Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0035800
Sequence Length
1757 nt
GC Content
0.4280
AAAACUUUUCUUUACUGACUACGGGAAUGUCGCCAAAGUGGAGAGAUGUGACAUGGAUGGGAUGAACCGAACAAGGAUAAUUGAUUCAAAGACAGAGCAGCCAGCUGCACUGGCACUAGACCUAGUCAACAAAUUGGUUUACUGGGUAGAUCUUUACUUGGACUAUGUGGGAGUAGUGGACUAUCAAGGAAAAAAUAGACACACUGUCAUUCAAGGCAGACAAGUUAGACAUCUUUAUGGUAUAACUGUGUUUGAAGAUUAUUUGUAUGCAACCAAUUCUGAUAACUACAAUAUCGUAAGGAUAAACCGAUUUAAUGGGACUGAUAUUCACUCAUUAAUUAAAAUUGAGAAUGCUUGGGGAAUCCGAAUUUAUCAAAAAAGAACUCAACCAACAGUCAGAAGCCAUGCAUGUGAAGUCGAUCCAUAUGGAAUGCCAGGGGGCUGUUCACACAUCUGUCUACUCAGCAGCAGUUACAAAACUCGGACUUGUCGCUGCAGGACUGGCUUCAACUUGGGAAGUGAUGGCAGGUCAUGCAAAAGACCAAAGAAUGAGUUGUUCCUCUUUUAUGGGAAAGGACGCCCAGGAAUUGUUAGAGGAAUGGACUUGAAUACCAAGAUAGCUGAUGAAUACAUGAUCCCCAUAGAAAAUCUGGUAAACCCUCGUGCUUUAGACUUUCACGCAGAAACCAAUUACAUCUACUUUGCUGACACCACCAGUUUCCUAAUUGGCCGGCAGAAGAUAGAUGGCACAGAGAGAGAAACCAUCCUGAAAGAUGAUCUGGAUAAUGUAGAGGGCAUUGCUGUGGACUGGAUUGGAAAUAAUCUUUACUGGACCAAUGAUGGCCAUAGGAAAACCAUUAAUGUGGCCAGGCUGGAAAAAGCUUCUCAGAGUCGGAAGACUCUUUUAGAGGGUGAAAUGUCUCAUCCCAGAGGAAUUGUGGUGGAUCCAGUUAAUGGUUGGAUGUAUUGGACAGACUGGGAGGAAGAUGAAAUAGAUGACAGCGUGGGAAGGAUUGAGAAGGCCUGGAUGGAUGGAUUCAAUCGGCAGAUUUUUGUGACUUCAAAGAUGCUGUGGCCAAACGGUUUAACUCUGGACUUUCACACCAACACAUUAUACUGGUGUGAUGCCUAUUACGAUCAUAUUGAAAAAGUAUUUUUGAAUGGGACUCACAGGAAGAUUGUUUACAGUGGGAGAGAGUUGAACCACCCUUUCGGACUGUCGCAUCAUGGAAAUUAUGUGUUCUGGACUGAUUAUAUGAAUGGUUCCAUUUUUCAACUAGAUUUGAUAACAAGUGAGGUGACAUUGCUGAGGCAUGAAAGACCACCCCUAUUUGGGCUUCAGAUUUAUGAUCCACGAAAGCAACAAGGUGACAAUAUGUGCCGAGUAAAUAAUGGGGGCUGUAGUACACUUUGCUUGGCUAUCCCAGGAGGCCGGGUGUGUGCUUGUGCCGAUAAUCAACUUUUGGAUGAAAAUGGGACAACUUGCACAUUUAAUCCUGGAGAAGCACUACCUCACAUAUGUAAAGCUGGAGAGUUUCGCUGCAAAAACAGACACUGUAUCCAAGCUCGGUGGAAAUGUGAUGGCGACGAUGACUGCCUAGACGGAAGCGAUGAGGAUUCAGUAAACUGCUUCAAUCAUAGCUGUCCUGAUGAUCAGUUUAAAUGCCAGAAUAAUCGCUGCAUCCCCAAGAGAUGGCUUUGUGAUGGAGCUAAUGACUGUGGGAGCAAUGAAGAUGAAUCCAAUCAAACUUGCACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-480.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -514.14
Frequency: 0.0000
Diversity: 478.08
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........((((((((...(((.(((((((((...(((((.(((((((........((......))((((((......))).))).......((((((((.......((((((....(((((((.(((......))).))))))).........(((((.....((((.(((.(((..((((..........)))).)))))).))))))))).(((((((((((..(((....)))...))))).))))))..(((..((((((((((.....(((((((........((((.....)))).......((((((((..(((...)))))))))))......((((......((((.....)))).....))))..................)))))))....)))))))))))))..(((....))).))))))..)))))))).))))))).)))))(((.((((........((((((..((((((..((((.((((.(((...((((...))))...))).)))).))))...)))..)))..))))))(((((((((((.((((........)))).))).....))))))))...((((.....))))...)))).)))..((..(((((((((((....(((((....(((((.(((.(((..(((((.....)))).......((((((((((((((......((((((....)))))).)))))).)).))))))..........(((...((((......)))).))))..))).))))))))(((((.(.(((...((((((....))))))...))).).))))).((((((((..((.....))..))))))))((((......)))).(((((((((....))))))....)))(((((......))))))))))....)))))).)))))..))...(((((((((((....(((((.((((((((...........(.(.(((((((..((((...((((((.((((((((......)))))...)))...))))))...))))....))))))).).)....(((((((((((......((((((((...........))))))))..((((((.(((..(((((.....)))))..))))))))).(((((.(............).)))))..)))))))))))..)))))))).))))))))))((((((.(((((((.((......)).)))))))....))))))....)))))).(((((....)))))..))))))))).)))(((..((......))..))).((((((..(((......))).)).))))..((((((((((((.(((.((.((.(........).)).))))).)).))))))).)))(((.((((((((....(((((((((.((((.(((...(((........))).....))).))))..)))))))))..)))))).)))))....(((((...........((((..(((((((.(((....(((..(((((..........)))))....)))....))).))).))))..))))..........)))))..))))))))..((((((.(((((((((((((...(((((((....((......))....)))).)))....)).)))))))..))))))))))......(((((.(((...(((...((....)).)))..))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,.....,,{{{,{((,{{,(((.{((((({{(..{(((((.(((((((...{(,,({(,.,...||,..|,.}|....}}.}))),......((((((((.......((((((....(((((((.(((......))).))))))).,,,{{...((((({....{(((.(((.(((..((((..........)))).)))))).))))))})).(((((((((((..(((....}})...))))).)))))).,||||.{(({((((((.....(((((((........{{{{,,..,}}}}...,.,.((((((((..(({...}))))))))))......{((({..,..((((,...,))}},,,,.}}},.......,,,........)))))))....))))))})))}}}..{{{....))}.)))))),.)))))))).))))))).)))))}{{,({{(........((((((..((((((..((((.((((.(((,{.((({...})))},.))).)))).))))...)))..}))..))))))(((((((((({.((((........)))).})).....))))))))...((((.....))))...)))).,|{,(((((,(({{{{{{{({..,(((((,...{,((({(((.,,,,..{(((.....}}},.,.....((((((((((((((...,,,(((({(..,.}}}))).|)))}}}}}.))))))}}}|.},}.,.,...,||{{......)}},.}}})}}},}}}}}}..})}})),}}}}}|{{{(((((.{..{{{|||||,.||||.,}},,..((((((((..{,.....}}..))))))))((((......)))){((,((((((....))))))...}))|(((((......)))))))}))))}}}))),,),)}))))))...{|||{|||||||||,(((((.((((((((...........,.{.(((((((..((((...{(((({.((({((((,,,...,)))).,})))...}))))}...))))....))))))).).,....(((((((((((...{{,(((({{{(..,........|}}|||||..((((((.(((..(((((.....)))))..))))))))).{||||,,..,,..,,)}....)))))}})))))))))))..)))))))).))))),}|}|||||..}}})))|||||{((({({{(({{..|||||,,,}))},,.{{{{......|}},..,||.((({(({|,|||,.{{|{(((,,{{{,{.....,,|,.,,}}})}}}}}}....}))..,.....,{{(({{{(((((((.(((.((.((.(........).)).))))).)).))))))),))}(((.((((((((....{((((((({.((((.(({.,..(((.{,...}).)))..,))).))))..,)))))))}..)))))).)))))..}})))}}}...}}}..,{((((..((({{{{,(({....{((..((({{...,...,..}))))....)))..,,))).))).}})),.}}}}.|({{{{{.,{{|,|{..|||,,..}}|,,||..||||,|||,|||,.,}|||||||.....,.}}},,)),.,,|}||{}||{{|,||.}}|||||{{},,,}))))),,.,..|||{|}|||},.|||.,}||.,}}))})))..}}}.}})))
Back