCAGGAAUUGUUAGAGGAAUGGACUUGAAUACCAAGAUAGCUGAUGAAUACAUGAUCCCCAUAGAAAAUCUGGUAAACCCUCGUGCUUUAGACUUUCACGCAGAAACCAAUUACAUCUACUUUGCUGACACCACCAGUUUCCUAAUUGGCCGGCAGAAGAUAGAUGGCACAGAGAGAGAAACCAUCCUGAAAGAUGAUCUGGAUAAUGUAGAGGGCAUUGCUGUGGACUGGAUUGGAAAUAAUCUUUACUGGACCAAUGAUGGCCAUAGGAAAACCAUUAAUGUGGCCAGGCUGGAAAAAGCUUCUCAGAGUCGGAAGACUCUUUUAGAGGGUGAAAUGUCUCAUCCCAGAGGAAUUGUGGUGGAUCCAGUUAAUGGUUGGAUGUAUUGGACAGACUGGGAGGAAGAUGAAAUAGAUGACAGCGUGGGAAGGAUUGAGAAGGCCUGGAUGGAUGGAUUCAAUCGGCAGAUUUUUGUGACUUCAAAGAUGCUGUGGCCAAACGGUUUAACUCUGGACUUUCACACCAACACAUUAUACUGGUGUGAUGCCUAUUACGAUCAUAUUGAAAAAGUAUUUUUGAAUGGGACUCACAGGAAGAUUGUUUACAGUGGGAGAGAGUUGAACCACCCUUUCGGACUGUCGCAUCAUGGAAAUUAUGUGUUCUGGACUGAUUAUAUGAAUGGUUCCAUUUUUCAACUAGAUUUGAUAACAAGUGAGGUGACAUUGCUGAGGCAUGAAAGACCACCCCUAUUUGGGCUUCAGAUUUAUGAUCCACGAAAGCAACAAGGUGACAAUAUGUGCCGAGUAAAUAAUGGGGGCUGUAGUACACUUUGCUUGGCUAUCCCAGGAGGCCGGGUGUGUGCUUGUGCCGAUAAUCAACUUUUGGAUGAAAAUGGGACAACUUGCACAUUUAAUCCUGGAGAAGCACUACCUCACAUAUGUAAAGCUGGAGAGUUUCGCUGCAAAAACAGACACUGUAUCCAAGCUCGGUGGAAAUGUGAUGGCGACGAUGACUGCCUAGACGGAAGCGAUGAGGAUUCAGUAAACUGCUUCAAUCAUAGCUGUCCUGAUGAUCAGUUUAAAUGCCAGAAUAAUCGCUGCAUCCCCAAGAGAUGGCUUUGUGAUGGAGCUAAUGACUGUGGGAGCAAUGAAGAUGAAUCCAAUCAAACUUGCACAGCCAGAACAUGCCAGGUAGACCAGUUUUCUUGCGGAAAUGGGCGUUGCAUUCCCAGAGCAUGGCUGUGUGACAGGGAAGACGACUGUGGUGACCAGACAGAUGAAAUGGCAUCUUGUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-438.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -463.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 263.76
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((.(((((.((((((.........))))))(((((((....))).))))...(((((((((..(((.((.(((((.......((...((((((((.((((..(..((((.....((((((((((((.(.((((........)))).....((.(((((((((((((((.((((........)))).))).....)))))).....((((.....)))))))))).)).....(((..(((.((.((((((.(((((..((((((((((.......((((.....)))).......((((((((((((((......((((((....)))))).)))))).)).)))))))))).)))........((((......)))).((((.......)))).(((((.(((((((((((((((.(..((((((((..((((........((((((((..((.....))..))))))))((((......)))).(((((((((....))))))....)))(((((......)))))))))))).)))))..).)))))))))..(((((((((.((((.(((((.((((((((...........(.(.(((((((..((((...((((((.((((((((......)))))...)))...))))))...))))....))))))).).)....(((((((((((......((((((((...........))))))))..((((((.(((..(((((.....)))))..))))))))).(((((.(............).)))))..)))))))))))..)))))))).)))))((((.((....)).))))((((((((((((((((..(((((....))))).((((......))))..(((.((((((((.(((..(((((((..(((((.......)).)))..)))))))....)))...........((((((((((((.(((.((.((.(........).)).))))).)).))))))).)))(((.((((((((....(((((((((.((((.(((...(((........))).....))).))))..)))))))))..)))))).)))))..))))))))...)))....((((..(((((((.(((....(((..(((((..........)))))....)))....))).))).))))..))))..((((((.((((.((..(((....)))..))..)))).))).)))..))))))))).......)))))))..(((.(((.((((((.....(((((((.....))))))).....)).))))))).))).)))).)))))))))......))))))......))))).)))..))))))))))))).))).)))).)))))).))))))))))..).))))))))))))...)).))))))).)))..)))))))))..))))).)))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((.(((((.,,(((({{.....{{|,,,||(,,,,||}..,))).,)))}},(((((((((..(((.({,(((((.......((...((((((((.((((..(..((((....,((((((((((((.(.((((........))))......,,(((((((((((((({.((((........)))).})).....)))))))},,,|||{.....}}}}..,,}}.,,.....(((..(((.((.((((((.(((((..((((((((((.......{(((.....)))}.......((((((((((((((......((((((....)))))).)))))))}).)))))))))).)))........((((......)))).|{{{.,.....)))}.((((({(((((((((((((((.(..{(((((({,.((((.,,,....((((((((..{,.....}}..))))))))((((......)))){((,((((((....))))))...,))|(((((......)))))))))})),,))))..}.)))))))))..(((((((((.{{{{.(((((.((((((((...........,.{.(((((((..((((...{(((({.((({(({(,,,...,)))).,})))...)))))}...))))....))))))).}.,....(((((((((((...{{,(((({{{(..,........|}}|||||..((((((.(((..(((((.....)))))..))))))))).{||||,,..,,..,,)}....)))))}})))))))))))..)))))))).))))),||,{((,...,}})))|((((((((((((((((..(((((....))))}.((({......}))}..{{{.((((((((.{{{..(((((((.,{({,,.......|,.}}}},)))))))....)))..,.....,{{(({{{(((((((.(((.((.((.(........).)).))))).)).))))))),))}(((.((((((((....{((((((({.((((.(({.,..(((.{,...}).)))..,))).))))..,)))))))}..)))))).)))))..))))))))...}}}...,((((..(((((((.(((....(((..(((((..........)))))....)))....))).))).))))..)))).,((((((.((((.((..(((....)))..))..)))).))).)))..))))))))).......)))))))}.(((.(((.(((({,{{...(((((((.....))))))).}..})}.))))))).))).}))}.))))))))}......)))))),}....})))).)))..))))))))))))).))).)))).)))))).))))))))))..}.))))))))))))...)).))))))).)))..)))))))))..))))).)))....
Back