Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0042000
Sequence Length
2926 nt
GC Content
0.4040
GGGAAAGCAUGCCAAGCAGGAAGAUGAGUUCUCAAUCUGGUCCAAGGACGUAACUUUUAGCUUGGCUUUCAAGCUAAUGACAGCUGAUGACAGGCUUUGGAGGUAGGGUUUCACUAGGGACACGUCCCUAUCUGCCUAGACAUUUAGCUGCCUCCUGCUGCUCUCACCAAGUGACUGUUUUCUUCUAUUUCCACAUUUAAGAAAAUCAGAAAUGUUUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGACGGAGUCUCGCUCUGUCGCCCAGGCCAGACUGCGGACUGCAGUGGCGCAAUCUCGGCUCACUGCAAGCUCCGCUUCCCGGGUUCACGCCAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGACUACAGGCGCCCGCCACUGCGCCCGGCUAAUUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCUUGUUAGCCAGGAUGGUCUCAAUCUCCUGACCUCAUGAUCCACCCGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCGUGAGCCACCGCGCCCGGCCCCUUCUUAAGAAAAAAAGUAUUCAGUAUACCUCACUUGUGACAGAUAUAAAAACUAGAAGAAUAAACACAUUUCUUGCUAACAACAACAAAGUAGUAUCAUUCAUUCAUACAUAUAUAUGUCGAGGGGGUACUUUUGAGUAAUGAAAUGAAAUGUUUUCCUGGUAGAAAUACACUGAAGCUGUUUAUCUUUCAUGGGUCCAGGUUUUUUCUAUGCUUUGUUUGUUUUUGUAAAAGCCCUUAAAGGUUUCAUGCCUUCCCUGGAAUGUAAAUAUUCUUCACCCUCUGAAAUCCCUAAUUAUCCAUUUGCAGAAAUAUCAUUAUCUAGUCCUGUUAUGUUGUCUCUUCUCUAGAGUUUUGUUUGUACAAUAGCCAAAUUUUCUUAUUUCCCAAAUUUUGGCAGAAGUUAACUUCAGAAAACUUGUCCUGAAUUGACAUUGUACAUUUCUACAUACUACCAACUUUCCAUUUGUAGAAAUAAGGGAGACUCUAUUACUAGGAUUUCAAAGGAUUUUCCUAUUAUACAUUGUGAAAAUAAAAUGACCUUGCCCAUCAGACAAGUUGCUUUAUUUAAAAAGUUUUUCCUUCAAUGCUUGAAUACACUCCAGAGUACCAAGGAUUCUUUCUAUUUGUAACAACAGUUGCUAAUUAUGUGAGUAAAACCUAGAAUAGAAUCUCAAAAGUGGGCCUCCAUGGGAGGAAUAAAGGAAUUUCACAAGGUGCCAUUAAAAGUAUGGUAUCUCUUGCCUCAUUUUUAAUGAGUCUUUUCUCCACAACUCAUACCAGGGAAGUCCUAAGUCACAAGAUAUGUAGAUAUAUACUUUCAUAUCUUCUGUGUCCGGUGAUCAUUUUAGAUAAAUGAGAGUCUGGCUAUUUUCGGAAUGUCUGUGUCCCCCAACUUCAUAUAUUGAAACCUAAUCACCAAGAUACCAUCAUCAUAUGGGGUCACAGGGAGAUAAUAAAGUCAUAAGGGUGGUGCCUUCAUGAAUGGGAUUAGUGCCCUCAUAAAAGAGAACCCAGAGCUAACCCCUUAUACCAUGUGAAGACACACCAAGACAGUGCCACCUAUGAAACCAAAAUGCAGGUCCUUACCAGACAUCAAAUCUGUUGGUAUCUUGAUCUUGGACUUCCCAGUCUCCAGAACUGUGAGAAAUAAAUUUCUGUCACGUAUAAGCUAUCUAGUUGAUAGUAUUUUGUUCUAGCAGCCUGAACAGACUAAGACAAGUCCCUGCCCUUGGAAAAUUUCCAAAUGAAAUGCAGGAAAGCCAUAUAAACAAUAAGUAUGGAAAAAUGGAGUCAACGAGUGGUUGGGAGAAAGAGAGCAACACAGUCAAUGUUGGUGCAGAGGAUGAGGAUGUGGGGUUGAGGGGAGUGGUGGGGCAUCAAAGAAGUCUUUCAGGAGAAAGUUGAGAAAGUUGCAACCAAAUUGUUACUGAGGGAUGGAAUUCCAGGUCACGUGAUUUGAAAGUAAGACUUUCAUAAUCCUGCAUAGAUUCUGAACAAUUGGGCCACGAGAAGAUUUUGGACUAUGUAUUUAUUUUCAAACAUCUUUUUUCCCUGUCAGUACUGGAACUGGUGUAGAGCUGGCUAAAUAACAGCUGGCUAUUGUGUCCCAAAUGCUCCUAUAGAAAAAUUACCAAAAGGAAAAUACAAACUACAUAGUCAGUAUUUUUUAUAGGCUUAAUCAUACACAUAAAACCAUGGUCCACCUUUAAAAUUAAAGCCUGUCGACAUUUGUGUGGCAUAAAUUGAGAACUAAAUUUAGGUCUGUCUGCCCAAAUUGCUUCAUAUCAACUGCCUCAUACAUAAACACACAUGGAGACACACAGACACACACACACACACACACACACACACCACUCUGCAGUUGUCUUCAGUGAUCUUACAAUUUUCUGCCCGAGGAAAACUUCAAUUAAAAUAUGUUUCUAAUUGACCUCUGCUAUAAGCACAACUGUAUCACCUGGGAGUGGGGACACAAACACAUAUUAGCUUUUUUAACAUUUUAAUCGAUUUUUUUUUUCCUAUGGCCUGGUCAGCACUUGGCCCAGAUCAGAGGCCUGGGAAAAAAAAAAAAACAAACAAACAACAACAAAAAAAAACCAGUACUAAAACCAAGUCUUUGCUAGAAGGGAUAAUUUAAGGCAUCUGGAUCUUUCCUAAUGAGAGAAGCCUGGGUAGAAUGCUGUUCUUAGGGACAUGGGGAGUGCAAGAAGCUACAUGAAGCUCUGGAGUAAUUAGGAAGUAUGAGAGAGGGAAGUGAAAAUGGGCAAAGUGCAUCAGGAGAUACUACAGACGUACUUCUUGGAGCUGCCUCAGGUUAAUUCGCUAAUCGCCUUGGCCUGAGAGUAUCACCGCUAAAUUAUCUCAUAAUUACAGUCAGGAGGGCAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-776.35 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -833.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 799.08
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((..(((.((.....))...)))..)))))..(((((((....))).......((((((((.....))))))))...(((((((((.(((((.....((((((((((((....)))).....)))))))))))).).)).)))))))((((((((((((.((((.((((((((((((((((..((......))..))))))).)))...............................((((((((((((((.(((((((.((.(((.....))))).)))))(((((((((((((((.........)).)))))).)).)))))......((((((((((..........(((........)))((((((((......(((....)))......))))))))................((.(((.(((((..(((....(((((...((((.......)))).)))))....)))..).)))).))).)).(((((......))))).....)))))))))).(((....)))..)).))))))))))))))((((.....)))).)))))))))).))........(((((.((((((....(((((((((((........((((..((((((.(((...((((......))))..)))..))))))))))))))).))))))...)))))).)))))(((((.((.(((.(.((((.........)))).).)))))..)))))..(((((((((((((((.......(((((.....((((((((.((((((((((((((....((((((((((((((...((((((((((((((...((.............(((((.(((.....((((((((((((.(((((((((.((((((((((.((((((.(((..........))).))))))....(((((.(((((..........)))))))))))))))))(((((((((..................)))))))))))).)))))))))....(((((..((....))...))))).......((((....))))..((((((..(((.(((((((((((((....(((...((.((((((((...((((((.....((((((.....(((..(.(((((((((.(((((..(((((((((((.....((((((.....(((..........((((....))))(((((...))))).....)))...))))))(((((((((.......))))))))).....((((((...))))))..((((((((.((((.(((....(((((((((.(((...((((((((.(((((.....(((((((((((...(((((....)).)))...)))))..))))))(((((......)))))((((((((((((((..(((((((((..(((......(((.....)))....)))..)))))))))....))).))))......((((..(((((((((..((.((...(((.(((((...(((......)))........))))).)))........((((....)))).)).))..))))))))))))).(((........)))......)))))))...)))))...))))))))..)))))))))))).(.(((((....(((((((((....))))..))))).....((((((.....))))))....(((((.........)))))((((......))))(((((..((((((...)))))).......)))))....((((((.........)))))).....))))).).....)))))))))))))))..))))))........)))))..)))))))).)))))).)..))).....))))))...)))))).((((....)))).)))))))).))...)))...)))))....))))..)))))))..((....)))))))).(.(((((((((((...))))))).))))).(((.(((((.((.......(((....((((((((((((((..(((....))).)))))).)))))))).)))....((((((((..(((((((..((((((((.......)))))))).(((((((((...(((((((((((((((..........(((((((((..(((....)))..)))))))))((((((((......................................)))))))).......((((.((((.....((.(((...(((((.(((......))).)))))..))).)).....)))).))))........(((.(((((((((.((((..............................))))..).))))))))))).........)))))))...((((......(((((((.((.....)).)))))))))))((((...)))).............)))))))))))))))))....))))))).....................((((((((((((((.((((((((((.....)))))........)))))))))))))))))))...........................)))))))).....))))))).))).))))))))))))...)))...)))))((((((.....)))))).)).)))))))..........))))))))).)))).))).)))))..))))).....)))))........)))))))))))))))))....)))))))))))))))((.(((((((.(((.......))).))))))).))(((((((((((((...((.....)).)))))))))).))).........((((((...)))))).))).))))))).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..{((..(((((((.{((((.((.(((((............))))).)).))))}.)))))))...,,.}}}...,.(((((((((.{((((.....(((((((({{{{....}}}}.....)))))))))))).).))}}}))))).)))((.((((((((.(....((((((({(((((.,(({{{{..,,..||||||{..(((({,,,|||,,,||,,,,,...........,{{{{{{{{{{{{(({((((({,.||}|||}},{,|||||.}|}},(((((((((((((((.{.......)).))))))},).))))).....,((({{,{{||....{{{{((((,,,..{{{{|||((((((((......(((....)))..,}.,)))))))}...........,{{{{||{{{((({{(((,{.|,,,,|,,.{,{{(({.(((,...,||,,,})}},...,}},.,.}},||}},|}}.(((((......))))).....||||||,,,,..}}}}}},||,|||.}}}}}|}}}}}}}||(((((((..(({{((.{{{.,{{{{.{{{{{...,.((({((((,.....,,{|||||{||,....,...,,,}},|{{{,.,,,..,{|||,.}}}}}.)))}))))))))),}.)))))))|.}}}}|}||,}}}}||.}}}||{{{,,,|,.|||}|}||,|}},},,},,}}))}},}}|{|{{|||,},|({(((((((((((((,......{(((,,{{{{((((((({{(({((,((((((,,..,}||||{({((((({..,,(((({{{((((((,{{{(({..,,,,{.....,,{{{.,(({,...(((((((((({{.(((((((((.((((((((((.((((((.{{,..........}}}.))))))....(((((.(((((..........)))))))))))))))))(((((((((..................))))))))),}).))))))))}....(((((..{{....}}...))))}.......,{{{{{{{||,,..{{({((,,(({.{{{|,||||{{(({{,.{{{...{{,{{{{((((,..{(((((,,...{{{{{{...,,|{{,.|,(((((({({,(({(({,(,{{{|||||,.....{{{{{{.....{{||}},.}}}.,||{,....|}}}(((((...))))).....}}}...)))))){((((((((.......))))))))}..,},|{{|||,,,)))))),{{{((((((.((((.(({....(((((((((.(((...((((((((.{({{{.,.,{((((..(((((((((((.((((((((...{(,.((((.(((({{((.(((.......((((...))))......)))))))))).)))).})}....))))))......((((......)))))).))))))))))))..))))|(((,.(((((((((..((.((...(((.(((((,..(((......)))........))))).)))........{(((....)))}.}}.))..)))))))))))),.{{{........|||....|||,|,||....,}))),,,))))))))..)))))))))))).(.(((((...,{((((((({....,)))}.})))}.....((((((.....))))))....(((((.,{....,,)))))((((......))))(((((..((((({...})))))..,....)))))....((((((.........)))))).....))))).).....))))))))))))))))))))))),,,,...,))))}.)))))))))}))}}}).,}}))),.,,,))))})}.,))))))....|}},,)))).)))}|||},||{{{|||{{,|}}}}....}}}|,,|||||||,,{{....))}}})}}.{.(((((((((((...))))))).))))|{(((,{(,{{{{{.,,....({{....((((((((((((((..({{....))).)))))).)))))))),))),,,,|||{{{||,.|||||||,,((((((((.......)))))))).(((((((((...{(((((((,{{{,,,..........{((((((((..(((....)))..))))))))}(((((((({({......,,,......,,}},...........,}},)))))))).....,.(((({((((.....((,(({...(((((.(((......))).)))))..))).,,.....)))).,}}),,,.....(((.(((((((({.((((..............................))))..},})))))))))).........||||||}...((((......(((((((.((.....)).))))))))))){(({...))))....,},......)))))))})))))))))........}})}}}}}}}}},.,,,,......{(((((((((((((.(((((((((,(,...,}))}..,,,,..)))))))))))))))))))..,,,,,,,,,..........,,,,,,))}}}}}}.,}}}}.,))))}))),))))))))}}}}.,.)))}}.}}))){(((((.....)))))).))}))))),|..,,,.,||||}}})))},,))))}))),)}}}|{{|,,,,..}}})}}}},.......)))))}||||||}}}||..{||},,}}}}|||,,}}((.(((((((.(((.......))).))))))).)){{{((((((((((...((.....)).)))))))))).}}}.....,}}.,,{{,|,,,)))}},))))))))))))))))))
Back