Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0040900
Sequence Length
2590 nt
GC Content
0.3811
AUUUAAUUCAAUUAUCAAGUACAAUAAUUCCCUCUUACUUCAUAUCUUGACUAUUAAGCCUUGAUGUUGAGGAAUUGGGGGAAUGCUUCCACCUGAAUCUCUUCACAGACUUUCUAUAAUAUCAAGAAUCCCUUGAAAGAUAGAAAAAUAGCUUGGCAUACUGAGACAUAAAGAGUUUUUCAAACAUGAAACACAGCAAGAAAAAAGAGACAGAUGGAGAGUCAGGAAGAGAAGAUGAUAUCAUUAUCAACAAGUAUAUAGCCAUAAAUGUCAUGUUUGAUCUGUUGAGAAAAGACAUGUACGUAAAGGUAAGGAUGAACUUAAAAGUUAUAGAUAAAAGAUGACCAAAAAUGGAGAAUGCAUAUGUGUGUGUGCAUGUGUGUAUAAUUUUUUGUGAAACUUCAUUUUUCAUCAGUCUUCUUAUAACUAUUUGUUAAACAAAAAAUGUAUCUGUACUUAAAAGUAUAUUUCUAAGUUUUCUAAAAUAUGUUAGUGGCUUAAACUUAAAUCUACAAUAGAUUUAAAGACAGAAAAACAUCCAAGACAACAUUCUUAAAAAUUUUGAAGUGAAGAUCUAUUGACUUAUGGUUUUGGUUUGUGGUUGUCUUAUUUUAUUCUUUACAUCUCCUCUUCUUUAUUCAGUAAAUUUUUCUGAAAUUCAACCAUUUUCCAAAUUUACCUUAAGGUUAGUACUAUGGUGGAUUCAUACAUGGAAAGGUAAUUAUAAUAAUCAAAGAUAACAUUUAAUGAGUGGUGUAUGCCCAACUCAUUUGCCUUUUGUUAUAACUGUAUCUGACAGGUACUCUUGUUAUCUUUAUUUUGUAGAUGAAAAAGUUGGGUCACUGAGUCACAGUAAGAUUGUAUCACUUUGCAAAAGUCAUUCAUUCAUAAAAAACUGUUUCCUGACCAUCUAUGUGUCAGGCCUUAUUUAGGCACUGUUUAAUAUAGUCAUAAACAAAACAAAAUCCCUGUCUUCAGAAAUGUUACAUUCUGGUAGCAUGACGUCUAUCCUCAACAACCAAGAGAGAGACUCAAAGAUGAAAGACAUUACAUUCAAUUGGGAAAAACUGAGGAAAGUCUUCAGAAGAGAAUGGUAUUUAAUGUGGAUCUUAAAAAUGAGAUCAUUGGUACGUUCAGAGAUAGAGAAAGAGUCUGCCUGGGAGAGAGAAUAUUAUAAGCAAUAGCAGACAUGGCAUAAAAGUGCAUAAGGCCCUCUCUAGCAAAAGACACUUAAUCUUAAGCUUAGAAUCAAUGACAAGAAGUAUGAGAUAAAGUUUGAAAGAUUCUAAUAGUAAGAUAUGUCUGUUCUGUAUUAUUGUUAGCCCUUUUUGAGUAGGUUAAAUGUCAUUUUCAAAAGACCUAUUUAAUUGAACUAAAAUUUAUUUUAAUACAUAUGAAAGAGGUAAAUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGAGUCUCGCUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCGGGAUCUCGGCUCACUGCAAGCUCCGCCUCCCGGGUUCACGCCAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGACUACAGGCGCCCGCCACUACGCCCGGCUAAUUUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCGUUUUAGCCGGGAUGGUCUCGAUCUCCUGACCUCGUGAUCCGCCCACCUCGGGCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCGCCCGGCCGAAAGAGGUAAAUUUUUAAAGUGUAUUUCUUUGAGUGUUAAAAAAUUAAAACUCCAGAAGCGAUAUCAGCAAGAUGGCAAAAUAGGAAGUUGCAGCCCUUGUUCCUCCACAAAAACAUCACUUUAACAACAGUGUAUGAACCAAAGUACCAUUACGAAAUGCUAAAAUCCAGUUAUGAGGUUGUGGUAUUCCAGGAGAGCACAAAGCCAAGAACAGCUACGUUGAAAGGCAUAAGAAGAGUGGUUUAAUUUUACCCAUGUUGGCCCUUCCUUCAAGCUGGCACAACCCAACAUCAGGGUAGAACACUCCAAUUUACUAUCUUUCAAGGGAAAAAGAAGAGUGCACCAAGCACCCAACAUUCUGGUUUUUCUGAGGACUACCUGAGGGACUAGUUUCUGUUUCACCCCAUGAGCACUGAUGAAACAAGUAUAGUGUGUAUUUCUGGGGGCCACUUAGAAACAAGAAGAGUAGCUGGAAGCUUGGUAUGGCCAACAUGGCUGGGCAAAAUCCAGCUAAUGAGCACAACUUGAGAAUUCUCCUUUAGAAGGAAAGGAGGGAGUGGAGUAUGGAUGUAAUGUUCUAUCUUCUUAGAGGGCUGUGCAAGUGACCAGAAUAUGUCUUACCUGCCUUGGUACACUGACAAUGUGUUGGCAUACUUCAGAUGUUUCACGGCUGACAAGAACAAGGAAGAGCAGAGUGGCUUGCUGACACAGACUGACAUCAGGGAGAGCAAAAACUUACGAGCUUUUGGUAAAGUAGCUGCCAAUUCUUUCUAACUGAAGAAUUGCAUUCACAGGUCCAGAAAAGUAUUAUUUCUCCAAAAGAUUUCAGAGGCUUCCAGAAUCUCUAGCUGGGCUGACGGUGAAGGUCUUUCCCUGUACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-686.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -735.74
Frequency: 0.0000
Diversity: 583.06
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...........))(..((((....((((((((...(((((((((..(.((....)).)..)))).)))))....))))))))((((.(.((((((((((..(((....(((((((....(((((.....)))))...))))))).....((((((.((((((((........((.(((((....))))).)).(((((((((....((((.(((((..(((((((((((....(((((....)))))...........(((....(((((((((((..(((....)))..))))))).))))...)))..((((((.(((...(((((((((..(..(((((...(((((((((.((((((((((((....))))))))))))..((((....))))))))))))))))))..)..)).))))))).(((((...))))).........((((((....))))))...........(((........((((((((((((.(((..((((((((.((((.((((((..((((.......((((((((.......((((((...((((.((......)).))))..))))))........)))))))).))))..)))))).))))...........(((((.........))))).....(((..((((((((((((((....(((....)))..))))))))......))))))))).............((((((((((...((((((((((....)))..))))))).................((((((...))))))...))))))))))...))))))))....))))))))))))))).........)))(((((......))))))))))))))............)).)))))))))..))))).))))..((((.....))))(((((.....)))))...................(((....)))..(((((((......)))))))((.((((...(((.........)))..))))))...((((.....))))........((((((....((((((........(((..(((((((((....(((((((((((((....))))))).....))))))....(((((((..(((.((((.((.((((((((((.......((((((((((((((.(((((..(((((......((........))......))))).((((((...((((((((.....((((...(((...)))...))))...))))))))...))))))))))))).)))))..)))))))........(((((((((((...((.......))...))))))))))).......((((((((((((.............))))))))))))...)))))))))).)).)))).)))..)))))))((((((((.(((((((((((((.(.....).)).))))))..)))))))))...))))....))))))))))))))))))..)))))).((((((((..((..(((....)))..))..)))))))).)))))))))..))))))))(((((((.......))))))).))))))..((((.(((((....))..))).)))).((((.....)))).......)))..)))))).)))).).))))(((((((((((((....((((((.............(((((.((((((((.((((....)))).))))..)))).)))))..((......))......((((((((((((((((((((.(((.......(((((((........)))).)))......((((((((.((.....(((.......)))......)).))))))))...))))))).....((((((..(((((((.((((((((..((((..(((((......(((((((((((((((.....((........))......)))))))..)))))))))))))...))))...)))))))).............((((.....))))(((......)))..(((((.(((....))).)))))((.(((((((.....(((((.((((((((((.......)).)))))).....)))))))......))))))).))....)))))))....)))))).((((((...((((((((.....)))))))).)).)).))((((......((((((((......))))))))))))((((.(((((........)))))))))...)))))))))((((((.((.......((((((.((((((.(((.(((((((..((((....))))...)))).))).))).)))...........))))))).))..)).)))))).........((((.(((..((((((.....((((......((((((....((...(((.((((((((......)))))))))))...))....)))))))))).....))))))....))).)))).)))))))...)))))).))))))).).))))).(((......)))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((...........))(..(((({...((((((((...(((((((((..(.{{....)).}..))))},)))),,..))))))}}((((.(,(((({{{(((,,({{....{((((((....(((((.....))))),,.))))))}.....((((((.{{((((((.,......((.(((({....})))).}}.{{{{{{{{,....((((.(((((..(((((((({{{..(,(((({....))))}...........(((....(((((((((((..(((....)))..))))))).))))...)))..((((({{(({...(((((((((..,..(((((..,(((((((((.((((((((((((....))))))))))))..,{{,....}}},))))))))))))))..}..))}})))))).{((({...}))}},,,{{{,..({{{{{....}))))),,,.,,,|}|,,||........(((((((((({{{(((..((((((({.((((.((((((..((({.......(((((((({{.....((((({.,.((((.((......)).)))),.}))))).....}}.}))))))).))))..)))))).))))...........(((((.,.......))))).....(((..((((((((((((((....({{....}))..))))))))......)))))))))..........,..((((((((((...(((((((((,....,})},})))))){(({,..,{,{{,....|||,,|}},)))))....))))))))))...})))))))....)))))))))))))))....,,,,..||{((((......)))}}})))}}}}),,},........}}.)))))))))..))))).))))..((((.....)))).|((({{,..,,,,,..}}}}},...........{(({{,,||}..{((((((......))))))}((.((((.{,(((.........))),.))))})...,,||||,|}}},,.,.,,,..{(((((....((((((........(((..(((((((((....,,,((((((((((....)))))))..,,,,,,,,),},.(((((((..(((.((((.((.((((((((((.......((((((((((((((.(((((,.(((((......((........))......))))).{(((((...((((((((.....((({...{{{...}}}...))))...))))))))...))))))))))))),}))))..)))))))........(((((((((((...((.......))...)))))))))))..,....((((((((((((.............)))))))))))}...)))))))))).)).)))).)))..)))))))((((((((.(((((((((((((.(,...,).)).))))))..}))))))))...)))).,,,))))))))))))))))))..)))))).((((((((..{{..(((....)))..}}..)))))))).,})))))))..}}}}}}}}(((((((.......))))))).))||||,.{{{{.|{{((,,,,|}..|||,|}|}.((((.....)))){{||,..}}}.,))))}}.}}||,|,|}}}{{{||||||{|((..,,{((({{..,,,....,|||{|||||||||((((.((({....}))).))))..}}}|,,}}},,.{{,,|.,,||......{{{{{||{{{{{{|||||{,{{{{.......(((((((........)))).)))......,{{{{{{{,||,.,(((((,..,,,,|},.,),.,)),,))))))).,,))))}}}.....(({{{{..((((({(.{({{{{{{..,,{,..(((((......(((((((((((((((.....((........))......)))))))..)))))))))))))...})).,,.)))))))),},,....,.,{.((((.....)))){|,....,,|||{{{{(((.(((....))).)))))||,(((((((.....(((((.(((((((({(.......,).)))))).....))})))),.....))))))).,}.,|,})})})),,.,)}}}}}.{{{{|{.,,((((((({.....}))))))).)).}}.},,{{{.,...,((((((((......))))))))},,}{|||,{({{{.....,,.))))))})),,.}))}}||||({,((({((({.....{(((((.((((((.(((.(((((((..{(((....))))...)))).))).))).)))...........))))))).)}..,)})}))))}..}}}},.((((.(((..((((((..,,.((((......((((((....({.,.(({{((((((((,.....)))))))))))...})....)))))))))).,,..))))))....))).)))).}))))))}}.,,}))}.))))))).}.})))).|||,....})))))))..)
Back