Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0037700
Sequence Length
776 nt
GC Content
0.4162
AAAACUUUUCUUUACUGACUACGGGAAUGUCGCCAAAGUGGAGAGAUGUGACAUGGAUGGGAUGAACCGAACAAGGAUAAUUGAUUCAAAGACAGAGCAGCCAGCUGCACUGGCACUAGACCUAGUCAACAAAUUGGUUUACUGGGUAGAUCUUUACUUGGACUAUGUGGGAGUAGUGGACUAUCAAGGAAAAAAUAGACACACUGUCAUUCAAGGCAGACAAGUUAGACAUCUUUAUGGUAUAACUGUGUUUGAAGAUUAUUUGUAUGCAACCAAUUCUGAUAACUACAAUAUCGUAAGGAUAAACCGAUUUAAUGGGACUGAUAUUCACUCAUUAAUUAAAAUUGAGAAUGCUUGGGGAAUCCGAAUUUAUCAAAAAAGAACUCAACCAACAGUCAGAAGCCAUGCAUGUGAAGUCGAUCCAUAUGGAAUGCCAGGGGGCUGUUCACACAUCUGUCUACUCAGCAGCAGUUACAAAACUCGGACUUGUCGCUGCAGGACUGGCUUCAACUUGGGAAGUGAUGGCAGGUCAUGCAAAAGACCAAAGAAUGAGUUGUUCCUCUUUUAUGGGAAAGGACGCCCAGGAAUUGUUAGAGGAAUGGACUUGAAUACCAAGAUAGCUGAUGAAUACAUGAUCCCCAUAGAAAAUCUGGUAAACCCUCGUGCUUUAGACUUUCACGCAGAAACCAAUUACAUCUACUUUGCUGACACCACCAGUUUCCUAAUUGGCCGGCAGAAGAUAGAUGGCACAGAGAGAGAAACCAUCCUGAAAGAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-185.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -200.68
Frequency: 0.0000
Diversity: 163.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((((.(((.....((((((((.......(((((.(((((((........((......))((((((......))).))).......((((((((.......((((((....(((((((.(((......))).))))))).........(((((.....((((.(((.(((..((((..........)))).)))))).))))))))).(((((((((((..(((....)))...))))).))))))..(((..((((((((((.....(((((((........((((.....)))).......((((((((..(((...)))))))))))......((((......((((.....)))).....))))..................)))))))....)))))))))))))..(((....))).))))))..)))))))).))))))).)))))(((.((((........((((((..((((((..((((.((((.(((...((((...))))...))).)))).))))...)))..)))..))))))(((((((((((.((((........)))).))).....))))))))...((((.....))))...)))).)))..))))..))))....((((.(((((...((....))...))))).))))................((((((((((((((......((((((....)))))).)))))).)).))))))...)))))))))))..((((......))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((((((.(((.{{,.(((,,,((,,,...{(((((.(((((((...{(,,({(,.,...||,..,,.}|....}}.}))),......((((((((..,....((((((....(((((((.(((......))).))))))).,,,{{...((((({....{(((.(((.(((..((((..........)))).)))))).))))))))).(((((((((((..(((....}})...))))).)))))).,||||.{(({((((((.....(((((((........{{{{,,..,}}}}...,.,.((((((((..(({...}))))))))))......{((({.....((((,...,))}},,},.}}},.......,,,........)))))))....))))))})))}}}..{((....))}.)))))),.)))))))).))))))).)))))}{{,{{{(,,,.....((((((..((((((..((((.((((.((({{.((({...}))),,.))).)))).))))...)))..}))..))))))(((((((((({.((((........)))).})).....))))))))...((((.....)))).,.)))).}}....}}},,)})),.}}|,...{{((({.....,{{||{....,,,.,}}),}}.,}..,,,,....((((((((((((((......((((((....)))))).)))))))}).))))))...)))))))))))..((((......))))
Back