Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0037400
Sequence Length
1765 nt
GC Content
0.4102
GUCCCGAGGAGGUAGAAAUCAAGUGCCCCUUGAAUCACAUUGCUUGCCUUGGUACCAACAAAUGUGUUCAUUUAUCCCAGCUGUGCAAUGGUGUCUUGGACUGCCCAGAUGGGUAUGACGAAGGAGUACAUUGUCAGGAACUGUUAUCCAAUUGCCAACAGCUGAAUUGUCAGUAUAAAUGUACAAUGGUCAGAAAUAGUACAAGAUGUUACUGUGAGGAUGGAUUCGAAAUAACAGAAGAUGGGAGAAGCUGUAAAGAUCAAGAUGAAUGUGCUGUUUAUGGUACAUGCAGCCAGACCUGCAGAAACACACAUGGAUCCUACACUUGCAGUUGUGUGGAAGGCUACCUAAUGCAGCCAGACAACAGAUCUUGCAAGGCUAAAAUUGAACCUACAGAUAGACCACCUAUACUAUUAAUUGCAAAUUUUGAAACAAUUGAGGUUUUCUAUCUUAAUGGAAGUAAAAUGGCAACUCUAAGCUCAGUCAAUGGAAAUGAAAUUCAUACUCUGGAUUUUAUUUAUAAUGAAGAUAUGAUUUGUUGGAUUGAAUCAAGAGAAUCUUCAAAUCAACUCAAAUGUAUCCAGAUAACAAAAGCAGGAGGAUUAACAGAUGAAUGGACAAUCAAUAUUCUUCAAUCCUUCCACAAUGUGCAACAAAUGGCGAUUGACUGGCUCACUCGAAAUCUCUAUUUUGUGGACCAUGUCGGUGACCGGAUCUUUGUUUGUAAUUCCAACGGUUCUGUAUGUGUCACCCUGAUUGAUCUGGAGCUUCACAAUCCUAAAGCAAUAGCAGUAGAUCCAAUAGCAGGAAAACUUUUCUUUACUGACUACGGGAAUGUCGCCAAAGUGGAGAGAUGUGACAUGGAUGGGAUGAACCGAACAAGGAUAAUUGAUUCAAAGACAGAGCAGCCAGCUGCACUGGCACUAGACCUAGUCAACAAAUUGGUUUACUGGGUAGAUCUUUACUUGGACUAUGUGGGAGUAGUGGACUAUCAAGGAAAAAAUAGACACACUGUCAUUCAAGGCAGACAAGUUAGACAUCUUUAUGGUAUAACUGUGUUUGAAGAUUAUUUGUAUGCAACCAAUUCUGAUAACUACAAUAUCGUAAGGAUAAACCGAUUUAAUGGGACUGAUAUUCACUCAUUAAUUAAAAUUGAGAAUGCUUGGGGAAUCCGAAUUUAUCAAAAAAGAACUCAACCAACAGUCAGAAGCCAUGCAUGUGAAGUCGAUCCAUAUGGAAUGCCAGGGGGCUGUUCACACAUCUGUCUACUCAGCAGCAGUUACAAAACUCGGACUUGUCGCUGCAGGACUGGCUUCAACUUGGGAAGUGAUGGCAGGUCAUGCAAAAGACCAAAGAAUGAGUUGUUCCUCUUUUAUGGGAAAGGACGCCCAGGAAUUGUUAGAGGAAUGGACUUGAAUACCAAGAUAGCUGAUGAAUACAUGAUCCCCAUAGAAAAUCUGGUAAACCCUCGUGCUUUAGACUUUCACGCAGAAACCAAUUACAUCUACUUUGCUGACACCACCAGUUUCCUAAUUGGCCGGCAGAAGAUAGAUGGCACAGAGAGAGAAACCAUCCUGAAAGAUGAUCUGGAUAAUGUAGAGGGCAUUGCUGUGGACUGGAUUGGAAAUAAUCUUUACUGGACCAAUGAUGGCCAUAGGAAAACCAUUAAUGUGGCCAGGCUGGAAAAAGCUUCUCAGAGUCGGAAGACUCUUUUAGAGGGUGAAAUGUCUCAUCCCAGAGGAAUUGUGGUGGAUCCAGUUAAUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-466.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -496.37
Frequency: 0.0000
Diversity: 555.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.((((.........))))))))).((((((((.(((.........(((.(...(((.((((((((((((((((((....(((((..(((((.(((((....)))))((((((.(.....).))))))..........))))).))))))))))))......(((((..(.(((((.((........)).)))))...)..)))))...))))))))..)))...)))...).)))((((((((.............((.(((((((......))))))).)).((((.((((......((((.((((.(((((..(((((((((((.(((...((........))..))).)))))......)))))).............((((((..(..((..(((((.......((((..((((((.....((((((((.....)))))))).....)))))).))))............(((.((.((((((((((((.....)))))))))))).)).))).((..(((((((..(((((..........))))).)))))))..)).....(((((((((....((((((.((((.(((.(((((..((((...((((.(((((.((((((...(((...(((...)))..))).))))))((((.((((.(((....(((((...))))).....)))))))))))(((((((((((...(((.....(((((((..((((((((((((((((((((..(((..................)))..))))).))))..))))......((((((((((.....(((.....)))....)))))))))).)))))))..)))))))))).)))))))))))...........(((((((.....(((((.(.((((((....(((((((.(((......))).))))))).........(((((.....((((.(((.(((..((((..........)))).)))))).))))))))).(((((((((((..(((....)))...))))).))))))..(((..((((((((((.....(((((((........((((.....)))).......((((((((..(((...)))))))))))......((((......((((.....)))).....))))..................)))))))....)))))))))))))..(((....))).))))))).)))))........)))))))..(((((...........((((((..((((((..((((.((((.(((...((((...))))...))).)))).))))...)))..)))..))))))(((((((((((.((((........)))).))).....))))))))...((((.....))))...))))).)))))..))))..)))).....))))).)))..)))).))))))...(((((..((............((((((((((((((......((((((....)))))).)))))).)).))))))))...)))))......((((......))))))))))))).)))))..))..)..))))))...((((((....))))))....(((.(((....)))))))))))...))))...))))..))))))))....))))))))((((((....))))))......((((((......))))))..))).)).))))))))))(((.....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((.((((.........))))))))).{((((({{,{{|.|,||||,,(((.,..,(((,((((((((((((((((((,{,,((({({{,,{|||(((((....)))))((((((.(.....).)))))),,,.......})),}}})),,)))))))..,,,,(({{{....||{||.||........||,|||}}...},.}))))}.,|}}}}}}},,},,...})}.....}}}({(({((({...{{{{...,,({.(((((((,.....))))))}{{{{((,,.(((({{....{{{{.(((({((({{,,({(((((((((.(((...((........))..))).)))))......)))}}}{{{.....,...{({,.((((((,{{{{((,,....,,,,((((..{{{{{{...|,||||||||..,,,))))}}}}},...}}}}}),))},.,,,,,{{{{,{((,.{{,((((((((((((.....))))))))))))....|||,({,.(((((((..(({((..........))))),)))}))}.{||...,,{{(((({{{....,{{{{{,((((,((..{{(({,{((({...,{|{.|||||.||||||||||{{,,.{{(,{.,....|||.}|||||((((.((((.(((.,,.{{{{|...))))),,,.,)))))}})))}(((((((((((..,((({,...{{(((,,..((((((((((({((((((((..(((..................)))..)))))},))}..))))......((((((((((.....{({.....))}....)))))))))).)))))))},))))))),,}.)))))))))))...,...,,..,||{{||||.({((({{.{.|||||,....(((((((.(((......))).))))))).,.,{,...,||||},,.,||||,|||.(((,.(({{..........}}}}.}}),||{||,,,,,,)}|||{{,{{{{{..{(({,,,|||{{,|}}}|{||||}}.|{{{,.,{{{,,{{||,....||||{{{,,,.,},,||||}}},})))...,,,,.{(((((((..{({...})})))))))}......|||||.,...{((({,..,}}},,|||.|||........,|,,.......))}}}})|||.))))}}}}}}}}}},|||,,.})},.})}}))).)))))}.....,,)))))))..,||||.|{{{{,....{(((((..{({(((..((((.((({,{({||.{(({...}))),,.))).}))).)))}...)))..}})..))))))(((((((((({.((((........)))).})).....))))))))...((((.....)))).,,))))}}))))},,}}}}||)))}.....}))))..,,..||||.|||}}}...{((((.....}},,.......((((((((((((((......((((((....)))))).)))))))}).)))))),,.,.},}}}.,....{{||,,....)}))})))))))),.}),)}}})||}|,}}}}||,,,|{((({,...}}))))...}||{,{||,...{||||{{|,,|...,,,),..))))))))||||}}....))))}||}((((((....))))))....|,((((((......))))))),))).},,))))))))))(((.....)))
Back