Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_LRP1B_0038900

Sequence Length

550 nt

GC Content

0.3818

AUCAAGAUGAAUGUGCUGUUUAUGGUACAUGCAGCCAGACCUGCAGAAACACACAUGGAUCCUACACUUGCAGUUGUGUGGAAGGCUACCUAAUGCAGCCAGACAACAGAUCUUGCAAGGCUAAAAUUGAACCUACAGAUAGACCACCUAUACUAUUAAUUGCAAAUUUUGAAACAAUUGAGGUUUUCUAUCUUAAUGGAAGUAAAAUGGCAACUCUAAGCUCAGUCAAUGGAAAUGAAAUUCAUACUCUGGAUUUUAUUUAUAAUGAAGAUAUGAUUUGUUGGAUUGAAUCAAGAGAAUCUUCAAAUCAACUCAAAUGUAUCCAGAUAACAAAAGCAGGAGGAUUAACAGAUGAAUGGACAAUCAAUAUUCUUCAAUCCUUCCACAAUGUGCAACAAAUGGCGAUUGACUGGCUCACUCGAAAUCUCUAUUUUGUGGACCAUGUCGGUGACCGGAUCUUUGUUUGUAAUUCCAACGGUUCUGUAUGUGUCACCCUGAUUGAUCUGGAGCUUCACAAUCCUAAAGCAAUAGCAGUAGAUCCAAUAGCAGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-127.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -135.90

Frequency: 0.0000

Diversity: 139.32

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((...))).(.(((((((..((((((((((((...((((....((((((.(((.((((((....(((((((((((.(((...((........))..))).)))))......))))))((((........((...(((((((..((((.......((((((............))))))))))..)))))))....))........)))).......(((.((((((((.(((((((((((((.....))))))))))))........((..(((((((..(((((..........))))).)))))))..))........(((..........(((((((((((....((.(((((.........))))).)))))))))).....)))........)))).)))))))))))(((.(((....(((((...))))).....))))))...)))))).))).)))..)))....))))))))))))))))........((((((..(((..................)))..)))))).))))))).)

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((,...|)).(.(((((({..,({(((((((((...((((,,..(({(((.(((.((((((....(((((((((((.(((...((........))..))).)))))......))))))((({........((...(((((((..((({......,((((((,,....,}}...))))))))))..)))))))....))........)))).......,((.((((((((.({{((((((((((.....|))))))))}}}....,|,.({,.(((((((..(((((..........))))).))))))).,}},,,,},}}}||,}........,,,((((((((...,((.(({((......,..)}})).}}))))))))|....,|}},......,,,).))))))))))|(((.(((....(((((...))))).....))))))}..)))))).))).)))..}))....)))))))))))))))}.,..,...((((((..(((..................)))..)))))).))))))).)