Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0036900
Sequence Length
591 nt
GC Content
0.4247
AUCUGGAUAAUGUAGAGGGCAUUGCUGUGGACUGGAUUGGAAAUAAUCUUUACUGGACCAAUGAUGGCCAUAGGAAAACCAUUAAUGUGGCCAGGCUGGAAAAAGCUUCUCAGAGUCGGAAGACUCUUUUAGAGGGUGAAAUGUCUCAUCCCAGAGGAAUUGUGGUGGAUCCAGUUAAUGGUUGGAUGUAUUGGACAGACUGGGAGGAAGAUGAAAUAGAUGACAGCGUGGGAAGGAUUGAGAAGGCCUGGAUGGAUGGAUUCAAUCGGCAGAUUUUUGUGACUUCAAAGAUGCUGUGGCCAAACGGUUUAACUCUGGACUUUCACACCAACACAUUAUACUGGUGUGAUGCCUAUUACGAUCAUAUUGAAAAAGUAUUUUUGAAUGGGACUCACAGGAAGAUUGUUUACAGUGGGAGAGAGUUGAACCACCCUUUCGGACUGUCGCAUCAUGGAAAUUAUGUGUUCUGGACUGAUUAUAUGAAUGGUUCCAUUUUUCAACUAGAUUUGAUAACAAGUGAGGUGACAUUGCUGAGGCAUGAAAGACCACCCCUAUUUGGGCUUCAGAUUUAUGAUCCACGAAAGCAACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-164.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -174.81
Frequency: 0.0000
Diversity: 120.96
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((..(((((.....)))))(((((.(((((((((.(..((((((((..((((........((((((((..((.....))..))))))))((((......)))).(((((((((....))))))....)))(((((......)))))))))))).)))))..).))))))))).)))))..(((((....(((((.((((((((...........(.(.(((((((..((((...((((((.((((((((......)))))...)))...))))))...))))....))))))).).)....(((((((((((......((((((((...........))))))))..((((((.(((..(((((.....)))))..))))))))).(((((.(............).)))))..)))))))))))..)))))))).))))))))))((((((.(((((((.((......)).)))))))....)))))).......))))))((........(((.(((.(.....(((((((..(((((.......)).)))..))))))).....).))))))..........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((((,..,,{,|}}}..,,,||(((((,(((((((((.(..((((((((,.((((.,,.....((((((((..{,.....}}..))))))))((((......)))){((,((((((....))))))...,))|(((((......)))))))))})),,))))..).)))))))),.}}}}},.(((((....(((((.((((((((...........,.{.(((((((..((((...{(((((.((({(({(,,,...,)))).,})))...)))))}...))))....))))))).}.,....(((((((((((...{{,(((({{{(..,........|}}|||||..((((((.(((..(((((.....)))))..))))))))).{||||,,..,,..,,)}....)))))}})))))))))))..)))))))).))))))))))((((((.(((((((.((......)).)))))))....))))))...,|,,}|}|||(((....|||||{.{{{,,,,...({{{{{{.,{,,,,..,,.,.},.)))},)}))))),,..,},})))))...,}}},...,
Back