Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_LRP1B_0043000
Sequence Length
456 nt
GC Content
0.3794
GUGGAAUUUUUUUAAGUCUUGGGAUUCGGCACUGAUACCAAAAAAAAAGACUUGAAAAAUGAAUGGAAUAUUAAUUAUUAUGAAAAACUGCUUCAACAAAAUGCAACUGCCAAACGUGCACUUACCGAAGUUAAUGGCAUUUUGAUUCAUGGGAAUCUAUGUACUCUCUAGGAAAGCACUGGAAAUCAGGAAUGUGCUACCUUAGCCAUGAUCUACUGACUAGCUGGAUGAUCUUUUGUAAGUGGACAUAACCAGCAUGGAACAUAACAUAAUUAAUUAAUUAACCAUUACAAUUUGAAAACUCAAGAGGGCAGGACUGCUUACUGGCUAGCAUGCUGUGGCUGUUGCAAAUUGUUGUGAGUGUUGUACGUCUGCUCUGUGUGUCCUGUCUCAUUGGUUCUCAUUCCACACUAGUUGUUAAUCAUUUCGAAAAUCACCCACAGAGUGAAGAAAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-99.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -107.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 144.59
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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